Search result

BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_028982
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:22246595-22247645[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence ATCAGCATCACTAAACTCGAACCCTAAAGAAAAACAAAAATGGCTGCCATAGCTTCTACTCTCTCTCTTTCTTCAACCAAACCTCAGAGACTTTTCGATTACTGCTGAGGACGCTATTGTGAGGTTGACCAGAGAGGTTGTTCCTGGTATGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGG
Tissues aerial
Exon boundary No-No
Splicing signals CC-TG
circRNA sequence NA
Genomic sequence ATCAGCATCACTAAACTCGAACCCTAAAGAAAAACAAAAATGGCTGCCATAGCTTCTACTCTCTCTCTTTCTTCAACCAAACCTCAGAGACTTTTCGATTCTTCCTTCCATGGCTCAGCCATCTCCGCAGCTCCTATCTCCATCGGTCTCAAACCACGATCTTTCTCCGTTCGCGCCACAACCGCTGGTTACGACTTGAACGCTTTCACGTTCGACCCGATCAAGGAATCGATCGTGTCACGTGAGATGACGAGAAGGTACATGACGGATATGATCACTTATGCTGAGACTGATGTCGTCGTCGTTGGTGCTGGATCTGCTGGTTTATCTGCTGCTTATGAGATCAGTAAGAACCCTAATGTTCAAGTTGCCATTATTGAGCAATCTGTTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGGTAAGATTTAGATTCATTTGCATGTGTGATTTTGTTGAAGTTTTGAGTTCTGTTTCTGTTTTAATGGAGAATTAGGGTTTAGATTGAATCATTATGAGTATTGATTGCTTGTGCTTATGGTAGATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTACGATGAGCAAGACACCTACGTTGTGGTTAAGCACGCGGCTCTGTTCACATCAACCATCATGAGCAAGCTTTTGGCTCGTCCTAATGTGAAGCTCTTCAACGCTGTGGCTGCTGAGGATTTGATTGTGAAAGGAAACAGAGTTGGTGGTGTGGTGACTAACTGGGCTCTTGTGGCTCAGAACCACCACACACAATCGTGTATGGACCCTAATGTTATGGAAGCGAAGATTGTGGTTAGCTCTTGTGGTCATGATGGTCCTTTTGGAGCTACTGGTGTTAAGAGGTTGAAGAGTATTGGGATGATTGATCATGTTCCTGGGATGAAAGCTTTGGACATGAACACTGCTGAGGACGCTATTGTGAGGTTGACCAGAGAGGTTGTTCCTGGTATGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGG