Search result

BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_028981
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:22246595-22247644[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence ATCAGCATCACTAAACTCGAACCCTAAAGAAAAACAAAAATGGCTGCCATAGCTTCTACTCTCTCTCTTTCTTCAACCAAACCTCAGAGACTTTTCGATTCACTGCTGAGGACGCTATTGTGAGGTTGACCAGAGAGGTTGTTCCTGGTATGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG
Tissues aerial
Exon boundary No-Yes
Splicing signals CC-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence ATCAGCATCACTAAACTCGAACCCTAAAGAAAAACAAAAATGGCTGCCATAGCTTCTACTCTCTCTCTTTCTTCAACCAAACCTCAGAGACTTTTCGATTCTTCCTTCCATGGCTCAGCCATCTCCGCAGCTCCTATCTCCATCGGTCTCAAACCACGATCTTTCTCCGTTCGCGCCACAACCGCTGGTTACGACTTGAACGCTTTCACGTTCGACCCGATCAAGGAATCGATCGTGTCACGTGAGATGACGAGAAGGTACATGACGGATATGATCACTTATGCTGAGACTGATGTCGTCGTCGTTGGTGCTGGATCTGCTGGTTTATCTGCTGCTTATGAGATCAGTAAGAACCCTAATGTTCAAGTTGCCATTATTGAGCAATCTGTTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGGTAAGATTTAGATTCATTTGCATGTGTGATTTTGTTGAAGTTTTGAGTTCTGTTTCTGTTTTAATGGAGAATTAGGGTTTAGATTGAATCATTATGAGTATTGATTGCTTGTGCTTATGGTAGATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTACGATGAGCAAGACACCTACGTTGTGGTTAAGCACGCGGCTCTGTTCACATCAACCATCATGAGCAAGCTTTTGGCTCGTCCTAATGTGAAGCTCTTCAACGCTGTGGCTGCTGAGGATTTGATTGTGAAAGGAAACAGAGTTGGTGGTGTGGTGACTAACTGGGCTCTTGTGGCTCAGAACCACCACACACAATCGTGTATGGACCCTAATGTTATGGAAGCGAAGATTGTGGTTAGCTCTTGTGGTCATGATGGTCCTTTTGGAGCTACTGGTGTTAAGAGGTTGAAGAGTATTGGGATGATTGATCATGTTCCTGGGATGAAAGCTTTGGACATGAACACTGCTGAGGACGCTATTGTGAGGTTGACCAGAGAGGTTGTTCCTGGTATGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG