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BaseInfo

ncRNA ID	ath_circ_028927
Species	Arabidopsis thaliana
Class	circRNA
Genome position	5:21981975-21983990[+]
Reference genome	TAIR10
Source	PlantcircBase
Method	SMALT and Segemehl
Type	exonic
Splice junction sequence	CTCTCAACCTCCACACTTTCTCACCCATCACACAATCCTCAAAACAGAGTAACCCAAAAAACAGAGCAATCTCTAAAAAATCTCAAGAAACCTCACTAAAACATTGCGTGAAATTCTTGAAGAACTGCTACGAGTCACTTCCAGAGGATGGAAAAGTGATATTAGCAGAGTGTATACTTCCAGAGACACCAGACTCAAGC
Tissues	siliques and seeds
Exon boundary	No-No
Splicing signals	AC-CT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	CTCTCAACCTCCACACTTTCTCACCCATCACACAATCCTCAAAACAGAGTAACCCAAAAAACAGAGCAATCTCTAAAAAATCTCAAGAAACCTCACTAAAATGGGTTCAACGGCAGAGACACAATTAACTCCGGTGCAAGTCACCGACGACGAAGCTGCCCTCTTCGCCATGCAACTAGCCAGTGCTTCCGTTCTTCCGATGGCTTTAAAATCCGCCTTAGAGCTTGACCTTCTTGAGATTATGGCCAAGAATGGTTCTCCCATGTCTCCTACCGAGATCGCTTCTAAACTTCCGACCAAAAATCCTGAAGCTCCGGTCATGCTCGACCGTATCCTCCGTCTTCTTACGTCTTACTCCGTCTTAACCTGCTCCAACCGTAAACTTTCCGGTGATGGCGTTGAACGGATTTACGGGCTTGGTCCGGTTTGCAAGTATTTGACCAAGAACGAAGATGGTGTTTCCATTGCTGCTCTTTGTCTTATGAACCAAGACAAGGTTCTCATGGAAAGCTGGTGAGTTTTCTTCATATTACTCGTATGAGTTCTGACTTTTAATAGATCGTTATGGTAAATCAAGCTAGACAAGACAAATTCTTTTTTGATAATGTTGTTTCATAAGTTATGGATCTTGGTTAATGGATTAAAAATGAAATTGTGCAAAGGTAAAGGTGAGAGAGAGGCACAAAGTGTCAAAGACAATCAGACAAATACAGACAATACGACACGTATAGTCTAAACCTGCTCTCTCCACTAGAAAACTATATTATATGCAATTCTTTTAGTTAGTGGTTATAACGAGCTACTTAAATGAATTTTGTTGCTGTGCCAAGATTATACAAATAATAAGGAGAAACTTCAGAAACATTTATGTTAGTTGGTCCAATCAAAAGAAACACTCTTTTTTTTTTTGCAGAAAAAACACTCTTTGTTTCTATGTTTTAGTTCATGGCTTTAAATAGAGAAGCTGTAATCGTTCTTCCTATTATTGAGTAACAAAATAAGGAGATAGAATAGCAACATGATTAGGAAGAGAATTGTTCTTTTCATGATCTAGAAAACTTCAAATCTGGTTTTGGTTTTCTTCAATCGAACCGGCTGGTTCTCTATGCAAACCGGCTGCTCTTTATCAAACTGTACAATCAACTTGCCGTGGATCTAGTTCAATCTTGTGGTCGAATTCAAAAACTTTATTATAGTTAGTGGTAATCAAAAGTTGATGGTATCGAATTTGAAAAAACAAAAGAAAGTTGAGGGTTTAAGTTAAGCTAAAAGAGTGTATATGTGTTTTCTTAAACTAATGCCAAAGAGTCATGTTTTAGGTACCATTTGAAGGATGCAATTCTTGATGGTGGGATTCCATTCAACAAGGCTTATGGAATGAGCGCGTTCGAGTACCACGGGACTGACCCTAGATTCAACAAGGTCTTTAACAATGGAATGTCTAACCATTCCACAATCACCATGAAGAAGATTCTTGAGACCTATAAGGGTTTTGAAGGATTGACTTCTTTGGTTGATGTTGGTGGTGGCATTGGTGCTACACTCAAAATGATTGTCTCCAAGTACCCTAATCTTAAAGGCATCAACTTTGATCTCCCACATGTCATCGAAGATGCTCCTTCTCATCCTGGTATATTAACATTTTCCTAACATTTCGCAAAATGAGATTTCCTTGGAAGATTATGTCATCTTATGACTAAATTAATGTAGGTATTGAGCATGTTGGAGGAGATATGTTTGTAAGTGTCCCTAAAGGTGATGCCATATTCATGAAGGTTAGTAATTAATCAAGTATTTTACACCAAATTCAAGACTAATTAAGAAAATTCTTGACATTATACGTAATTCATCAAGGAATGTATCTCAAACATTTTCTCATTGTTGTAACAGTGGATATGTCATGACTGGAGTGACGAACATTGCGTGAAATTCTTGAAGAACTGCTACGAGTCACTTCCAGAGGATGGAAAAGTGATATTAGCAGAGTGTATACTTCCAGAGACACCAGACTCAAGC