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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_028869
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:21701622-21702736[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence TATCCTTAGAAGGGTTTCTATGGTTGCTATTCGAGCTGCGTTGAACCTTCAACATGGTGCGATGAAGGACTTCTACATCTGTTCGTTGTCTTCTAGGTATGCACGTGAGGGTCTGCTCAAGTGCAATGAACTTGGATTATCAAAGAAAGAGTTGAAGAAGCTTCTACCTATTGTGGACGTTAGCTCTTCTGACTCAGGTA
Tissues whole_plant
Exon boundary No-No
Splicing signals TA-AC
circRNA sequence NA
Genomic sequence TATCCTTAGAAGGGTTTCTATGGTTGCTATTCGAGCTGCGTTGAACCTTCAACATGGTGCGATGAAGGACTTCTACATCTGTTCGTTGTCTTCTAGGTATTTAGCTATTTCAATTAAGAATGACATGTTTGTCTCAAGTACTGAAAAGTTAACCTAACGAATTGTTTTTCGTGATTTAGGACTATCGTCTACAAAGGACAATTGAAGCCTGATCAACTAAAGGACTATTACTATGCGGATCTTGGGAGTGAAAGGTTTACGAGCTACATGGCCCTGGTAAATATTTTTTCTATTCACTATCTCTTTTTTTATGCTGACTCCATGCTCCACCAACAGCATGTGAACCAACGGGGTAACCAAGGAGATGCGAAGTTGAGGAATGACTTCTGAGGCCTCTTAAGTTCCTCCAAAACCTTGATAAGAATTTTAATTTGGATGCTGGTGAGTTGGTAACGTCAAGTGAGTCCAGAAACTCGTTGCCCTTGATATGTATGATAAGTTATCTTAGGCTAAATGATCACAATCTGGTGATTAAGACTAAAATTTTGTTGGTTAAGGTAGTTAACAATTCTGCAACATTAGAACTTGCCCCCAACTATATGCTGTTGAAGTTGTGTCTAAGACCAAGTGGTAAAGTTTTCAGTTGCATACATACACATTTTAATGTTTGATAACTAATGATTGACTATACTCGGTTACATGTTTAATGATTCAGGTTCATTCTCGGTTCTCTACCAATACATTTCCCAGCTGGGATCGTGCTCAGCCGATGCGTGTTTTGGGCCACAATGGGGAGATCAATACACTCAGGGGAAACGTGAACTGGTATGTTGTCAGAGATAGCTTACATTAAAGCTTTCATGTAATTTAAGTAACCTGTTTGGTGCCTTAGCATTTGTGTGATAAAAATGCCCTTTGGTATGCAAGTGCCTAAGAAGTTGAGTCTGCCTCATTTTCATTTTAATTACTGCGTTCTCTAGTGAATTTTGTTTTGATATTTCATCACAGGATGAGGGCACGTGAGGGTCTGCTCAAGTGCAATGAACTTGGATTATCAAAGAAAGAGTTGAAGAAGCTTCTACCTATTGTGGACGTTAGCTCTTCTGACTCAGGTA