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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_028680
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:20945758-20947081[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method find_circ
Type exonic
Splice junction sequence CTTTCTGAAGCTGCTATCTTCAAGCTCAAAACCAAACCCTAGAAATAAAATGACGGCGACACAAATGCTGCTTCATCTTCTTCTTCTTCCACTTCTCTTCAATCATTTGTTTGGTTCTGTACCAGGCAAGTTAGCTAGCCCTCCTCTGCTTCGAGTTCTCGACATCCGCAACAACTCCCTCACTGGCAATGTACCTCCTG
Tissues leaf
Exon boundary No-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTTTCTGAAGCTGCTATCTTCAAGCTCAAAACCAAACCCTAGAAATAAAATGACGGCGACACAAATGCTGCTTCATCTTCTTCTTCTTCCACTTCTCTTCCTTCACTTCAGCAACCAAGTCATGGCAGAAATCACCGACGAGTTAGCGACATTGATGGAGGTTAAAACAGAGCTTGACCCAGAAGACAAACACTTAGCTTCATGGAGTGTTAATGGAGATCTGTGTAAAGACTTTGAAGGTGTTGGTTGTGACTGGAAAGGACGAGTTTCTAACATATCTCTACAAGGGAAAGGCTTATCTGGTAAAATCTCTCCGAACATTGGAAAGCTTAAACATTTGACGGGTTTGTTCTTGCACTACAATGCTCTTGTTGGAGATATTCCTAGAGAACTTGGTAACTTGTCGGAACTTACGGATCTTTATCTCAATGTTAATAATCTCTCCGGTGAGATTCCTTCAAACATTGGGAAGATGCAAGGCTTGCAAGGTTAGTTCTTTTTTACTTTAATTTTAATCTTAATCATTGATTAAACTTAAAACCTAAATTTAGCATTGTTAGATCTTTGGTTTCTGCAAAATTCTTGTCCCAAGATTAATCAATGTTCTGTGGAGATTTGAAACCTAGAAATCTGAGCTCCTTGTCTTAGGGGTTTTAGTTACTTCATTACTATCTCTGGTAGTTGAAATTATTTGAATTAGATGATTTTGGAATTTAATGCTTTAATGATCTGTCTTTAAAACGTCCTTTTCATGTCTTTTTGTTAGGATTTTTCTTTTTGTAATTTTCCTGTAAGGAAGAATAGTCAAGAACTTTTTAAGATTCAAACTTTTAATTGGAACCATAAATGGCTTACTGGTCCCAAAATATGGACTTGAATTGAAGATAACTTGTACTTCTCTTGATTAATTTTGTTTATTTAGATAATTGATTCACTTACTTTCAAAAGGCTTTATATTTGAGCTTTAATTAGCAGGACCAGGTTTCTAAATCTAGAATTAGTTCTAAGTTAATGTAAGTCAAAGCTAAGCTTCATTCCTTTTTTGGTCTATGTTGTTGTGTAGTTTTGCAGCTCTGTTACAACAATTTGACTGGAAGCATTCCTAGGGAGCTTAGTTCACTGAGGAAGCTGAGTGTTCTTGCTCTTCAATCTAACAAACTCACTGGAGCTATACCTGCGAGTTTAGGAGATTTAAGTGCTCTAGAGCGGCTAGATTTGAGCTACAATCATTTGTTTGGTTCTGTACCAGGCAAGTTAGCTAGCCCTCCTCTGCTTCGAGTTCTCGACATCCGCAACAACTCCCTCACTGGCAATGTACCTCCTG