Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR654
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr13:8243229-8243387 [+]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR1029588
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 136 - GCUAAAGACCAGGACUUAUAGCGG - 159
Stem-loop(if miRNA) --    -   A  A  AC       A   CUUAUA       -    A   -   A  A  A   A           A   A
  GCUA AAG CC GG  UUUUAGC GCG      UAAAAAA UGCC CUA AAG CC GG CUU UAGCGGCGCUU UAU A
  |||| ||| || ||  ||||||| |||      ||||||| |||| ||| ||| || || ||| ||||||||||| ||| A
  CGAU UUC GG CC  GAAAUCG CGC      AUUUUUU GCGG GAU UUC GG CC GAA AUCGCCGCGAA GUA A
GG    A   A  A  -A       C   -AAAAA       C    C   A   A  A  A   -           A   A
Stem-loop sequence GCUAAAGACCAGGACUUUUAGCAGCGCUUAUAUAAAAAAUGCCACUAAAGACCAGGACUUAUAGCGGCGCUUAUAUAAAAAAUGAAAGCGCCGCUAAAGACCAGGACUUAUAGCGGCGCUUUUUUAAAAAACGCCGCUAAAGACCAGGACUUAUAGCGG