Search result

BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_028647
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:20807246-20808248[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence GTCATGGCTTCTGGCAGTGACCCCACTGCTGATGGCTTCATTGGTGGCATAAGGCTTGCCTGGGCTGTACATTTAATGCTGATACATGATGGAATATCGGATGCAGAATGATGAGGAGGACATTATCTACATATATAATGCTTATCTGCACAAGTTAGCCTCTTGTTTTTTATCTCACCCGATCGCAAGAGATAAGGTTT
Tissues whole_plant
Exon boundary Yes-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTCATGGCTTCTGGCAGTGACCCCACTGCTGATGGCTTCATTGGTGGCATAAGGCTTGCCTGGGCTGTACATTTAATGCTGATACATGATGGAATATCGGGAATGGATACAATTTCCACTGCTTCAACAACAGATATGGGGCATATATGCTCCTGCCTGGAGTCCATCTTCTCAAAAAACGTGTTTCAATTTTTGCTGGATAATGTTCTTCGAACTGCAGCCTACCAGGTACTTTCATTATAAACATCATCCTGAATTTTATGTTCTCAGTTAGTGTCCATCAAATGCGGGGTGCCTATCTGGATTCCCTGTGCACTTGATATCATTTGACGAGCTAGTGGAAGAGTTACTTTGATTTCCCAGCTAGTGGATGACATGTTTGGCTCTTTTAACTTTTCTTGAAGATTGAGATCTGATATTGATCTCTACCTTGGCTAGTAGAATTTTATATTGAATGAGCTATTTTGTAATGGTGCCTATGGTGTTTATATTTTCCGTCATGACAACTGTAGTGTATATTGTCTGTTTCATGAAAATGGTTTTATGTGCTGGCCTTTATGGATACCGTTTTATTTTTTCATGAATTATATTTTTACTTGATTAGTCATTCCCAAATGTAAGAGTGTTCTCATTTCTTTAAGCTGATATTTCTGCTTCTAAACACGTTATATATCTATAAATGATTTCATTATTTGAGATGTGATTTTATTATATTGGTGTTTGGCGGGTCCTCTTTAGATGCTTTGTTCATTCTTGTTTAGTCTCTAGGATTTTGCTCGCTAAGTCAGATCTCAATTTCAAGTCTCTTTCCAGGTTTACCTTGTGATCTTTGATTTTTCCTGACTCAGCCCACGTTCCCCCTTGTATTGGTGTATCATTGTTTGACATTTTGTTAGTTGCTACATGCAGAATGATGAGGAGGACATTATCTACATATATAATGCTTATCTGCACAAGTTAGCCTCTTGTTTTTTATCTCACCCGATCGCAAGAGATAAGGTTT