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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_028579
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:20690487-20691370[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method find_circ
Type exonic
Splice junction sequence ATGACAGTCAGAGATGCTCTAAATTCTGCAATTGATGAGGAAATGTCTGCTGATCCTAAAGTATTTGTCATGGGTGAAGAGGTTAGTTGCAGCTAACATGTGCAAAGTCAAATTACATGTCTGCTGGACAGATAAATGTACCCATCGTCTTTAGAGGACCCAATGGTGCTGCTGCTGGTGTTGGAGCTCAACATTCTCAG
Tissues leaf
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence ATGACAGTCAGAGATGCTCTAAATTCTGCAATTGATGAGGAAATGTCTGCTGATCCTAAAGTATTTGTCATGGGTGAAGAGGTTAGTTGCAGCTAACATGTTTGATAAATTCATCTTGCAATTTCTAATCAGATATCAATATCTCATCTTTTATCTTGTTATTGTAGGTTGGCCAATATCAAGGTGCCTACAAGGTTAGAATTATTTGACCTGATGGAAATAGATATTTTCCAGTTAAATTTCTCTTGTTTTGACCCTGATCTGATGCTGGAGGTCTATCATGTACTCATAGATCACTAAAGGCCTTTTGGAGAAATATGGTCCTGAGAGAGTTTACGATACCCCTATTACTGAGGTTTGGAATTCTTATACTATTATCTTGTACTGCAGTCTCAATCCTTATTTCCATGTTTCTTGATTGAGAAGATTTCTGACAGTTATCGTTTAACCATGTTTTAGGCTGGATTTACTGGAATTGGAGTTGGTGCTGCCTATGCTGGCTTAAAGCCCGTTGTAGAATTTATGACGTTTAACTTCTCTATGCAGGTTAGCGTTGGTTTTTGTTATATTCTTTGAATACTACATTTTGCCTCTTTCTTTGACTTGATTATGCATAATTGTTGCGTTACTCAGATCATGCACTCTGGTGCAATATGTTTCCAGTTATCGTACACTTTATCTTCTTTCGGACATTAAAGTGCACTAAAGTTCTAATTATTTCCCAATGTGTATCCTAATATCTAGTAATCTTCTTTCAGGCAATTGATCATATCATCAATTCCGCTGCAAAGTCAAATTACATGTCTGCTGGACAGATAAATGTACCCATCGTCTTTAGAGGACCCAATGGTGCTGCTGCTGGTGTTGGAGCTCAACATTCTCAG