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BaseInfo

ncRNA ID	ath_circ_028462
Species	Arabidopsis thaliana
Class	circRNA
Genome position	5:20260404-20270604[-/-]
Reference genome	TAIR10
Source	PlantcircBase
Method	NA
Type	exonic
Splice junction sequence	CTCTTCATGTCGAAGTAGGTTCTTGTTCCCATGATGATCTCCCACTACTATCTCTTCAATGTCATTTTCATACAAAAACCTGACGGAAACAATACCAACCACTTGAGCATGATTATAACTTCATATTCTTCACTTCCAGGTACTACATCATAACTGCCTTCCACTGATGTGAGGTATTCAGACGGATAGTCCAAGTCAAA
Tissues	root
Exon boundary	Yes-Yes
Splicing signals	AC-CT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	CTCTTCATGTCGAAGTAGGTTCTTGTTCCCATGATGATCTCCCACTACTATCTCTTCAATGTCATTTTCATACAAAAACCTGACGGAAACAATACCAACCTCACATGTTCCAATGTATATCTTTCTAACACGTTCAAAATTACTACCATCGTCCCATGGAACTCCTCCAGCACCACCTTGTGCTTCTAGCTTTTCCGCAGCAGGAGGAAGAGGCATCGGATAAAAATGTGCACCAAGAGCCGTAATATACCCAGCCCCAAGAGGTGCATACCATCCATGAAATCCGACAACGGCACAACCTTTGCTCTCAATGACAAATTCAACTGAATCAGAAGTTCTCTCACCAAATGTCCTAGAGGTTCTCCCTTTTGATGTTTTGAAAACAAATGACGTAACATAACTATCATTCATGGTCCCCACAATGGACGTGATAACTTCATATGGATAGTCAACAACAAACTGCAATAACCAGAATAATTAAGCTATTCAACAACACCTACATATATGTATATTTTAGTTGAGGGACTTATAGATATAAGTATTCTCACCTCGTCAGTGATTCGCGAATCGTCGTTCATTCCATGGGCACGCTTTACTACTTTGCCATCGTTTTCATAGTTGATCCGGAAACACCGTATACAATAAGATCTCCATGTAACGGAAACCTTTCTAATACCTTCAAAAGCACCACTATCCCAAAGGGTGCTTCGTTCAGTAACTCCTTGGCATTCTGACTTTGTTGGAATAATCGGTGTGAAATATCCTCCAAGAGAGGTAAGATTCTTCTCAGCATATCCATGAAACCCGACAATCTTCATTCCACTGGCTGCAAGTCTAAACTTCTTACCCGTTTTGGGTCCCATAAGTTGTGAAGTCTTGACGTTGGTTCTGAATCGAAGTGCTTGAATGACCGCACAGTCGCCATCACCGTCATAGTAACCCTCTACCGATACCAGATATTCTTTGTCAACATGTCTAATCTCAAACTGTAAAACAATGTTTACGTCTAAGATTTAGCATTATACTCATGCAATTGAATAAACAGAATTTTTACTATTTCTCCATGATATGTAGTACATACCACGTGTGGGGAACCTCTTCTGTAAATAGAACCATGGATTGACCCATCTCTCAGACGCCCATTCTTGTCAACATACTCAAACTTGATGAATTGTATGCCTTCTTGACCACTTCGTACATGTATCTTTGTAAAACCTGCCTGGTCGACTCCATCATCCCACTTTGTGCCTACCTTGCCCCCTATCGCTTCTATTCTTGTAGGAGTAACCCGAGTGAAATATGCTCCTAGAGAGTACAGCCTGAAATAAGTTGATCCGTGAAACCCAATGATTTTTTTTCCCTCTACTGCTAATATGAACTTAATACCATCCTTGCCAGGATATCCAATCGGTTCAGAAATCCGCAAGTTGGTTTTAAATTGAAGTGTTTGAATCCCTCTCTGTGTGTAGGAGCCCTCAACAGATTCGAGATGTTCATTTTTTAGATGGTTAATCTCAAACTGCAAAATTTGGTGAAAAATGGTTTACAAAATTTTCAACATCTAAGAAAGCAAAAAAAGGTTATGACAGAAAGAAAAACTAAAAGTGAAATTTTCTAAAGTCAGCATATACCGTATGCGTGTATGTATTATACGTTTCACCACGGAAGGGTCCTTCAATTGGTTTTCCACTTTTGACATAATCGAAGCGAATGGACTCTATGCCCATAAGAGAATAATTTACATATATCTTTGTTACATCATCGTGGTCAGATTTGTCATCCCACCTACGGTTGCCATCCTTCCCTAACGCTTCCGATCTTTCAGTCATCTCGTACCGGTTGAATCTTCACATATGGATGGCAATTGTATGTGTTTCTTAGTCAGTAATATATACCATTTTCAACCAAGGATCAACATGTAAAATTTCTAAGTTGAACGAAGAAGATCAAGTTTTTGTTTTGGTGAAAAAGAAGCGGATGAAACTATTATCTATAAAGTAACATTTCTTGAATATTCGATGCTCTACATTTTTATGAACATGCTCATTACGTATGCAATAATTTAAATATGATTCTGAAACATTGCTGTAAATAAAAGCACCATATATAAAAGAGAGAACTGACCTATGATCGTCGAGGAGAGAGAGGCAGCTGATTGAACTGAGAGGCTATGTTGATCTATAACCAAAAGATGAAGGAGTATCTATTTATAGGCTTTTCAAAAAAGAAAAAAAAAACTTTAAAACTTTCTTACTCGTTTTGAGAAGGAAGAATTATACAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGTCTGATTTAAGAAAATGTTGAGATTTTACTTTAAACTAATATTGACATTAGTAAACAAACAAAAAGAGTAAAAAATTAAAGTAGTTGAAACTCTTGGTCTTTTTGAGAGCCACTTGATAAATTAATTTCAAATAATTAAGAACTCCAAAAGGTGACATCAAGATATTTTCCCAAAAATAAAATAAAATATGGAACAAGTTTTTGTCAATAAAGTGGAACCAACTGTATATTATTTGGGTTTTCTTAAGTCATCTTCCGGTCATATTGTATTGTATATGCCCTTACGTAGATCAAAATCTAATAATTATATAAGACTCATGTTTCTATAGTCGTTAACATACTATATATAGCCATATCAAAACTTTTTTTTTAAAGTATGTTAACAAATTATTATTTTAAAGGACTAGACTTTCCTGAAAAATCCAACAGTCAATTTTTAAAGCTACACATTGTACAAATAATGGATCGGAACTCTACTTGCATAGTTTAGCTTTGTTTTTGTCATAGCCGCCGACTCTGACGGTTGGTTTCATGTCTTTATCATGTGAGGCTGTGAGCATAGATTATTTTATAGTATACGTATCGTGTAGCGCAACGAATGAAAAAACTTTAGGTTTTGTTTTACGTAGATGAGCTTCGTTAAGTCCATTTTATATATCACGGGTCTAAAATTTATACAATCATAAATGACCTAAGCAGAAAAAAACAAAGTTCGGTCGAACAAACATAGACTACATATATAATTCCAGTTATTATATACAAATCCTATTTTTATCATATTTGTATAACAAATTATGATAACAGAGCCAAGTAAAAAAACTACACATTGTGCAAATGAAGCAAGTTTATTTGAAATACCTCTTATTATATAATTCCAGTTATTATATACAAATCATATTTTTATCTTTTTATATTTTACTGATTATATAAGAAAAGTCACTTGTCATTTCTAATTTCCAACGAGAGAATCCACTTATCAGTTATATATAATTTATCTAACATTTTAGGTCATTTTCGGTATCATTTCAATCCTCAACCACAAATGATCTCTCTTCTCTCTTCTTATTCTACTATATAGTGTGTCTGAATTGTAACAAGCAAGTGTAAGTAATGACTTAAGTAGTTCTGTTGCACGGCACAACATAATGACTCTTATACCAAATCATTGTCTTAATCTTTCTTTTGTTCCGTTCATCTCTTTCTCCATTTTGTTGCAGTCTTTTTCCAGCCTTTTCTTATTCTTATTAAGCGTATAAATCCTCCACATCCTAGCAGTTAGTTCACAAATAATATGTTGATTTAGAACTTATAATTTATTTCAGGCGAAGCGGGAAAAGTTTAAAGCCTTAATCGAACCTCCTCTAAGCAGCTGCCAAGGTAAGTACGTCCCAGTATTTAATCACATGCTCTAATAATGTAGAAAACGTTTGTCTTATATAAGATTGTCGATTAAACAACATAAGAGACAAACGTGTGGTGGAATGGAGTAAAAGATAATCAGATGTGAATGGCATGTTTCTGGCTTTTCCATGGAAACCAACTATCCTTGTGGAGTAGGAAATTTGAACTTAAATATGAAATCTTTAACGTTGATTTAATGCAGAAACTAACCCACGATGAGTACTTTATTAGATAGTTGATTTGTGAATGTACTGGATTTAGAAGGAGAATGAAGAAAATCAAAGAGAGAAGTCACAACTAACTTCACATCAACTCCATCCACTTTCTCAAACAGAGGAATCATTCAAAAGTTCAAAAGATTCAGAGAATAAAAACAGAGGAAATAAAAGCAGAGGAGAAACGGATCAAAGTTGTTGAAAACAGAGGAGGATAATGTTTCGTTTTAAGTCATAAAAATATGATCATGAGTGGGTGATGGGGAGCACGTGGATCCCAAGTTTATGAAGCATGGTACTTGATTTTCCATGGAACCCAACGATCTTGTGACCTTCCTTGTGGAGCACGAAGCTTGGGTCATCATCGAGTCCATAACACGGAGATGTTCGCATGTTTGTTGTGAACTTGAGCATGATCATAACTTCATCTTCTTCACTTCCAGGTACTACATCATAGCTACCTTCTACTGATGTGAGGTATTCGCTCGGATAGTCCAGGTCAAACTAAATTAAAAAAAAACAAGATAATCCAAAAGAATAACATCAAAGATCTAATATACAATAAGCTTTGTATAATTGGATAAAGGCTGAAGTAGTAGTAATCACCTCTTCATGTCGAAGTAGGTTCTTGTTCCCATGATGATCTCCCACTATTATCTCATGAATGTCATTTTCGTACAAAAACTTGATGGAAACGATACCAATCTCACCTGTCCCAATGTATATCTTTCTAACACCTTCGAAATTACTGCCATCATCCCAAGGAGCTCCTCCAGCACCACCTTGTGCTTCTAGCTTTTCCGAAGAAGGAGGTAGAGGCATCGGATAATAATATGCACCAAGAGCCGTAGTATACCCAGACCCAGTCTTATACCATCCATAAAATCCGACAATAGCACAACCTTTGCTCTCGAGGACAAATTCAACTGAATCAGAAGTTCCGTATCCAAATTTTGGAGAGGTTCTCCCTTTTGATGTTTTGAAAGTTAATGACGTAATCACGTTAGAATCCATGGTTGAAAACCCACATCCGTATTCAAAGCCTCAAAGCTAAGGTCATTATTACTTTTCTCT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