Search result

BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_028453
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:20244240-20244529[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type intronic
Splice junction sequence GTATGTAGTTTAATCTATTCTAACATACGTGTTAGATTTTTTTTCAGAGTTAAGTTAAAAATTAACATTCGTGTTAGACTTGCATATTAGTATTCCTTAACGGACCGATAGGAGTAACAAAAAAAAAAAATATAGATTAAGCTCGCTTGTAGAACAAAGTTAAACCAATGTGTATATCGTAAGGCTGGAAACTCTACTCA
Tissues root
Exon boundary Yes-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTATGTAGTTTAATCTATTCTAACATACGTGTTAGATTTTTTTTCAGAGTTAAGTTAAAAATTAACATTCGTGTTAGACTTGCATATTAGTATTCCTTAAAAAAAAGAGGCCGGCTGAAAAAAGACATGTGGTATTCTTGGAAAAGACATTTAGTGATTTGTTTTCATGACACCCTAAACCTCATAATCCCGGACCGATAGGAGTAACAAAAAAAAAAAATATAGATTAAGCTCGCTTGTAGAACAAAGTTAAACCAATGTGTATATCGTAAGGCTGGAAACTCTACTCA