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BaseInfo

ncRNA ID	ath_circ_028440
Species	Arabidopsis thaliana
Class	circRNA
Genome position	5:20217783-20229825[+/+]
Reference genome	TAIR10
Source	PlantcircBase
Method	NA
Type	exonic
Splice junction sequence	TCATTTTGGAAAAAACAAGCTTTCAGGCAATATCCCAAAAGAACTTTTCAGCTCAAACATGAGTTTAATACATGTGTAAGCTTCATATTACATTATATAGATTGGTTTGATATAGCTGACAATCAGATAGAAGGAAAGCTTCCAGTTTCTGATGGGGCTTCTTTACCTGGACTTGATATGCTTCTTCAAACTAAGCATTT
Tissues	root, inflorescences
Exon boundary	Yes-Yes
Splicing signals	AG-GT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	TCATTTTGGAAAAAACAAGCTTTCAGGCAATATCCCAAAAGAACTTTTCAGCTCAAACATGAGTTTAATACATGTGTAAGCTTCATATTACATTATATAGCTGAGAGATTTCATAAGTTGTGAGTAAGTAACTAACAAAGTGACTGCATTGTTCGTTGTTTTATCGATAGCCTCTTCGATGGAAACCAATTCACGGGCGAAATTCCAGAGACCCTCAGTCTCGTTAAAACGTTGACGGTGTTGTAAGTAGTAATATATATAGTTCAAATTTTTTATTTATCCTAACGTCTATAATTCTTATGTGTTTTTTCTTGGTTCTAGACGCCTTGATAGGAACAAACTCATTGGAGATATTCCTTCATATCTTAACAATCTCACAAATCTTAACGAACTGTAAGTGAGCAACTAAAGATTTGTTCTTTTGTTTGTTGAAAATAAATGAAAATGAGGTACAAGAATTTGTAGTTGAATACATTTCAGGTACTTGGCCAACAACAGATTTACTGGTACTCTTCCAAATTTAACCAGCTTGACCAGTCTCTACACATTGTAAGTTTTTTACATTTATCATCACTACCAATCTCAAACCTTCATTCTTTACCAATCTAATGCCATGATGTGATTGTAAATGTAACAGGGATGTGAGCAATAACACTTTGGATTTCTCACCCATTCCATCATGGATCTCTTCATTACCCTCCCTATCAACATTGTATGAACATCTCTGTCTCTGTCTTGTTCTCCATTTATCTCCCATGTGTATACTTTCTAAGAACAAAGGGTTTTCTTCTTCGCAGAAGGATGGAAGGGATCCAACTTAATGGTCCAATACCAATCTCATTTTTCAGCCCTCCTCAGTTGCAGACTGTGTGAGTAAAAAAAAAAAAAAAAATGAAGCTGGAAATGAACTCAAGAATTATGAACTTTGTACTAAATTGGGATTCTTTTTTTTTTGGACTTTGCAGTATCTTAAAGCGAAATAGTATAGTGGAAAGCTTAGACTTTGGTACAGACGTTAGCAGCCAGTTGGAGTTTGTGGATTTACAATACAATGAAATAACTGATTATAAACCATCAGCTAATAAAGTCCTCCAAGTAATGTATGTATCCTTGTCACTAATCAAACATGACTTCTATTTGTCTCAATCAACTGCTTAAGTGTTTATATATCTACAGATTGGCAAATAATCCAGTGTGTCTAGAGGCGGGAAACGGGCCGAGTTACTGTTCAGCAATCCAACACAATACCTCATTTTCTACACTCCCAACAAACTGTTCTCCATGCGAACCGGGCATGGAAGCGAGTCCCACGTGCCGCTGTGCGTATCCATTCATGGGAACACTCTACTTCCGGTCTCCTTCTTTCTCAGGGTTGTTCAACTCCACCAACTTCTCAATTCTACAGAAGGCAATCGCGGATTTCTTTAAGAAGTTCAATTATCCTGTAGACTCCGTTGGTGTTCGGAACATAAGAGAGAATCCAACTGATCATCAGCTTCTAATAGATCTATTGGTCTTTCCATTGGGAAGAGAGAGTTTTAATCAGACAGGAATGTCACTTGTTGGTTTTGCATTTAGCAACCAGACTTATAAGCCTCCTCCGATATTTGGCCCTTATATTTTCAAAGCTGATTTGTACAAACAGTTCTCTGGTATGATGAACCCTTGTCACACACACAATCAAACTAGAACTAAAGGTTGTTATTGATAACTCATTTGCTCTGCCTTTCTTTTTGTCACAGATGTAGAAGTTTCATCAAAGTCATCAAACAAAAGCATTCTCATTGGAGCAGTAGTTGGTGTTGTTGTTCTTCTACTATTGTTAACAATAGCTGGGATTTACGCTCTTAGGCAGAAGAAGAGAGCTGAAAGAGCAACTGGTCAAAATAATCCTTTTGGTAAGACAACAATATTTACTACTCCCTTGACTAAAATAGCATGAACAAATTTTCTTTGGCATGTTGCAGCTAAATGGGATACAAGTAAGAGTAGTATTGATGCTCCGCAGCTAATGGGAGCAAAAGCGTTTACTTTTGAGGAGCTGAAGAAATGCACTGACAACTTTTCAGAGGCAAATGATGTTGGCGGTGGAGGTTACGGCAAGGTTTGTGTCTTAACAAATGCCTTCAAATGAATGTAACAACTAATGGCCTTAGTTGAAATTCATGATCCCAAATTTTGATGGTTAAATAGGTTTATAGAGGGATTCTTCCTAATGGGCAACTCATAGCAATCAAAAGGGCTCAACAAGGATCTTTGCAAGGAGGGTTGGAGTTCAAAACTGAGATTGAGCTTCTCTCAAGGGTCCATCATAAGAATGTTGTCAGACTCTTGGGCTTCTGCTTTGACCGGAATGAACAAATGCTCGTATACGAGTACATTTCAAATGGGTCACTTAAAGACAGTCTGTCCGGTAAGATCAAACTTCTATCTTCCTCATGAGGATTTCAGATAGTTCTTGGATGCTGAATATGTTAGTAATGCAGGGAAGAGTGGGATTCGATTGGATTGGACAAGAAGACTTAAAATAGCACTTGGTTCAGGCAAGGGCTTGGCTTATCTTCATGAACTTGCTGATCCTCCAATTATACATAGAGACATCAAATCAAATAACATATTACTTGATGAAAATCTAACCGCAAAGGTTGCCGACTTCGGTCTCTCCAAACTTGTGGGAGACCCTGAGAAAACTCATGTCACAACACAAGTCAAAGGAACCATGGTGAGTAGAAAATTTATCCTCCTTTCTCTTTTTTTCTCAAATACATTTTAAACTTACAATATCTTTGTAATCAGGGCTACTTGGATCCAGAGTACTACATGACGAATCAATTAACGGAGAAGAGCGATGTGTATGGGTTTGGTGTGGTTTTACTCGAGCTATTAACCGGTAGAAGTCCGATAGAGAGAGGCAAATATGTGGTGAGAGAGGTGAAGACAAAGATGAATAAATCTCGGAGTTTGTATGACCTGCAGGAGTTGTTGGACACAACGATCATAGCAAGCAGTGGGAATCTAAAAGGGTTCGAGAAGTATGTAGACTTGGCTTTGAGATGTGTGGAGGAGGAAGGAGTTAATAGGCCATCAATGGGTGAGGTTGTGAAAGAGATTGAGAACATAATGCAGCTTGCGGGATTAAATCCTAACTCAGATTCAGCAACGAGTTCAAGAACGTATGAGGACGCAATCAAAGGATCTGGTGATCCTTATGGCAGTGAATCGTTTCAGTACAGTGGGAATTTTCCAGCTTCAAAGCTTGAGCCCCAATGATTGATTATGTTTCTTTTTGTTATTTTGTTATTTCGTAAGTGACTTCATACTTGAAATGCCTTGTGAATGTGGAGTAGCATGATTCTGTTTGATATGTGGTCGCTGATTATAAAGCAGATGAATGGAGAGCCAAACGCAGAATCAAAAACCACCAGATCTTTGGCAATGTCGACACCAGTTTCAAACATAAGAAAAGTAATCAAGCTCAATGTATGATGAATAATTGAATATATTAATTCTTGTTGAGAAGTTTGTGTGGTTTCAAAGATTTAATCCACACATCACACACACTTTTAATTTACTCCAAACCTTTCACATTTATGCATGAGATTATATTACAAATTTATATTACAAATAATTTGTAGTACGTAAGTAAAATTAGTATTAACTAATAAGAAAAAAAAGTAATAAAGTTATTGGGTTTGCAACCTAACACATCAACGATCCCATCGAACAACAACAGTTACATGACCCAGGGTGAATTTATGGTTGTCGTCTCATCTGAGAGCACTCTCTGATCTAGTGTCCTTGTTGTCCACACCTCAAACACGCCCCCAAAATGTATGACATGATTTAACAAAAAATAAAAAGAAACATGATTTAAGACATGTGGTGTGTGGCAACTCTGCCATATATTTCATGGTGAGGTAGCGAACCGGCACCAAGTTTTTCTCGATATGTTTCCTCCATTTACCATTCTTTACGGTAGACTACGGTAGACTCATAACTTTTTTTATACCGGAGTCATATCGTATTAGTTTCTTAAGAGGATTAAAGCACACATATGTTTTTGTGTCTTATTTACTACAAAAAGTCTTTTTACTAAAACACTAACAAAACAAAAATAACATACAAAAAAAATAAGAAAAGTGGTGGGATGTGGCCAAATAGCATTAGCATACATACGTAGGAAAAAAATAGACGATGTGGTCATATGTCAGAGTGGTCAAGGTCCCATCCCATCTCTGAGTTTTCCGTCGGTTTGGAGTATATTGATCGGAGAATATGATATGGGCAAAAAAAAAAAATCGATTAATTTTTAATCAATTTGGGGTACACTGAAAACAAAAAATATTTTTTTTATTAATTTACTTGGAGGAAGTACTGGTCAATATAACATCAAACCATCAGCATCATTCATTGTTGTTGCAATTAGTATTATTATCTCAAGTTGATAAAAGCTTGTGCTGATTTTTTCCATGACCATGACTTTATTGCATGTTGCTGTTAGAAAAACCATATCAGTGCATAGTCGCTTACCATTACTCTATTTCAAAAATCTCTCTTTTCTTGAGAAGAAACGTTCTAGGAAAACAAATAATATATACATGACTTCTCCCAGTTTTGTGCAGAAACAATTAAATGTTAGATCATTTAGTTAAGTTTTGTTACATATTGCATATTTATGCTTTATCATGTAAACAGATTTATTTATGTAGTTAATAAAGGACTAGTCTATTATAATGGTGTTTTGTGCCAAGTCATTGTTCATAATTTGTTCCTCCACATTACCGTATTGACATTTCAATTTCTCCCTTGGATAATACCTTTGAACCCTTCCGCAATATATAGCGGTTCTTTATTATCTATATCAAGTTGAACTATTTGTTTATATGGTCCACTGTCTATTTGTTTGCTTTATTTATAAATTTTCGCTTAACTTGTTCAAAGTCTTCTCCTTTATGTCTTACATGCTTTGTTAGCAAAGAACATGGAGGCTG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