Search result

BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_028439
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:20217783-20223910[+/+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence TCATTTTGGAAAAAACAAGCTTTCAGGCAATATCCCAAAAGAACTTTTCAGCTCAAACATGAGTTTAATACATGTGTAAGCTTCATATTACATTATATAGATTGGTTCGACATAGCTGACAATCAGTTAGAAGGAAAGCTTCCAGTTTCTGATGGGGCTTCTTTACCTGGACTTGACATGCTTCTTCAAACTGGGCATTT
Tissues leaf/aerial, inflorescences
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence TCATTTTGGAAAAAACAAGCTTTCAGGCAATATCCCAAAAGAACTTTTCAGCTCAAACATGAGTTTAATACATGTGTAAGCTTCATATTACATTATATAGCTGAGAGATTTCATAAGTTGTGAGTAAGTAACTAACAAAGTGACTGCATTGTTCGTTGTTTTATCGATAGCCTCTTCGATGGAAACCAATTCACGGGCGAAATTCCAGAGACCCTCAGTCTCGTTAAAACGTTGACGGTGTTGTAAGTAGTAATATATATAGTTCAAATTTTTTATTTATCCTAACGTCTATAATTCTTATGTGTTTTTTCTTGGTTCTAGACGCCTTGATAGGAACAAACTCATTGGAGATATTCCTTCATATCTTAACAATCTCACAAATCTTAACGAACTGTAAGTGAGCAACTAAAGATTTGTTCTTTTGTTTGTTGAAAATAAATGAAAATGAGGTACAAGAATTTGTAGTTGAATACATTTCAGGTACTTGGCCAACAACAGATTTACTGGTACTCTTCCAAATTTAACCAGCTTGACCAGTCTCTACACATTGTAAGTTTTTTACATTTATCATCACTACCAATCTCAAACCTTCATTCTTTACCAATCTAATGCCATGATGTGATTGTAAATGTAACAGGGATGTGAGCAATAACACTTTGGATTTCTCACCCATTCCATCATGGATCTCTTCATTACCCTCCCTATCAACATTGTATGAACATCTCTGTCTCTGTCTTGTTCTCCATTTATCTCCCATGTGTATACTTTCTAAGAACAAAGGGTTTTCTTCTTCGCAGAAGGATGGAAGGGATCCAACTTAATGGTCCAATACCAATCTCATTTTTCAGCCCTCCTCAGTTGCAGACTGTGTGAGTAAAAAAAAAAAAAAAAATGAAGCTGGAAATGAACTCAAGAATTATGAACTTTGTACTAAATTGGGATTCTTTTTTTTTTGGACTTTGCAGTATCTTAAAGCGAAATAGTATAGTGGAAAGCTTAGACTTTGGTACAGACGTTAGCAGCCAGTTGGAGTTTGTGGATTTACAATACAATGAAATAACTGATTATAAACCATCAGCTAATAAAGTCCTCCAAGTAATGTATGTATCCTTGTCACTAATCAAACATGACTTCTATTTGTCTCAATCAACTGCTTAAGTGTTTATATATCTACAGATTGGCAAATAATCCAGTGTGTCTAGAGGCGGGAAACGGGCCGAGTTACTGTTCAGCAATCCAACACAATACCTCATTTTCTACACTCCCAACAAACTGTTCTCCATGCGAACCGGGCATGGAAGCGAGTCCCACGTGCCGCTGTGCGTATCCATTCATGGGAACACTCTACTTCCGGTCTCCTTCTTTCTCAGGGTTGTTCAACTCCACCAACTTCTCAATTCTACAGAAGGCAATCGCGGATTTCTTTAAGAAGTTCAATTATCCTGTAGACTCCGTTGGTGTTCGGAACATAAGAGAGAATCCAACTGATCATCAGCTTCTAATAGATCTATTGGTCTTTCCATTGGGAAGAGAGAGTTTTAATCAGACAGGAATGTCACTTGTTGGTTTTGCATTTAGCAACCAGACTTATAAGCCTCCTCCGATATTTGGCCCTTATATTTTCAAAGCTGATTTGTACAAACAGTTCTCTGGTATGATGAACCCTTGTCACACACACAATCAAACTAGAACTAAAGGTTGTTATTGATAACTCATTTGCTCTGCCTTTCTTTTTGTCACAGATGTAGAAGTTTCATCAAAGTCATCAAACAAAAGCATTCTCATTGGAGCAGTAGTTGGTGTTGTTGTTCTTCTACTATTGTTAACAATAGCTGGGATTTACGCTCTTAGGCAGAAGAAGAGAGCTGAAAGAGCAACTGGTCAAAATAATCCTTTTGGTAAGACAACAATATTTACTACTCCCTTGACTAAAATAGCATGAACAAATTTTCTTTGGCATGTTGCAGCTAAATGGGATACAAGTAAGAGTAGTATTGATGCTCCGCAGCTAATGGGAGCAAAAGCGTTTACTTTTGAGGAGCTGAAGAAATGCACTGACAACTTTTCAGAGGCAAATGATGTTGGCGGTGGAGGTTACGGCAAGGTTTGTGTCTTAACAAATGCCTTCAAATGAATGTAACAACTAATGGCCTTAGTTGAAATTCATGATCCCAAATTTTGATGGTTAAATAGGTTTATAGAGGGATTCTTCCTAATGGGCAACTCATAGCAATCAAAAGGGCTCAACAAGGATCTTTGCAAGGAGGGTTGGAGTTCAAAACTGAGATTGAGCTTCTCTCAAGGGTCCATCATAAGAATGTTGTCAGACTCTTGGGCTTCTGCTTTGACCGGAATGAACAAATGCTCGTATACGAGTACATTTCAAATGGGTCACTTAAAGACAGTCTGTCCGGTAAGATCAAACTTCTATCTTCCTCATGAGGATTTCAGATAGTTCTTGGATGCTGAATATGTTAGTAATGCAGGGAAGAGTGGGATTCGATTGGATTGGACAAGAAGACTTAAAATAGCACTTGGTTCAGGCAAGGGCTTGGCTTATCTTCATGAACTTGCTGATCCTCCAATTATACATAGAGACATCAAATCAAATAACATATTACTTGATGAAAATCTAACCGCAAAGGTTGCCGACTTCGGTCTCTCCAAACTTGTGGGAGACCCTGAGAAAACTCATGTCACAACACAAGTCAAAGGAACCATGGTGAGTAGAAAATTTATCCTCCTTTCTCTTTTTTTCTCAAATACATTTTAAACTTACAATATCTTTGTAATCAGGGCTACTTGGATCCAGAGTACTACATGACGAATCAATTAACGGAGAAGAGCGATGTGTATGGGTTTGGTGTGGTTTTACTCGAGCTATTAACCGGTAGAAGTCCGATAGAGAGAGGCAAATATGTGGTGAGAGAGGTGAAGACAAAGATGAATAAATCTCGGAGTTTGTATGACCTGCAGGAGTTGTTGGACACAACGATCATAGCAAGCAGTGGGAATCTAAAAGGGTTCGAGAAGTATGTAGACTTGGCTTTGAGATGTGTGGAGGAGGAAGGAGTTAATAGGCCATCAATGGGTGAGGTTGTGAAAGAGATTGAGAACATAATGCAGCTTGCGGGATTAAATCCTAACTCAGATTCAGCAACGAGTTCAAGAACGTATGAGGACGCAATCAAAGGATCTGGTGATCCTTATGGCAGTGAATCGTTTCAGTACAGTGGGAATTTTCCAGCTTCAAAGCTTGAGCCCCAATGATTGATTATGTTTCTTTTTGTTATTTTGTTATTTCGTAAGTGACTTCATACTTGAAATGCCTTGTGAATGTGGAGTAGCATGATTCTGTTTGATATGTGGTCGCTGATTATAAAGCAGATGAATGGAGAGCCAAACGCAGAATCAAAAACCACCAGATCTTTGGCAATGTCGACACCAGTTTCAAACATAAGAAAAGTAATCAAGCTCAATGTATGATGAATAATTGAATATATTAATTCTTGTTGAGAAGTTTGTGTGGTTTCAAAGATTTAATCCACACATCACACACACTTTTAATTTACTCCAAACCTTTCACATTTATGCATGAGATTATATTACAAATTTATATTACAAATAATTTGTAGTACGTAAGTAAAATTAGTATTAACTAATAAGAAAAAAAAGTAATAAAGTTATTGGGTTTGCAACCTAACACATCAACGATCCCATCGAACAACAACAGTTACATGACCCAGGGTGAATTTATGGTTGTCGTCTCATCTGAGAGCACTCTCTGATCTAGTGTCCTTGTTGTCCACACCTCAAACACGCCCCCAAAATGTATGACATGATTTAACAAAAAATAAAAAGAAACATGATTTAAGACATGTGGTGTGTGGCAACTCTGCCATATATTTCATGGTGAGGTAGCGAACCGGCACCAAGTTTTTCTCGATATGTTTCCTCCATTTACCATTCTTTACGGTAGACTACGGTAGACTCATAACTTTTTTTATACCGGAGTCATATCGTATTAGTTTCTTAAGAGGATTAAAGCACACATATGTTTTTGTGTCTTATTTACTACAAAAAGTCTTTTTACTAAAACACTAACAAAACAAAAATAACATACAAAAAAAATAAGAAAAGTGGTGGGATGTGGCCAAATAGCATTAGCATACATACGTAGGAAAAAAATAGACGATGTGGTCATATGTCAGAGTGGTCAAGGTCCCATCCCATCTCTGAGTTTTCCGTCGGTTTGGAGTATATTGATCGGAGAATATGATATGGGCAAAAAAAAAAAATCGATTAATTTTTAATCAATTTGGGGTACACTGAAAACAAAAAATATTTTTTTTATTAATTTACTTGGAGGAAGTACTGGTCAATATAACATCAAACCATCAGCATCATTCATTGTTGTTGCAATTAGTATTATTATCTCAAGTTGATAAAAGCTTGTGCTGATTTTTTCCATGACCATGACTTTATTGCATGTTGCTGTTAGAAAAACCATATCAGTGCATAGTCGCTTACCATTACTCTATTTCAAAAATCTCTCTTTTCTTGAGAAGAAACGTTCTAGGAAAACAAATAATATATACATGACTTCTCCCAGTTTTGTGCAGAAACAATTAAATGTTAGATCATTTAGTTAAGTTTTGTTACATATTGCATATTTATGCTTTATCATGTAAACAGATTTATTTATGTAGTTAATAAAGGACTAGTCTATTATAATGGTGTTTTGTGCCAAGTCATTGTTCATAATTTGTTCCTCCACATTACCGTATTGACATTTCAATTTCTCCCTTGGATAATACCTTTGAACCCTTCCGCAATATATAGCGGTTCTTTATTATCTATATCAAGTTGAACTATTTGTTTATATGGTCCACTGTCTATTTGTTTGCTTTATTTATAAATTTTCGCTTAACTTGTTCAAAGTCTTCTCCTTTATGTCTTACATGCTTTGTTAGCAAAGAACATGGAGGCTGCATTTTTATGTTAGAGTTCGTCATAACTTGTGCAGACCACATGCTTTCTTCTTGAACGAATTGTGATACATATCATTGTGTGTCTGATGAAGATGAGTTCAAGAATTGGATTATTTAAGCTCTTGATCTTGCTTTTCTTCCAAATTTACTCTGTTTATGCGTTCACAGATGGTTCAGATTGTAAGTATAAGTAGATGATGATCAGAGTTCTTTTAACAGATAAAGATTTCCAATTTTTTGTATTTTAATTCTTTCAATATTGGTGCAGTTACTGCTTTACAAGCCCTGAAGAACGAATGGGACACGTTATCCAAGAGTTGGAAAAGCTCTGATCCTTGTGGAACCGAATGGGTTGGAATTACATGTAACAACGATAACCGTGTTGTTTCAATGTAACACCTTGGTCCCTTTCTTTGTTTGTTCTTTTGCTGCTTCTTTCTTCAATATAATCCTCTATATACAGACTTTAAGCTGTGTTATTTGCTTGTTTCAGATCATTAACCAACCGTAACTTGAAAGGAAAGCTTCCTACCGAAATTTCGACATTGTCTGAATTGCAAACCTTGTAGGTCTTTCTTCTTCTTCTTTTTCCTTTGCATAAAAATGGATTTAGTTCTCATCTTATGATTCGATGTTTGCAGGGATTTGACTGGCAATCCTGAATTGTCTGGACCGCTTCCAGCAAATATCGGTAACCTCAGGAAGTTGACTTTCTTGTAAGCAAAGTAAACAAGATCTTAACCTAATTCCATCAATCGCATTATCTTATATATCGCCTTTTCTTTTGTTGTTTTCTTCTCTAGGAGCCTTATGGGATGTGCTTTTAATGGTCCAATCCCTGATTCCATAGGGAATCTTGAACAACTTACAAGACTGTAAGATTTGTTGCTTCTTATAATTTATAAACAGTCACTTTTTCAATGTAATCTTTAAAACTCATAATAAGTATTACTTTGCGTTTCCTCCATACAGCTCTCTGAATTTAAATAAATTTAGTGGAACAATTCCGGCTTCCATGGGACGGTTATCGAAACTATATTGGTTCGACATAGCTGACAATCAGTTAGAAGGAAAGCTTCCAGTTTCTGATGGGGCTTCTTTACCTGGACTTGACATGCTTCTTCAAACTGGGCATTT