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BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR629
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr13:23726894-23727018 [-]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR1029588;SRR1029587
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 102 - AGUGAUCUCGAAUUACUGUUCCGA - 125
Stem-loop(if miRNA) --A   A       -     G UC    -ACCA UG    U    CA     UCUCA    U  A
   GUG UCUCGAA UUACU U  CGAC     U  GAUU GGGU  UUACA     AGUU UG A
   ||| ||||||| ||||| |  ||||     |  |||| ||||  |||||     |||| || U
   CAC AGGGCUU GAUGA A  GCUG     A  UUAA CCCA  AGUGU     UCGA AC C
AAA   C       U     - GA    AUCCC GU    U    AC     ---UA    U  C
Stem-loop sequence AGUGAUCUCGAAUUACUGUUCCGACACCAUUGGAUUUGGGUCAUUACAUCUCAAGUUUUGAAUCCCAUAGCUAUUGUGACAACCCUAAUUUGACCCUAGUCGAGAAGUAGUUUCGGGACCACAAA