Search result

BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_028389
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:20024089-20024526[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence AGAGTGAAGGTTTATCGTTTGAATGAAGATGGTCAATGGGATGATAAAGGAACTGGACACATTACTATGGATTATATGGAGGTTTGTTCTCATTCCTGGAGGTGTCAATGTACAGACTCAATTATCTCATGGATTGACCCACAACACTCAGCACAATTGGCTTTGAGCTTTCAAGAGACTGCAGGATGCACGATCGTATG
Tissues leaf/leaf
Exon boundary Yes-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence AGAGTGAAGGTTTATCGTTTGAATGAAGATGGTCAATGGGATGATAAAGGAACTGGACACATTACTATGGATTATATGGAGGTTTGTTCTCATTCCTGGATCCCTCCTGCGGGCCAGCACTGCGCATTCTGGAAAATTACTTGTAGCTAAATGGAAACGCTAAAACATGCAGCGATCGGAAGTATTCAATCTTTATGTAATTGATGAAGATGATAATGCGACATTGCTTGCACACCGCATCAGCATTGATAATATCTACAAGCAGCAAGACGGTAACCTTTGTGTGTTATGGTTTTATTAACTATTATGTCTTCGGTCCACGGTTTGTTTACATAAGTGGTGTCAATGTACAGACTCAATTATCTCATGGATTGACCCACAACACTCAGCACAATTGGCTTTGAGCTTTCAAGAGACTGCAGGATGCACGATCGTATG