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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_028356
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:19759870-19761244[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence CTCCTCATGGAATTGGCAAGTGGATAACTATAATCACCAACCTCAGTCTCATTTCTGTAAGTCTTACATCTCTGTGACGAGCATGATTGAATCAGTTAACCTTGTGTTTGATGCAGAGTATTTGAATGTGCCACCAGAAACAGAGACTAGGGAAGTTCAGCGGCCTGTGACTCGATCTTCTCCAAATGTTATCTTTAAAG
Tissues aerial
Exon boundary No-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTCCTCATGGAATTGGCAAGTGGATAACTATAATCACCAACCTCAGTCTCATTTCTGTAAGTCTTACATCTCTGTGACGAGCATGATTGAATCAGTTAACTCTTACAACACTGTAATAACCATGATTGAATTGGTATCTTAACTCCAGCGGATGTGCCTGACTGCACGATGACTGAAGTCACATTGAACCAAGAAGATCACTCGTACATGTTTGATGATGAAAATACTCCTGTGAAGGCATGTAGCGAGTTGGGTTACCATGTCACAACAGGTGGGTTTTTTTTTTCAAGTGATCGATCATTTCCATTCCTGATGTATGGTTGACGATGGTTTCTAATCTAAAGAATCTTTGGCTTTAGAGGACACGAACAGGAAAATGGAAGTGCACAGTGAGACACGCTCTGCTTTAAAAAGGCGTCGGATGTTGCAGTTTGAAGACCAACCTGAAACATCCCTTTTCAGCAGTGAGAGTTTCTCTGCAATCTTAAAATCAAGTGTGAGTATACAATACCCATATCTTGTCTCTAGCTAGGCACCAAATGACCACATATGCATTGCAGATAACCAAACTGATTGCTCACTTATTGATTATCACACTGCATATGGACTGCAATGTGAATGCATGTTCCTTTCAAACGTTTGCAAATGGGATTCTGTTTTGTTTCATAGACTTTTTACTTCTACTCCTAGAACAAATTCAAGCCTCTTACTTTCTTAGTATCTGGCTACCTAATTCAGTTGTGATCTTATTATCGAAGTAACATTGGATAGCTTAGGAGGTTGTATGAGGTTCTGATGCTATCTTTAATGCTTTGATTGATGATTCTTTATGCATGTTCAGGCTAGAGATGACACATTTGATGAGCTTTTACCCGAAGGGTCTCAGCTTATAGAAGGGTTTTCAGGTTGGGCTCTTATAATTCTTCCGAGTCAGTCGTGCCAATGTGTTTTCCATTTAAACAAAACACTGTCTCTTTTTCAGAAGACGCTTCTGCCTCTAGCTTCGAGGGCCTTGATCTGTACGCTGAAGAGTGGTATGCTGATTGCTTAAATGATGCTGAGACTCCAATGCTACCTGATGACTTGTATGTTTCAACCTTTCTTTTTGCTTATGTTATGTTTAGTAGCATCATTTTGCTTCATTAACTGGTTACTATTGTTGTTTTTCTCAGAAACTTTGGTTCACCTGATGTTCAAGTAGATATTTCAGGTTAGATATCTTTGTTTTCATCTCTTCCTTAGCCTGTCCTAGCTCTGGCTTCTCTTGCTAACATCCTTGTGTTTGATGCAGAGTATTTGAATGTGCCACCAGAAACAGAGACTAGGGAAGTTCAGCGGCCTGTGACTCGATCTTCTCCAAATGTTATCTTTAAAG