Search result

BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_028352
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:19759865-19761242[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence AGTAGCTCCTCATGGAATTGGCAAGTGGATAACTATAATCACCAACCTCAGTCTCATTTCTGTAAGTCTTACATCTCTGTGACGAGCATGATTGAATCAGTCCTTGTGTTTGATGCAGAGTATTTGAATGTGCCACCAGAAACAGAGACTAGGGAAGTTCAGCGGCCTGTGACTCGATCTTCTCCAAATGTTATCTTTAA
Tissues leaf
Exon boundary No-No
Splicing signals GC-AG
circRNA sequence NA
Genomic sequence AGTAGCTCCTCATGGAATTGGCAAGTGGATAACTATAATCACCAACCTCAGTCTCATTTCTGTAAGTCTTACATCTCTGTGACGAGCATGATTGAATCAGTTAACTCTTACAACACTGTAATAACCATGATTGAATTGGTATCTTAACTCCAGCGGATGTGCCTGACTGCACGATGACTGAAGTCACATTGAACCAAGAAGATCACTCGTACATGTTTGATGATGAAAATACTCCTGTGAAGGCATGTAGCGAGTTGGGTTACCATGTCACAACAGGTGGGTTTTTTTTTTCAAGTGATCGATCATTTCCATTCCTGATGTATGGTTGACGATGGTTTCTAATCTAAAGAATCTTTGGCTTTAGAGGACACGAACAGGAAAATGGAAGTGCACAGTGAGACACGCTCTGCTTTAAAAAGGCGTCGGATGTTGCAGTTTGAAGACCAACCTGAAACATCCCTTTTCAGCAGTGAGAGTTTCTCTGCAATCTTAAAATCAAGTGTGAGTATACAATACCCATATCTTGTCTCTAGCTAGGCACCAAATGACCACATATGCATTGCAGATAACCAAACTGATTGCTCACTTATTGATTATCACACTGCATATGGACTGCAATGTGAATGCATGTTCCTTTCAAACGTTTGCAAATGGGATTCTGTTTTGTTTCATAGACTTTTTACTTCTACTCCTAGAACAAATTCAAGCCTCTTACTTTCTTAGTATCTGGCTACCTAATTCAGTTGTGATCTTATTATCGAAGTAACATTGGATAGCTTAGGAGGTTGTATGAGGTTCTGATGCTATCTTTAATGCTTTGATTGATGATTCTTTATGCATGTTCAGGCTAGAGATGACACATTTGATGAGCTTTTACCCGAAGGGTCTCAGCTTATAGAAGGGTTTTCAGGTTGGGCTCTTATAATTCTTCCGAGTCAGTCGTGCCAATGTGTTTTCCATTTAAACAAAACACTGTCTCTTTTTCAGAAGACGCTTCTGCCTCTAGCTTCGAGGGCCTTGATCTGTACGCTGAAGAGTGGTATGCTGATTGCTTAAATGATGCTGAGACTCCAATGCTACCTGATGACTTGTATGTTTCAACCTTTCTTTTTGCTTATGTTATGTTTAGTAGCATCATTTTGCTTCATTAACTGGTTACTATTGTTGTTTTTCTCAGAAACTTTGGTTCACCTGATGTTCAAGTAGATATTTCAGGTTAGATATCTTTGTTTTCATCTCTTCCTTAGCCTGTCCTAGCTCTGGCTTCTCTTGCTAACATCCTTGTGTTTGATGCAGAGTATTTGAATGTGCCACCAGAAACAGAGACTAGGGAAGTTCAGCGGCCTGTGACTCGATCTTCTCCAAATGTTATCTTTAA