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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_028230
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:19346097-19350990[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence GTTGGTATGGTTGCCATCAATGATGGGATTCTACTTCGCAATCACATCCACAGGATTCTCAAAAAGCATTTCCGTGATAAGCCTTACTATGTTGACCTTGAATGACTCTGACAATACGTTTTGACTTGTGTAGTTTATTGTATATTCAGTTTAACTCTGTCACCCGCCGTGTTCAACCTTGCTGGTTCAGAGTTCCACAG
Tissues leaf/aerial, inflorescences
Exon boundary Yes-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTTGGTATGGTTGCCATCAATGATGGGATTCTACTTCGCAATCACATCCACAGGATTCTCAAAAAGCATTTCCGTGATAAGCCTTACTATGTTGACCTTGTTGATTTGTTTAATGAGGTAATCTGTTTTGGCAGATCTACTATTCTCTTTTCCACTTTTGATATTTTATCCTCAGTCTATTATTCCATTTGCTGTCTAGGTTGAGTTGCAAACAGCTTGTGGCCAGATGATAGATTTGATCACCACCTTTGAAGGAGAAAAGGATTTGGCCAAGTACTCATTGTCAATGTGAGTCAACTGTGGGCATTGTCTAAATTTTAGATACGGTTTCTTCTGATGGTTGATTAGATGAAAGGCAGTATTCTGACCTGATGCAATGGTTTTCAACTTGCAGCCACCGTCGTATTGTCCAGTACAAAACGGCTTATTACTCATTTTATCTCCCTGTGAGTATGGATTCTCTTCTTCCCTAGTCATATTTGGGGTCAAAAACAATCATGTTATTCCTTTTGTCTCCATCATTGCAATTGTAGATCCCGTGACAAGCTGTGTTTTTCTATTCAGGTTGCTTGTGCGTTGCTTATGGCCGGCGAAAATTTGGAAAACCATATTGATGTGAAGAATGTTCTTGTTGACATGGGAATCTACTTCCAAGTGCAGGTAGATTGCTGTTAAGTATTCATGAGAGCTATATGATAGGTAGTGTTGGGATGTTGATAACCATTCTTTTGTGTAGGATGATTATCTGGATTGTTTTGCTGATCCCGAGACGCTTGGCAAGGTTTCACTCGTGCTAACACTTGGTTTCTCAGGCTGATGTGAATGTATTCACTTGGTTCAGCATATTGGTTTTTTATAATGCAGATAGGAACAGATATAGAAGATTTCAAATGCTCGTGGTTGGTGGTTAAGGCATTAGAGCGCTGCAGCGAAGAACAAACTAAGATATTATATGTAAGAACCATATCATCTTGATCAAAAAGGTTTGTATCCTGTTTGGAACCTGAAACATGTTTTGTTCTGATTTACTAGGAGAACTATGGTAAACCCGACCCATCGAACGTTGCTAAAGTGAAGGATCTCTACAAAGAGCTGGATCTTGAGGTTTGTAGCGAACCTCAGAGATATGATGTTGTAATACACAACTAACATTTTTGCTAATTGGACATGGTTTGATCTGAACATGATAGGGAGTTTTCATGGAGTATGAGAGCAAAAGCTACGAGAAGCTGACTGGAGCGATTGAGGGACACCAAAGTAAAGCAATCCAAGCAGTGCTAAAATCCTTCTTGGCTAAGATCTACAAGAGGCAGAAGTAGTAGAGACAGACAAACATAAGTCTCAGCCCTCAAAAATTTCCTGTTATGTCTTTGATTCTTGGTTGGTGATTTGTGTAATTCTGTTAAGTGCTCTGATTTTCAGGGGGAATAATAAACCTGCCTCACTTTTATTCTTGTGTTACAATTGTATTTGTTTCATGACTATGATCTTCTTCTTTCATCAGTTATATGAATTTGAGATTCTTGTTGGTTGATGCCTGTGACTACATACATAATATTGACCAACAGAAGAAGATAACTCGATACATACATTGATTTTATAACACTGAGATTTAAGCAACTCTTCTTCTTCTCTAATGCCTACATTCCATTCCAAAGGCAAGAAAATAAAGCTTCAAGCGCAGGCCTCGACACGTCACCTTGTCGCTTAATTTAATACAACAACTAGAGTTTATTTATAAATAATGGCTGTGAAGGGTAAAAGCGTCTTATCCTCAACGACCACCATCATCATCCAGCTAGCAGCAATTGGTTTTTCACTCACACACTAGAAACAAGAAAAAGAAAGATGGGAGATTTAATGGCTCGGTCTCTCTCTTGATCTGACGACGACGATGATGGTGAAGCTTCGCAATCTTGTTCTTTTCTTCATGCTCCTCACCGTCGTTGCTCATATCCTTCTCTACACCGATCCCGCTGCCTCCTTCAAGACCCCCTTTTGTCAGTAGTTCTCTCTCTCTTTCTCAATTCTCCGATTTGAAATTTGCTTCTTATCATCTTCTTTGTTTCGTTCTGTAGCTAAACGCGATTTCCTCGAGGACGTAACCGCCTTGGTCCGTATCTTCTTCCCTCTATCTCTCTCTCTCTTTTGATCTTCCCTTCCATTGCGTCACATTGTGTGTTTCCTTTTCAGACTTTCAATTCCGATGAGAATCGTTTGAATCTTCTTCCTCGGGTACCTTTTCTTTTTCCAGTTACTTATTGATTCGCCTCACTCAGATCTTAGCTCGTTTCTTCACTTTCTTCTTCACATTCATCTTTAGGAATCTCCCGCTGTGCTCAGAGGAGGACTCGTCGGTGCTGTCTATTCCGATAAGAATTCACGGCGGCTAGGTAACTTCAATTCTCTCACTCGCCTCTCTCTGTGATGTCTTCCTTACTTGACTTGATTATTTTTTTTAACATTCTCAGACCAATTGTCTGCTCGAGTTCTTTCCGCCACCGACGATGATACTCACTCACATACTGACATTTCCATCAAACAAGTCACTCATGATGCAGCCTCAGACTCGCATATTAATAGGGTACGTGTTTTCCGGAGAATCAGATTGGATATTCCCTAAGTTGATTGGCTCCAGATTTGAATTTGATGCTTGGTAATAGTATATATTTGGATCCTTGTAGGAAAATATGCATGTTCAATTGACCCAACAAACCTCTGAAAAAGTTGATGAGCAACCAGAGCCTAATGCTTTTGGAGCTAAGAAAGATACTGGAAACGTGTTGATGCCTGATGCTCAAGTGAGGCATCTTAAAGATCAGCTTATTAGGGCAAAGGTTTATCTTTCCCTTCCATCTGCAAAGGCCAATGCTCATTTTGTGAGAGAGCTTCGACTCCGTATTAAAGAAGTTCAACGGGCACTTGCAGATGCCTCCAAGGATTCGGATCTGCCAAAGACGTAAGTGTTTCTCACCTCTTGAAATATATGTTTCTTCCTCTTTAACTGATATTTCTCTGCCATTTTTTTGAACCCCAGTGCTATAGAAAAGCTAAAAGCAATGGAGCAAACACTGGCCAAAGGCAAGCAGATCCAAGATGACTGTTCTACAGTGGTCAAGAAGCTACGTGCTATGCTCCACTCCGCAGATGAGCAGCTACGGGTCCATAAGAAGCAAACCATGTTTTTGACTCAATTGACTGCTAAGACCATTCCTAAAGGACTTCACTGCCTTCCTCTGCGCCTCACTACAGACTATTATGCTTTAAATTCATCTGAACAACAATTTCCAAATCAGGAGAAACTAGAAGATACTCAGCTGTATCACTATGCCCTTTTCTCTGATAATGTTTTGGCTACGTCAGTTGTTGTTAACTCTACCATAACCAATGCAAAGGTAAGAATTAACTTTCTTCTTTTGTTTGAACATGTAACTGTGTTTCTTTCTGTTAAACTTACGGTCTTAATGGTTTATTGGCAGCATCCCTTAAAGCATGTCTTCCACATCGTCACAGACAGACTCAATTATGCGGCAATGAGGATGTGGTTCCTGGACAATCCACCTGGCAAAGCCACCATCCAGGTTCAGAATGTTGAAGAATTTACATGGCTGAATTCAAGCTACAGTCCCGTTCTCAAACAGCTTAGTTCTAGATCGATGATAGATTATTACTTCAGAGCCCACCATACAAATTCAGACACCAACTTGAAGTTCCGGAATCCAAAATACTTATCGATCCTTAATCATCTTCGTTTTTACTTGCCTGAGATCTTTCCCAAGCTCAGCAAAGTGCTCTTCTTGGATGATGATATAGTTGTGCAGAAGGACCTTTCTGGTCTTTGGTCAGTTGATCTGAAAGGTAATGTTAACGGTGCTGTAGAGACGTGTGGGGAAAGCTTTCATCGCTTTGACCGTTATCTGAACTTCTCAAATCCACTCATTTCCAAGAACTTTGACCCTCGAGCTTGTGGTTGGGCGTATGGTATGAATGTCTTTGATCTGGATGAATGGAAGAGGCAAAACATCACAGAAGTTTATCATCGATGGCAGGATCTGGTATGCAGAAAATATATATATGCTAGGTCGCATCTGTTTTGATTTCAAGAATGTTTGCTAATCATATACACGAACGATTTTAAACTGCAGAATCAAGACCGAGAATTGTGGAAGCTAGGGACGTTGCCGCCTGGTCTAATCACATTTTGGAGACGAACATATCCGCTAGACCGGAAATGGCACATACTAGGGCTTGGATACAACCCGAGTGTGAACCAAAGGGATATTGAGAGGGCAGCCGTGATACACTATAATGGCAACCTCAAACCATGGCTAGAGATTGGGATTCCAAGATACAGAGGCTTCTGGTCAAAGCATGTAGACTATGAGCACGTTTATCTCAGAGAATGCAACATCAATCCTTAGAATTAGAGTCTGTTGTGAGGGCAATATTATACGTTTATAATCTGACGAGATGATCATTACATGAAATTGTATATGTCACGGTAAAAGGAGTTCCAATAGGCACGACCGATGTTATTATTGCAACATATATATCAACAAGAGGAATGACAACGAAACAATGAAACAACTACTTTTCGTATTCCTTTTTGTCGCTGTTTATGTAAAGCAAGTGACAATTGACATAGGTCTATAGGAGACTTTAGACTTTAATCAAATTTGCCAAAGAGCAATACAACATAAATAGTCAAGCCGATTATCGAACCAGAGTAGCATGAATATTAGCCCAGTGAAGACGAAAAGAGATTCGAATCGGAATTACGTGAATGTGATTTCGAATGACTCTGACAATACGTTTTGACTTGTGTAGTTTATTGTATATTCAGTTTAACTCTGTCACCCGCCGTGTTCAACCTTGCTGGTTCAGAGTTCCACAG