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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_028201
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:19261824-19269135[+/+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence ACTGACTCCTCAAAAGACAAAGCTCCTGATGGGGTGACACAGGTGAAATCAACTCGGAAGGTGCCAAGTTCTCGGTTTAGCCGCTTTGGTATTGGCATATTTCAGTGGAACCCACACATGAGTCGGGTGGGAGTGGGAGGAGAATGGCAGTACATACTAGAAGTGTATCAGAGCCAGATTTCGGTAGGACGCCGATACAG
Tissues inflorescences
Exon boundary No-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence ACTGACTCCTCAAAAGACAAAGCTCCTGATGGGGTGACACAGGTGAAATCAACTCGGAAGGTGCCAAGTTCTCGGTTTAGCCGCTTTGGTATTGGCATATTGAAGAACACTGTAGGGAAGGTCTTCCCATCTCGATCATCTAATGAGGTGCACCTTACTAAATCTTGAGGTCGTGAGGAGTCTTGTTGAACTTATACTAATTGTTTTGAGTCATTCTTTGGGTAAAGGCAAAACTGGGTAATGAGAATCAATTCTACTATGACGATAACCTAAAGAGATGGGTGGAAAGAGGTGTGGAACCCCCAGCTGAGGAAGCTGCACTACCTCCTCCTCCAACGTCAGTCCCATTCCGAAGCAACTCATTGGGTCATGAAAACAAGTCTGAGATAAAGAACGAGATGTCTCCATCTAGTGGGAGCTGGAGTAGTGGCAGCCCAACTCCGTCAGAGAATTCTCCGGGAATCCCACCAGTCTCACAGGGCTCAAACCAATTCTCAGCTCGTGGACGTATGGGTGTGCGTGCAAGGTAAACAAACCACTTGAGACACTTGAGAATTATATATAATCTGTGGAGGCTATCCTGGATCCTAAGTTAGAATGGCAATAAGGAAGGAATATAAGCCACCATTGATTTACGGGTACAAAAGAGCTTTTGATGTGAGATGGGAATAGTTCTCCTGATGGTAGTGTACGGTTGTGCAACTGATAGCTATAATTTGTCTGATCGTTTATTAAAAAAGCTACTGGATATAATATTCCCTCGTTAGTGTTTTACTGTAGATAATGTGCATGCTTAGAACTGATCATTTTACTCTTTTTCGGGGGCAGGTACGTTGACACCTATAATCAAGGCTCCTCGAGCATGTATCAGTCACCTCCCGTGCAATCTTCTAAACCACCGATTCCTGCGAAAGCAAAATTCTTTGTCCCAGCAGCACCGGCATCGTTTGCAAACGACCAGGTAATGGAATCGGTTAGTGCTGAAACCAGACAAGAGAACTCAGGAGATGAAGCAGTAGTAGGCTCTGCAGGCGCTCCAGGACCAAGCCAGGCTTCATTCCAGTCCCCGACACCATCTCCAATTGCAATGCAGAGATTTCCAAGTGTAGACAACATCAGAAGAAGTGGATCAGGAACAAGCCTTAATGGTGATCTTCCTCAGTCAGTATCAAGAAGAACAGCTTCATGGAGCGGAAGCGTCAACAGCTCGTCGTTTATGTCTCCAACGAGTGCATCAACATTCAGACCAAGCCCACTGAACAGTAGCAGTAGCAGCTTAGGAGAGGAGCTTCAGGAAGTTGAACTGTAAGTTGAAAAATCTGTAATATCACAAAAGAAAAAAAAAGTTTTGCTCACTGTCACAACAGGTTAGATCGATCAATCAATCAAATGTTAATCCATGAGTTACCCCAAAATTACATGAAGCACTTTCTCTGCTTCTGTCAATGACAGGGGGCAAATATGTATTATGCCGTTTGTATTTTTTTTTTATTTTCTTACTAAATATAAATTCATTAAATTTCTTTGTTAACAGACTTGAGGAATTACACAATAATACACATTAATATTTCGTTCATGAGTGGTAATGAAATTTGTTCACCATGTGTTGGCCTCTAATTTCTGCATCCCTTTGATTGTGTGGTTTCCCGTATTCATAGTTTAGATGGAGTATGCATTTTGGAAAGAAGAGGATGGAACCAGAACATAATTTTGGTTTTGCCTTTAATTATGTTTAGATTAAAAATAATAATAATAGTTATTAGTATAATGATTTACTTTTAATAATATAGCATAATAAATTTTAATTTGATACACGGCTGAACCAAATTTTGAATTATGCATGATTTCTTTTGGTAATTCGGTTTGGTTCAATTAGATTCGAATAAATTTGCATCACAATTTTTTTTATAACATTAGTGACCGAAAATGTGGCTCTTTGGACCGGGAACGCGGACTTTTAAGAAAAAACCCCGCTGGTATCGGCATGTGCCGATTCATTTGTGTTTTTGTTTTATGTGGGCTGGCCATTAATAATAATTGGGCCGATAATTCGTGTTTTATGATTAATCGTCCGATCTGAAGCTCTAATTAATTAATTAACGGATGAAGAACCGGTTTCTTAAAGCATCTTGAAGAGCGATCCAATGGCTACCGTTGGATTCATCAGATCTCTGTAGCTTCTTTAGAAGAAACAAACAGAGGGAGTCTTCTTCTTCCTCCAACGTAAAAACCAGAATTTCAATATCTTCATTCCCTGATTATATCACATCTGGATCAGGCATTTCGTCAAACACCTTGTGAGCATCTTTTAGCGAGCCGTTTCTTTTGTAGAATCTCAGCAAGGAATTTGGAATCAAAGTGTACATGTGGCAAACAGACCTGTGTGTTTATGACCGTAGCTGGACATGAAGCTTTCGTCACAAAGAAACGTAGCCATTGTCGCCGGAAACGCTCTTGGTTTGTCTCCTTCATTGAGTAGTTACGAGATATCGGAAATTTTGTAAGTTTCTTAGACACAGATCTTTGCATTTAAAACAGATCGGCGCCAACCATCCTCGATGCGTATAGAAATGTCATTAAGAAGAGATAATATGAATCACATTGTATGATACTTTTGTTGAGAATGACGTTGAAGGTTGAGATGGAAAAGCTTCGAATAGACGTTTAAGTTATTAGGAAAGTAGCAAATTTGGGACGAATCCTTTCTAGGTTTTGGATCGGAATCTATGGCATCGTGCTCCACTTGATCGCTGCGTTCTATAGAGCTTCTTCCGATCCTCTCTCACGGCGATTTTTGTTGGGGATTAGATTCGGGTTAATATAATTCCGATTTTCATCTCTTTTTCGATTGATGGCTTCGGCTTCTCAATTCCTGCTGGAGGATCAGACGGATGAGGATTTCTTCGACAAGCTTGTTGATGATGCTTATTCTCCCACCGAAGCTCAGGCTTCATCCTCTGTGACGGAGCTGAAGTTCGACGATGAAAGTGACTCCGATGATATCAGAGCTTTTTCGAATCTCTCTATTGGTAAAGATCCTTTGGGCGGAGGAGATGGCACACTGAATGAAGCAATTTTGGGGAACGATGTTGCAAACGAGGGTGCAAGCGGTTCGGTGGGGGAAGACGAGCCTTCATCTATTGCTCCGGAAGCTGTTCAATTTCCCCATAGTGATGCAAGGGAATTAAGAGATGATGAAATGAGATCGGAGGTAGCTGATATGCCACTATCTGAAACAGCAAAAGAATGCACGATAGTTAACGAGCCCGGGATTCCTGGGGTTAAGGAGCTAGATTGGGGTTCATTTGATGCGGATTTATCTGTAAATGACGGTCGTGGGTTTGGTTCATACTCTGATTTCTTCACTGAGCTGGATGCAACTGCAGGAAATTTACAGGGAAAGGCGGATGTAGCTGTGGCCACTGGAGGAAACTTAGTAGCCAATGATACAAATAACACAAGTGTTGGGTTTGAGCAACACCAGGGTCAATTGCACCACGATTCTGCAAGCGGGCAGTACGTGGATAACAGTCAATCTTGGGAAAATCTCTATCCTGGATGGAAATATGATGCAAGTACTGGTCAGTGGTTTCAAGTTGATGGTCATGATGCAAGCATGAATTCACAGGAGAGCTATGAAAACTCAACTAGTAACTGGGAAAACGTTGCTGCGAACAACTCGGATGTTGCTTATCAGAGACAGAGTACAGCATCTGCAGTGGCTGGCACAGTTGAGAATGTTTCTACTTGGAACCAGGTTTCACAAGTGAGCAATGGGTATCCAGAACACATGGTCTTTGACTCCCAGTATCCGGGATGGTACTATGACACAATTGCTCAAGAATGGCGCTCTCTTGACAGCTACAACCAGGCTTTTCAAACAACTGGTCAAGCTAATGATCAGCAAGTTCAGAATGGCAATTCTTTTACAGCTGTGGACCATAGTAGAGAGAGTAACGTACATGATGTTTACGATAAAAATCAGATACTCAGAACACAAAAATTTGATATCCAGAGCCAACATGGAAGTTGGGATCAATCGTACTATGACAAAAATCAGCAGGCTACAAACATGTGGCAACCAGAAAATGCAGGTGCGGCTGAGGCGGCTGTGACTCCTGCCTCATTATCAAACTCCGGAGGAAACCAGCAAGTAAATAATTTGTACAGTACAGGACCTGTGGCTGAACAGTTTAAGCCATATGAGAGTGGCGTTCAGAGCTTCATTCCTCAGCATATGAATGTGGCTAATGTCACGCAGAATGGACCCATGAGTTTCTCGAACGGTTTTTATAGTAGACAGGAATCTGTAGATGATGCTCCACAGTCATTTCAGAGCAGTCAGCTTTTCTCCCCAAGTGCAGGAAGATCATCTGATGGGCGTCCACCACATGCACTTGTCAATTTTGGATTTGGCGGAAAGCTCATTCTTATGAAGGACGATAGTGGTTCTCTCCAGAATTCATCATTTGGAAGTCAGGTAATGAAGTGGTATTTTTTATATTATGCTTACTCGCTTATTTTTCTTATATTATGCTTATCGGAGAACTTGTATGAAAGATATTCTCCAATTAGAACTTTAAGTGAATCATGAAAATCTTTTCACTGCTAACCTTTTTCTATCCGACTCAGAAGGGAACTGGGGGAAGCTCCATCTCTGTCTTAAACTTGGCAGAAGTTATTTCTGGGAGTGCCTCTTATTCAAGTCTCGGAGAAAACTCTTTGAGTTACTTCAGTTGTCTGGATCAACAATCTCTTCCAGGACCCTTGGTTGGAGGAAATGTTGGAAGTAAAGACTTACATAAGTGGCTTGATGAGAGAATTTTGAATTGTGAATCTTCCTACATGGACTTTTCAAGAGGGAAACTTTTAAAGATGCTTCTTTCTTTGCTCAGAATATCTTGTCAGTATTATGGGAAACTCCGTTCTCCTTTTGGTTCCGATGCATTGCAAAAGGTGAGCAATCCATGAGATGTCTTATCACTTCTGTTTTGTAAGAA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