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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_028200
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:19261818-19269135[+/+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence GATCAGACTGACTCCTCAAAAGACAAAGCTCCTGATGGGGTGACACAGGTGAAATCAACTCGGAAGGTGCCAAGTTCTCGGTTTAGCCGCTTTGGTATTGTTCAGTGGAACCCACACATGAGTCGGGTGGGAGTGGGAGGAGAATGGCAGTACATACTAGAAGTGTATCAGAGCCAGATTTCGGTAGGACGCCGATACAG
Tissues leaf/leaf, inflorescences, whole_plant
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GATCAGACTGACTCCTCAAAAGACAAAGCTCCTGATGGGGTGACACAGGTGAAATCAACTCGGAAGGTGCCAAGTTCTCGGTTTAGCCGCTTTGGTATTGGCATATTGAAGAACACTGTAGGGAAGGTCTTCCCATCTCGATCATCTAATGAGGTGCACCTTACTAAATCTTGAGGTCGTGAGGAGTCTTGTTGAACTTATACTAATTGTTTTGAGTCATTCTTTGGGTAAAGGCAAAACTGGGTAATGAGAATCAATTCTACTATGACGATAACCTAAAGAGATGGGTGGAAAGAGGTGTGGAACCCCCAGCTGAGGAAGCTGCACTACCTCCTCCTCCAACGTCAGTCCCATTCCGAAGCAACTCATTGGGTCATGAAAACAAGTCTGAGATAAAGAACGAGATGTCTCCATCTAGTGGGAGCTGGAGTAGTGGCAGCCCAACTCCGTCAGAGAATTCTCCGGGAATCCCACCAGTCTCACAGGGCTCAAACCAATTCTCAGCTCGTGGACGTATGGGTGTGCGTGCAAGGTAAACAAACCACTTGAGACACTTGAGAATTATATATAATCTGTGGAGGCTATCCTGGATCCTAAGTTAGAATGGCAATAAGGAAGGAATATAAGCCACCATTGATTTACGGGTACAAAAGAGCTTTTGATGTGAGATGGGAATAGTTCTCCTGATGGTAGTGTACGGTTGTGCAACTGATAGCTATAATTTGTCTGATCGTTTATTAAAAAAGCTACTGGATATAATATTCCCTCGTTAGTGTTTTACTGTAGATAATGTGCATGCTTAGAACTGATCATTTTACTCTTTTTCGGGGGCAGGTACGTTGACACCTATAATCAAGGCTCCTCGAGCATGTATCAGTCACCTCCCGTGCAATCTTCTAAACCACCGATTCCTGCGAAAGCAAAATTCTTTGTCCCAGCAGCACCGGCATCGTTTGCAAACGACCAGGTAATGGAATCGGTTAGTGCTGAAACCAGACAAGAGAACTCAGGAGATGAAGCAGTAGTAGGCTCTGCAGGCGCTCCAGGACCAAGCCAGGCTTCATTCCAGTCCCCGACACCATCTCCAATTGCAATGCAGAGATTTCCAAGTGTAGACAACATCAGAAGAAGTGGATCAGGAACAAGCCTTAATGGTGATCTTCCTCAGTCAGTATCAAGAAGAACAGCTTCATGGAGCGGAAGCGTCAACAGCTCGTCGTTTATGTCTCCAACGAGTGCATCAACATTCAGACCAAGCCCACTGAACAGTAGCAGTAGCAGCTTAGGAGAGGAGCTTCAGGAAGTTGAACTGTAAGTTGAAAAATCTGTAATATCACAAAAGAAAAAAAAAGTTTTGCTCACTGTCACAACAGGTTAGATCGATCAATCAATCAAATGTTAATCCATGAGTTACCCCAAAATTACATGAAGCACTTTCTCTGCTTCTGTCAATGACAGGGGGCAAATATGTATTATGCCGTTTGTATTTTTTTTTTATTTTCTTACTAAATATAAATTCATTAAATTTCTTTGTTAACAGACTTGAGGAATTACACAATAATACACATTAATATTTCGTTCATGAGTGGTAATGAAATTTGTTCACCATGTGTTGGCCTCTAATTTCTGCATCCCTTTGATTGTGTGGTTTCCCGTATTCATAGTTTAGATGGAGTATGCATTTTGGAAAGAAGAGGATGGAACCAGAACATAATTTTGGTTTTGCCTTTAATTATGTTTAGATTAAAAATAATAATAATAGTTATTAGTATAATGATTTACTTTTAATAATATAGCATAATAAATTTTAATTTGATACACGGCTGAACCAAATTTTGAATTATGCATGATTTCTTTTGGTAATTCGGTTTGGTTCAATTAGATTCGAATAAATTTGCATCACAATTTTTTTTATAACATTAGTGACCGAAAATGTGGCTCTTTGGACCGGGAACGCGGACTTTTAAGAAAAAACCCCGCTGGTATCGGCATGTGCCGATTCATTTGTGTTTTTGTTTTATGTGGGCTGGCCATTAATAATAATTGGGCCGATAATTCGTGTTTTATGATTAATCGTCCGATCTGAAGCTCTAATTAATTAATTAACGGATGAAGAACCGGTTTCTTAAAGCATCTTGAAGAGCGATCCAATGGCTACCGTTGGATTCATCAGATCTCTGTAGCTTCTTTAGAAGAAACAAACAGAGGGAGTCTTCTTCTTCCTCCAACGTAAAAACCAGAATTTCAATATCTTCATTCCCTGATTATATCACATCTGGATCAGGCATTTCGTCAAACACCTTGTGAGCATCTTTTAGCGAGCCGTTTCTTTTGTAGAATCTCAGCAAGGAATTTGGAATCAAAGTGTACATGTGGCAAACAGACCTGTGTGTTTATGACCGTAGCTGGACATGAAGCTTTCGTCACAAAGAAACGTAGCCATTGTCGCCGGAAACGCTCTTGGTTTGTCTCCTTCATTGAGTAGTTACGAGATATCGGAAATTTTGTAAGTTTCTTAGACACAGATCTTTGCATTTAAAACAGATCGGCGCCAACCATCCTCGATGCGTATAGAAATGTCATTAAGAAGAGATAATATGAATCACATTGTATGATACTTTTGTTGAGAATGACGTTGAAGGTTGAGATGGAAAAGCTTCGAATAGACGTTTAAGTTATTAGGAAAGTAGCAAATTTGGGACGAATCCTTTCTAGGTTTTGGATCGGAATCTATGGCATCGTGCTCCACTTGATCGCTGCGTTCTATAGAGCTTCTTCCGATCCTCTCTCACGGCGATTTTTGTTGGGGATTAGATTCGGGTTAATATAATTCCGATTTTCATCTCTTTTTCGATTGATGGCTTCGGCTTCTCAATTCCTGCTGGAGGATCAGACGGATGAGGATTTCTTCGACAAGCTTGTTGATGATGCTTATTCTCCCACCGAAGCTCAGGCTTCATCCTCTGTGACGGAGCTGAAGTTCGACGATGAAAGTGACTCCGATGATATCAGAGCTTTTTCGAATCTCTCTATTGGTAAAGATCCTTTGGGCGGAGGAGATGGCACACTGAATGAAGCAATTTTGGGGAACGATGTTGCAAACGAGGGTGCAAGCGGTTCGGTGGGGGAAGACGAGCCTTCATCTATTGCTCCGGAAGCTGTTCAATTTCCCCATAGTGATGCAAGGGAATTAAGAGATGATGAAATGAGATCGGAGGTAGCTGATATGCCACTATCTGAAACAGCAAAAGAATGCACGATAGTTAACGAGCCCGGGATTCCTGGGGTTAAGGAGCTAGATTGGGGTTCATTTGATGCGGATTTATCTGTAAATGACGGTCGTGGGTTTGGTTCATACTCTGATTTCTTCACTGAGCTGGATGCAACTGCAGGAAATTTACAGGGAAAGGCGGATGTAGCTGTGGCCACTGGAGGAAACTTAGTAGCCAATGATACAAATAACACAAGTGTTGGGTTTGAGCAACACCAGGGTCAATTGCACCACGATTCTGCAAGCGGGCAGTACGTGGATAACAGTCAATCTTGGGAAAATCTCTATCCTGGATGGAAATATGATGCAAGTACTGGTCAGTGGTTTCAAGTTGATGGTCATGATGCAAGCATGAATTCACAGGAGAGCTATGAAAACTCAACTAGTAACTGGGAAAACGTTGCTGCGAACAACTCGGATGTTGCTTATCAGAGACAGAGTACAGCATCTGCAGTGGCTGGCACAGTTGAGAATGTTTCTACTTGGAACCAGGTTTCACAAGTGAGCAATGGGTATCCAGAACACATGGTCTTTGACTCCCAGTATCCGGGATGGTACTATGACACAATTGCTCAAGAATGGCGCTCTCTTGACAGCTACAACCAGGCTTTTCAAACAACTGGTCAAGCTAATGATCAGCAAGTTCAGAATGGCAATTCTTTTACAGCTGTGGACCATAGTAGAGAGAGTAACGTACATGATGTTTACGATAAAAATCAGATACTCAGAACACAAAAATTTGATATCCAGAGCCAACATGGAAGTTGGGATCAATCGTACTATGACAAAAATCAGCAGGCTACAAACATGTGGCAACCAGAAAATGCAGGTGCGGCTGAGGCGGCTGTGACTCCTGCCTCATTATCAAACTCCGGAGGAAACCAGCAAGTAAATAATTTGTACAGTACAGGACCTGTGGCTGAACAGTTTAAGCCATATGAGAGTGGCGTTCAGAGCTTCATTCCTCAGCATATGAATGTGGCTAATGTCACGCAGAATGGACCCATGAGTTTCTCGAACGGTTTTTATAGTAGACAGGAATCTGTAGATGATGCTCCACAGTCATTTCAGAGCAGTCAGCTTTTCTCCCCAAGTGCAGGAAGATCATCTGATGGGCGTCCACCACATGCACTTGTCAATTTTGGATTTGGCGGAAAGCTCATTCTTATGAAGGACGATAGTGGTTCTCTCCAGAATTCATCATTTGGAAGTCAGGTAATGAAGTGGTATTTTTTATATTATGCTTACTCGCTTATTTTTCTTATATTATGCTTATCGGAGAACTTGTATGAAAGATATTCTCCAATTAGAACTTTAAGTGAATCATGAAAATCTTTTCACTGCTAACCTTTTTCTATCCGACTCAGAAGGGAACTGGGGGAAGCTCCATCTCTGTCTTAAACTTGGCAGAAGTTATTTCTGGGAGTGCCTCTTATTCAAGTCTCGGAGAAAACTCTTTGAGTTACTTCAGTTGTCTGGATCAACAATCTCTTCCAGGACCCTTGGTTGGAGGAAATGTTGGAAGTAAAGACTTACATAAGTGGCTTGATGAGAGAATTTTGAATTGTGAATCTTCCTACATGGACTTTTCAAGAGGGAAACTTTTAAAGATGCTTCTTTCTTTGCTCAGAATATCTTGTCAGTATTATGGGAAACTCCGTTCTCCTTTTGGTTCCGATGCATTGCAAAAGGTGAGCAATCCATGAGATGTCTTATCACTTCTGTTTTG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