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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_028113
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:19036626-19040172[-/-]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence CTTAACCACATCCAACACGTTAGCACATACCTTAAGTTTAAGAGCGTCTTTACAAGTGGGTTTAAGAGATGGCGTTGCGGGCTTCTTGTGGTAGCTCTTGAGACCGCGGCTTCAAGATCAACTAGACCTTTGATAAGAGCGCAACAGTTGGACGTTGGTGGCAGAGAAACCTTAACCAAATCCAACACGTTAGCACATAC
Tissues root
Exon boundary No-No
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTTAACCACATCCAACACGTTAGCACATACCTTAAGTTTAAGAGCGTCTTTACAAGTGGGTTTAAGAGATGGCGTTGCGGGCTTCTTGTGGTAGCTCTTGGGCGGTGGTGGTGGACAAGGGACCGAAGTCGAGCTGACGAAAGTGAAGAAGATGACATTGAAGACGAGGAGAAGGGCAACCTTAGAATAAGCCATTGATGAAGAAGTAAAGTTTCAGTTAGAGTATTTCTTATAATAGGTACAAGAAAACCCTAAAAACTCTCTCTTTATCAAGCTTTTGATGTGTTGTGTGAAGAATATGAAGATAGTGATAGGGTTTTTATAGGTGAAGAGTGAGATTGGTTTATGTGTTTTTAATTACAAATCGACGAGTGGCAACGAAATGACAAAATTTCAATGTACTGTTCATGTGAGGGATTATTTTTTAAATATTATGTATTATGATGAATTGGTTGATCTTACAAACTGTCAAGATATTGGATCGTTGCATGTAACATGCAAAAGTCATTATGAGTGGTTATAAATATCCCTAAATATAAATAAATAAGCCTTATATCTGGATGATAGAGAGCTTTGAACTGATATATCTTCCAAGAAAGCAGTGTTGAATTAAACCATATTCTACCATAATAAACTTAGAATATTGTGTTACATTGAGGTTGATAAATGTTGAGAGATCAATTTTTTTTATAAGAAAAATATTGTTTTTAAAATTAGTAGCCTTGCTTATGAATATTTTGTGTATACATTATATATTTTTTCCTCTTTATCTATTATCGATCGAATCATAACAATTTTGTGGAAATAATTTTATTGTCTTCCAACATTTGGTTAGTCAACTGAACATCACTATATTAGATGTTATATTTCCATGATTAACAAAACTTACAAAATAACAGTAAGCACAAATTAAACAATTATGAATACAATTCATCAAATCTTTGTATTCATAATAGATATAGTCAGTCATATAAATGAAAATATACTTATATACATATATAACCTAGTATTTGTGTCAATGTTATCGTTGCTAGTCATCAAATGTGTTCAAATCCTTAGTGCACATATTATTTACAAAATAAATATACACAGATAAATATATATACATACATACACAGCAATATTATTTTACAAAAAAAATATCTCACAAATATATATAAACCTCGATATATAAAATTCATATATTTGTGAAATATGAAATACGGATTGACCAATATTAGAATAAGCCATTGATGAAGAAGTAAAGTTGTAAAGAATTGTCTTCTAACTTACAGTGATACAAAAAAAAAGAATTGTGATCTGTCTTATAGAGATAAAAAAAAAAAACCTAAAAATCTCTGTTTACTATCATTTATCAAGCTTGTGATCTGTTGTGTGAAGAATGGGGATATGGGTTTAGGGTATTTTTGATGTGTGTTTTTAAATTACAAAATGACAACTAATGAATGAAATAATGTTCATGTGATGATGAATTATTATTAAAGTAGAACGAAATCTTACAACCAGCTGTCAAGATTTATTGAGTTACATGCAGTGCAACATGCAAAAAAAAAATTAATTGAGTGGACAAAGATAATGTTATAACTTAATTTAAACTGTAAACAAATTAAGAACCCATTTTGGGATTAATAGGAGTACTGGAATTCGATCTTTGTTATTTTGTTCCTTTGTGGTTATGCAAAACCCATGATTTGGCCATTATATAACAATTTTTATACTATTATTAAGGACACTGAATAATATATGAAGTAATATTAGATATTATATAATTTAGGATGTTATAACAAAAACAAATACGAATCAGGGCAAAAAGTTACAAATCAGGCTAACGGTGAAAATGTTCAGTGTAAATCGATTAAAGACTTGATTTATTTAAGCACAACAGATAGGGTTCCAGAGTTTTGTGAAAACAACAGTTGTAGTTTTAAGCGTTGTTAAATAATTTACATAACTGGTTTAGCGGTTGAAAATAATGTCGGTTTGCTTTTATTTTTTTGGTCCGTACTACAACGAACTCTAATTTATGATCATTTTTTCGTCTAACGTTTTGTCGGTAGATGACTCTTCGACAAACCATATTATTTTTTGTGCCAATAATAACTTTGACTCCCAAGTTACCATGGATCCTTTGTTGATTTTTTGTAGCTATCGTTTTGTAGCTGATGTTTGTACTTCTTTATGTTATTTATGCTATATTTTCAGCCATATTATTCTTATATTTATGACTATTTTGCTCCTTATTTTGTTTTCATGAATAAAACAAGTCTTTGACACAAAAAATGTAGTATTTAAAGAAATTGTTTTCGAAAATTACATCATATTTGAAGTTACTTGTCCATCAAACTTTTTTTCTTCTTTACCTTAAGATCCATCTTGTTTAGAAATTTCTCATTAGTTATATTTTGCGCAGTTTCTTTTACAGCCATTCCGCTCTTTTTTATACTGATTTAACTTGATTTATTTCAATTTTGTAATTTTTTCAATAAGAAAACTTTAGAGATTGAACTCCATCAACCTTAGATTTCAAGGAAAAACTAACATTAGTAGTTAATAATGAGACTTTCTTGTACATATATTTTGGTTTTTTTCTTTTCTTAATGCTTTGGCCGTTTATAATGATTTTATATATTATCGAAATGGGACGACTTTATAACACGTTTAGCTTCTCCTTCCCCCCTCTTTATTTTTATTTCTCAAAATATCACTTCAGCTATACATTTCATGGGATTTAAATTATTTGCTTCCTAAAGAATTTGCATATTTTAATTTGTTAATATCTGCCTATCTTGGAGACATCGACAGACTGCCATATGGTTCGAATAAAAACTTAATCAAAAACAGTCCTAGGTTCGGATTTAATTTTATGTACTTGGTCAAATTTAAGTTCCATGGTTTGTTTGATGGTCTGGTATAATGCATACAATACAACTTAAATATCTTCTAGACATTATAGCATATCCAATCCATTATTAAGAAGAAGAAAAAAATAAACTGAGAATATTATTTTTGAACGATCAACACCTTATTCCATTGATAACATGTAAACAAACTACAACAATGGATAATGATAGAATAGATTCAAACGAGGAATGTTAAAACAAGAAACAAATGAAGTTATAACATAATATAGAATCTCTATTTAAAATGTGTAATCTCTAGGCACATTTCAAACAAAGTTGATAAGAGAATAAGCAAAACACTTTTTGATTTATTTCATTGATGAAGCATAAAACAAATTACAACAATATAAAGATATCATCAAACGAGGAATTTTAAAAACAGGAATGAAATGTGAGATATAGAAATCTCAATTTAAAATGTGTAATCTCTAGGCACATTTGAAACCAGATGGAACCTTCTTACCACAATGGTTTAGGACAACGTTCAAAGAAATGGGAACATTAAGGTTGATACCAAGAACATTAGCCTTTAGGGCAGTGCAAAGACAGACCGCGGCTTCAAGATCAACTAGACCTTTGATAAGAGCGCAACAGTTGGACGTTGGTGGCAGAGAAACCTTAACCAAATCCAACACGTTAGCACATAC