Search result

BaseInfo

ncRNA ID	ath_circ_027753
Species	Arabidopsis thaliana
Class	circRNA
Genome position	5:17410761-17417335[+/+]
Reference genome	TAIR10
Source	PlantcircBase
Method	NA
Type	exonic
Splice junction sequence	GTTTGCGATCCAACTAATGGGATTTTTCATGATGACCGTTTTTATGTTTGCTATTGCCTTCCCATACAACCACTGGATTTTACCAGATAATCGTATCGGAATGAGGTTTTCAGGATTGCTAGGGCTCAGACTCTTATCGCCCTTTGCAGTACAGTCCCAGGCTACTGGTTCACAGTTGCGTTTATTGATACCATTGGAAG
Tissues	root
Exon boundary	No-No
Splicing signals	AG-GT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	GTTTGCGATCCAACTAATGGGATTTTTCATGATGACCGTTTTTATGTTTGCTATTGCCTTCCCATACAACCACTGGATTTTACCAGATAATCGTATCGGATTCGTGGTTATGTACTCACTCACATTTTTCTTCGCCAACTTTGGACCCAATGCAACTACTTTCATTGTCCCAGCTGAAATCTTTCCAGCAAGGCTAAGGTCTACGTGCCATGGAATATCAGCCGCAACTGGTAAGGCTGGAGCCATCGTTGGAGCCTTCGGGTTCCTATATGCTGCTCAACCACAGGATAAGACCAAGACAGACGCAGGATACCCACCGGGCATCGGAGTCAAGAACTCATTGATCATGCTTGGTGTCATTAACTTTGTTGGTATGCTCTTCACCTTCCTCGTCCCTGAGCCCAAGGGCAAGTCCCTTGAAGAACTCTCCGGCGAGGCTGAGGTTGATAAATGATTATGCCGTCATATATGTTTGTCATTGGTTTTGCGATGTGTGAATTATATTTGTAATGGTGTACTACTTTTACGTTTTACGTTCTTTGCGATGAGTGAATTATATTTGTAACGGTGTACTACTTTCGCTTTTTGTTTAAATGTGTGTGCAAGTGCAACTTGTTAAGATGTAAACTCATGTTATGGTCATATCCTAGTAATGCTATAAGTTTGGAAGCAATAAAGACATGAACAATCAAACAAAAAATATGCTTAGTGGAAAGTTTGAAATGAAAGATATAAGGGCTAGTGGATGTAATTCTAGGGATCAATATTGATAGAACTGATAATACAAAAAATCAGCTTGTACTGGTATATTAGGTTGAAAAGATAAATGAGATATTTTAGAACTACTGAACTATAAAGATTGGTATATTGTTGTTCATGTAATCGAAAGATTTTTTTTGTAAGATTGTAGATGAATTTATCATCAAATGAACTACAAAGACTAGGGACTCCCAAGAGTCCAAGACCCTACTCTTCACTTGTCTAAACATTTAAGTGAAGCAATGTCAAATTAGGAGTATGATGCAACAGTCTATTTGATATATTTGACCAGTTGTACTAGACTCAATTTGATGCTGCCAGTGTGCCGTAGAAGCCTTCCAAATAGACATTATAGCTTTAGTCAAAGCAAATGAGGAAGCCGAGTGGTTTCAGAACTTGAAAATATTTCGATGGGAGAAACCAGTGTTGGCACTACGTGTAAACTAAACTCTGATAGCAATTATTTATTGTTCGAGCATTGCGCTCTTAGTTTAATGTTAAATCTTGTCTAATTAGAAGACAACACAAAAACCAATAGCAACTAATCTCAAATAGTGTAATCTCACTTGATTATATCAAATCGGATGATAACCTATGACCTATTTTACTAAAAGGTCTGTCACAAAAGTAAGTTATATATATTCAAAACAAAAAAAATATAAGATAAAAAATAAAACGAAGAAAAACTGGGAATGTCAAATATGATAAATGATTTAAACAAATATGTCATGACAAGAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAACTGTCACCGTTACAAAAAACTGTCACCATTATAAGTGTTATTATACTTATAAAAATCAGCAAGAACAACAAATTTTGGTCATCATAAGAATTCAAAATTACAAATATATCGTAACATAAAACATTATAGTGGTCATTCCATCAATTTTGTTTATCGTTTAACAAATCTGCGATCAAACGATATATTTTAGTAATATAATTTCATCTATCACAACATAACCAATTATGTCATAACTAAAAATACTATATTTTAAAAACAAATATGTTGTTACATGAAAATATTTTGGTAACATTATAAAAATCTGTCATAAGATATAACAAATCTGCTATCATTAGAGGTCATTATATTTATTAGTTTTTTGTACATAAATTTCTTATAACATGATAGATGTTTTTAGAAAATTATAAATCTACCGAGTCATTCAAAATAAAACAGCCAGACACTACAGTAAGTCTGTTATAAACTATGAAAGTATGTAGTTGAATAAAAAAATCTGTCAAAAAAATAAATATGTCAAAAAAATAAATCAGCTACAATTGTTTTAGTCTATTGTAACCATATTCTAAAAAATCTGTCAACCAAAAAAGTCTGCCAAAAGAAATATTTACGGACAAATAGATCTGTAGTATATAAATTAGATATTAAACTTTTGTAAAATTATTGCTAGAATTAATTTGAAAGGACATTTTTCTATTTATTTTTTTACACATGAGACAAGTGTATTTTAGACATGAAAATAATTTAACCCAAATTGTTTTTAAAATAATCTAGTAATTAAACTGATAATTTATGTTAATCTAGTAACTTTCCCATTATTATAATGATAAATTGTTGAGAAAATTTACTTTATTTTAGTGTTACTTTGTTCTAGAGTAAAATCGAAGAATACTTAGGGAGGGACATAGGGTCAGTGCCGGCTTAACATGGAGAGGAGGGAGTGCAACAACGAGTGGCCCATAAAGCAAAAGGGACACATACAATTCTTTCCTTTTGTAAACATAAAAAGAAAAAGAAAAAAATATGTGCAAATATAACAGAAAATTGCAAATTTTTACTAAAAAGCTCATATATATTTGCATTCCTTTTAAATATAAGGTAAAAAAAAATTCTAAATTTATTGGGCCCAAATTATATGTTGATATATTTTAATCCAACAACTCTAATACAAATATTGATTTATTGGGCCAAATCTCTTTTGTAAAATGAGATTGTTGTTTTATTTTATTTTAAATGATGTTTACTAAGTGTTTTACTTTTGTACGAAAACAATTTCCAATATATTAAGGGTCCAATTTTTTTTTTGCCCTAGGACCTAGAATAAGCTTGAGCCGGCACTGCAGAGGGTCCTAGGATTTTTGTATTTTTTACTTTGTAAGTGAATGCCATAGCAAGCCAAGGACTGAAGAAGAACAACGGAAAATATAGAGAATATGAATTTGTGTGATGCGAAGACGAAAAGAAATTATAGAAAATCAACTGAAATTGATGACGTCGAATTTGATTGAGGAGAAAAAATAGCTACAAAATAAGAGGAAGAAAAAGGAAAATAAAGAAAAGAACGAAGAGAATGAGAAGGAGAAGCCGAAAAGGGTCTAGAGAAGAGGGGTGTTTTTTCATGAAGACAAGATACTACGAAAGAAGGAAGATGAAGGGCTAGTTATAAGTAGATGTAGATCTCTGAATATATATATATATATATATATATAAAGTGTCTCCCTAAACCGGAAAAAACGATGGGTTTTGATATGCTGAACGGGGGACAAAACCCGAGAACCGAAATCAATTTAAAAGTTCACCGATCACTATACAACTCTGCACTTATTGAAACCGAAAACCAAAATTCTCCGTTTAGACGGTTTTGGTTCAATACGGTTCTTATTGAACGTCAATCACTCTATCTACTACTATACTTGAAAAACAAAATTAAATTTTTTGCCTTGACTTGATCCAGAGAGATGTTACGCGGCGGCGATGCATTAATCGATAAAATCAAACAACATGCCACGCATTGACTTTTGCAAGAAGCCAGCAACTTTATATAAAACAATCGATGATAATTGTGATCGTTACAACTATGTAATAATGCATATATATAAGCTATGTATTAACTGTAAACTTGATTTAAATAATACTGATGGGGAGTATATACCTTGATGCATAGAATAAAAATGTAAAATACGTATGAATTACTAGCTTAGTGGTAGCCTTGTTACTTGGATTAGTTTAGCAAGCAAATATCTAGCTCTAATTCACAAGCTAACCCTAAAAGTTGGTTGGACATATACATCGTCAAATATATCGAAGCTATATATATATATTTAACATATTTGTTTTTGTTACATTAAAACAAACAAAACAAAAGAAAAAAGTTTTTTTTGTGCTCCTCCTTTTTAATATCTTTTATGAAAATGGCTGACTGTTATGGAAAATGATGTTTTTATTAATCTAAGTAGTGCCTTTCACCAAAGAAAAAAAAAAACCAAATATAGTAGACTTTAGTACGGAGATACGTGAACATAACTTGTTAGATTGGTTTTCAACAAAAGAGTATAGAATGGAAAATCGTTACATACTGACTCTCATGAACAAACATATTTTGCTTAATGAAAAGTCAACTCGATCTTTATTATTTATGAGGATAAAAATCAAATAGGCTCTGTCGACAAAACGAAACAATCAGACTACCCTTTAGAATATATTTAAAATTACCAAAAATATTAATCTTTTAGGAAATTACACATGATGATATTTTAGCATATGGCGGATATTTACCTCCAACTCCAAATGAGGATATTTTAGCATATGGCGGTCTTTATTCGTACGTACTATTTTGCAAATCATTTTATATGATTGTATATACCATAGATTATAATCACTACTCTTAGTCCCATAATTTGTAAATAATAGTAATTCGTAGACATAGATGATCAAAGTTCTTTGTAATCTTACTACATACACAAAAAGTAATAAAACACAACATTTTTGTTGTATTAAATGTGCTTGTCCGTTGACAAAAAAGATAAAAGAATAGCTTTGTTTGTCCTTTCTCGACAAGTTTGTATTATAATCGTCTCACGTTCATTTCAAGATTACATGCAGAATTTGTCAAATGAAGTCTAAATCATCAAAAGTAATTTTTCCTTATTTGTTCTCACTTGAATATAAATTAACGAAATATGATTCACCATAAATTACACGAACTATAGGATACGGGTACTTATTTATTCCCTTGCGGTAATACGAATAGGTCCAAGATTGGAAATCTCAGAGTTGTCATGAATACTAAGTTAAAATATGTGCAGACCATACAAAACATAGACGAGCATAGAAAGAGAAGTTGATCAAGTGATGGAAAAAGATTAAAATAAAATATAAATATGGATATACCCTTAAGATTCCGGAGACTATGCTTCTCCGATCTCGTCTATAAATTTCAGCCGTCTCAGCCAACACAATCACAACCACCACCTCCCTCCCTCTCTCTCTCTTAATCTTTCTGCCCCCACCATTAGCGCACAACGGTGAGATTCGTTAGATGTTTATTATCTATGCATCCAAATTCACATATAGATAGATAGTACATATATAGTTGTTTATATCAATAGAAACTTTTGTTTCTAAATTGTAATCGCTTAAATTATTTGATTTATGTATAGGTTTAATTATAAATGTTATTCTGTTGGTTGTATTGGTACTAAACTAAAATAATTTAGTAGCATCTTTCCAATATTATTATAAAATTATAGTTAAGATATTTATTTTTACTTCATGAAGCAGGAAAGACAAGAGAGGCTTAGATGGCTGAACAACAACTAGGAGTGCTAAAGGCACTCGATGTTGCGAAGACGCAACTTTATCATTTCACGGCGATTGTCATCGCCGGTATGGGTTTCTTTACCGATGCGTACGATCTTTTTTGCGTGTCCTTGGTAACAAAGCTCCTTGGCCGCATCTACTACTTCAATCCGGAGTCAGCGAAGCCTGGCTCACTTCCCCCTCATGTTGCGGCCGCTGTCAATGGTGTGGCCCTTTGTGGAACCCTTTCTGGTCAACTCTTCTTCGGTTGGCTCGGTGACAAACTCGGACGGAAAAAAGTGTACGGTCTTACTTTGATCATGATGATCTTATGCTCTGTCGCTTCTGGCCTCTCTTTTGGCAACGAAGCCAAGGGTGTCATGACCACCCTTTGCTTCTTCAGGTACAGTTTTCATCCAATTACAATATTATATACACACATGATTAACCAATAATCTAATAACGAATGCAAGTTTTAAAAGTTAGTCACGCTTCGAACTGATTTAGGTATTTTTCTTTGAGAAAGTTTTTTTATATATAAACCATTACGTAGGTTTTGGTTGGGATTTGGTATTGGAGGTGACTACCCACTTTCTGCCACCATCATGTCTGAATACGCAAACAAGAAGACCCGTGGGGCTTTCATCGCAGCTGTCTTCGCCATGCAAGGTGTCGGTATCTTGGCTGGAGGTTTCGTGGCACTCGCAGTATCTTCTATATTCGACAAAAAGTTCCCAGCTCCAACATATGCAGTAAACAGGGCCCTCTCAACGCCTCCTCAAGTTGATTACATTTGGCGAATCATCGTCATGTTTGGTGCTTTACCCGCAGCTTTGACTTACTACTGGCGTATGAAGATGCCTGAAACTGCCCGTTACACCGCTTTGGTTGCCAAGAACATCAAACAAGCCACAGCCGACATGTCCAAGGTCTTACAAACAGATATCGAGCTTGAGGAAAGGGTGGAGGATGACGTCAAAGACCCCAGACAAAACTATGGCTTGTTCTCCAAGGAATTCCTTAGACGCCATGGACTTCATCTCCTTGGAACTACCTCCACTTGGTTTTTGCTTGACATTGCCTTCTACAGCCAAAACTTGTTCCAGAAGGATATTTTCTCGGCCATCGGATGGATCCCAAAGGCAGCCACCATGAACGCCACCCATGAGGTTTTCAGGATTGCTAGGGCTCAGACTCTTATCGCCCTTTGCAGTACAGTCCCAGGCTACTGGTTCACAGTTGCGTTTATTGATACCATTGGAAG