ncRNA ID |
ath_circ_027724 |
Species |
Arabidopsis thaliana |
Class |
circRNA |
Genome position |
5:17262462-17268098[+] |
Reference genome |
TAIR10 |
Source |
PlantcircBase
|
Method |
NA |
Type |
exonic |
Splice junction sequence |
GATGGCACATTCTTTGAGTTTCATCTCCACCAACTTGAACAGTTTAGTCCATCTTAACCATCATCAGTGCCAGAATTTCGGAACATTTGTGTCGTCACCGCTTTGTTAAACAAAAATCCAGACTTTGAAAAACGGCTTCAATCCCTTGTTGGCTCCCATTAATTCGTTCCAAGCAATCTTCTTCGATCTCCCTCGTGTTG |
Tissues |
root, aerial, inflorescences, seed |
Exon boundary |
No-Yes |
Splicing signals |
AG-GT |
circRNA sequence |
NA |
Genomic sequence |
GATGGCACATTCTTTGAGTTTCATCTCCACCAACTTGAACAGTTTAGTCCATCTTAACCATCATCAGTGCCAGAATTTCGGAACATTTGTGTCGTCACCGTCTAAATGTAAGAGGAGATTTGCAAGAAGCATTAGAGCTTTGCAAGAGACTGAAGGTCCAACGCCAAGAAGATTGATAGACATTATAAGATCAGTTGCTAGATTTCGTTTCCAAGCGGTTTGATAAAAATCAGACGATGCAATCAAAAGATCACATATGTTTATCGGTTTTTAGAATCTTTTTAACGATTCTTGAGTCGTTTTGGTAAAAACAAGATAGTTTCGGTGGTTTTCTTTTTTTAAAAAGGTTTTTAATCATGTTGGAGTAAAAAAAGTTTTGGAGTGGAAATAGAACGAAACAATGTCAAGTAAAAAAATGATCGAAGACAACTACCGATCGGAACAAAAAACGAAGACGAAGAATACCGACCGGTACATTGCTGTAACCGATCAGTTAACGTTTTGGAAAACTTCTATTTTCTTAGATTTTAGGGTCTCTCTCTTTGGATATAAATACTTATTCTCTTCCAGTCGTAGACATAACTTTTTGCCGTATTTTTTTCTCAATTAAAGGTTGTTCTTAGTTTTAAGGATTTGTAAATATGTTTTCTTAATTTTTTTTGATTTTATATGAGTTATTATTCTACGTTTATCATGTCTTCTCTAGTTCATGTGTGAGTAGTTTATCTTTTAAGTTTTTGGAGTTTCCGTAAAAGAAAACTTAATGAATCTTGGGTAAATATATAAAACGTCATTTAAATCACTAGTTTACCATTTTCGTTGGTTTAAACCATAAACTTTAGATCTATTGATTTAAATTTTTAAATTTATGTTGATTTTCAATTTAATCACGAATTTTCGTTGACTAACTTAATTGATTATAGTTCCTCCGTTTAAAATTAGTTATCGTTTAACGTTTCTTCACGAATATTAAGAAAATATTTCATTATTCCGTTTTAACTTTAATTAATGTATTGTTTATTTGATATCATAAATAAGAAAGATTAAATAATATAAATAAAATTAGAAAGTCTATCAAACATCTGCATTGAAAATCGAGAACGACAACTAATTTAAAACAAAATTTAACTTCTACAACGACAGCTAATGCGAAATAGAGGAAAAATTAATTAGGAAAAAAAGTATTTAATTATTTTATTAATTTATGAGAAAACAATCTTAAAGGGATACTAAATGGATGGGATAAATTAAAATTCTTTAATGATATTACAAATATTCAGAAAGCACAAACTCAGTGAAATTAATTTTTAAGAAACATCGAGAAATTAGTTAGACAAAAACCTATCAGAATCATGAGACTCACATTCATCAGACTCATCAGCCTCAGACTCATCAGACGTATCAGCCTCAGACTCATCATCCTCATCAGACGCATCAGCCTCAGACTCATCAGATCCATCAGCTTCGGACTTGTAAGATTCATCAGATTCCGACTCATCAGATTCATCTGGCTCGTCTTGGATTCTTTTCGATACACGTTAAAGAACAAAAATAAACATCTTCACTCTTGTAGACGACAATATCTTCGATACGAGACGAACAAGTATCACAACGTGGCCTAGAAGCATAGTCGTTGGAGAGCACTTCCAATACAAATCGTCCCAATTTGAAGGTGGATCCAACCCTCAAATATGGCTCGGCTCCAAGTACGCAATCAATATGAAGGGTGGTAGAACACATGTCACACGTATAGAACCATTTATGTGGATCTACAATCTTCTCGCATATGTCACACCAATAATCACCTATGGCATTCTCGCTGAATCGTAAGGACAGAAGATGCACATCGTATTTGTGCATTGCTAGTTCAGGGATAGTAGCACACTTGTAGCACATAAATAAATCTTCCCGCCCAGTCAAACACCATACATCATTACCTCCTTTTCCGCATCTTGAGCATTTATTTCTGTCAGATACGCTCCAATCATCAGAAATTACGAGCATTGAATGTGGTTGACTATTATGGACAAATCCAGCGTAAATGGAAACACATCGTACGTCAATAGTGAAGCCAGGACGGCCACCATTGTCTTCCACGTATGCGAAACCACTGCAACGTTGACTACATACGAAACAACTGAAAGGGCCGTCCCAAGAAAATGAATCCATTCCGTAGTAGTGCTTAGCATATAGAGTCAATTGCCGACTTACTGACGGATGTCTTTTCTTCTTGGAGAGGTTAGCACATGTTTCATGTAATATGAAATCACAATGTGTGCAGATGTAGCATGCATTAAAAAAGATTGGAAGGACGCACCCATGACATTGCTTGCTTTTATCATAAAGGATATCATCCTCATTGATGAGTCTTAGATTGTGTTCGTGAGTAAAATGTTTGATCAGCCCCTCTCCTACCACCTTGAAAGGCAAATTCTTTGCCGGGTCTTCTTCAGGCACTCCTTCCAATTCTATCCCATCCCACACATTACTCCTTATTGCACATCTTGAATGAACCGCGAAAGTGCAGGTCAAGCATGAAAAAGCCCCATGCATCCCGTTGACCTCTTTACGACAAACCCCACAACTCCAATTTCCGGAGCCTAGCCGAGGAACATGAGAGATGCGGTGATCGTGACGGTTAATACATATGACCCGCGGTAAGTAGACGCATTTCCTGTGAATGGTGAAACGACATGGGATACATAGACAGAGACATGATTTAGCATCATTCACTCCACACGCATCACAAGGAAAAGAGAAAGACCCTTTGAGAAAGACGAGGAGTGGATGCTCATGAGCCCTACCCGGATCAATAGTAAACGGCTTCCTCGCACACTTTTCACAAACAGGGAGACCAGAAAAGGAACAAAGATAGATATATCTGTATGATATAGATGTACATATGGAACATCGAAACAATTTACCATATCTATCAGTTAAGGATAGATGATATGTGGGATTGGAAGGGTTGATGATCTCAAGGCAATCCTTATGCACGTAGATCTCGCAAATATGGCAACTGCATTTTCCAGCTGTCTCGTCACCATCACACCCAACGCACGGAGTCGACGAATCTTTTGTTGGGTATAAAGGATGCTCGTGAAACGGAGACAGAACTCCACCATCAGCACTCTCATGTGTTTCACCTATCTCTTCCATTAATGGTAGATATCAAAAAACTTTGGGGGTGAGGATATGTATTGATTTGCCACAACCATTGTGCTTATATATATAAAGATAAAGGCAAAGTCATGTGGTGATTCATTAATACTCAATTTCCTTCAGCTTTTAAAATTTAGGCCAACGAAAATTTAGGCCAACGAAAATTTAAGTCAACGAAAATTTAAGAGTCTATTAATTTTGAACAAGTATATAAATGGGTGAAAGCTGTAACCATGTCCCTAAACACTAGTATAATTTTAAAAGTATCTATTGAAGAATATATTTTACAGTTGGTCATCATATTTAATTCTAGCTCAGTATTTCTAGCTGTATGTTAAGTTTTATTGGATCTGATAACAACTATGCTCTCGTGCTGTCCCCTAATGTCAACGAAATTTTAAGAGTATATTAATTATAATCAACCGAGATTAAACAAGTTGATATTGTATATTAATGGGTGATAGCTGTAACCACATGTCTCGAAGCGTAGAATAATTTTACAATCGGTCATTAAATATTAAATTTTATTCTATTATAAAAATGAAAATAGTATAATAATCGATGTAATTCCTTTTTTTTTTGGTGAGAGTTGATGTATTTCACATAATGAAAGTACAGTTATTTAGCATATTACTAAAACAATTATTTGATTTATTACTTTCCTATGTATTAAAAATTGATTTAAAACTCAGATTCACAGAATTGTATGTTTGGATACTAATTCATTCAACTTAAATTTTGCTGCAGAAAATATGACCTTCAAATACTAGTATGAATGTATGATAAACTTGCATGCGTGGTTTAGTAATTGTACAAACAAAATTTGAAATGATATTCCAATTTGAAAAGTTTCATGGTTTCAAGAGGTTTGTGTGGTTCTTGCAGTTGCCAAATCGGAGATGATTAATAAATAATTTTATCTTTTGATTTTATTTAACATTTTATTTTTATTTGTTTTCACTATGATTTCTATATGGTTTTGGAAAACATTTTATATGGTCTCGAGTGTTTATAAGTATTTCTACTCTGAAGAATTATATTCAGGTTATTGGCACTAAAATGACGAAAATGATATTAAAAAGAAAGAAAGATGGAAAACAAGTATTTGAAGACTTGAGAAGTATCAATTTTTCAATAATTATTGTTTTTGACCAAAAAAAAACAAACAGAATAAAATGGTGACACATGACATGTGCGAACCAAAAAACAAAAAATAGTATGTTAAATAGATTCAACACCATAAAATCTTTGTTATTTTTTTTGTTTAGTTTTCAACATCCTAATTGGGTTAATTAAACAGTTGAAACATTTTTCTTCAATAAGTTCAATGCAAGTATTTTAACATATAGAGTTTATATTTTCATCAGTTTATTAATTTTTTTAATACCGAAATTTGAACCTTTTAAGTAAAAACAAGATGATTTTTGGTGATTTTTTTTATATTTTTAGGTTTTTATGCTTGTTGGAATAAAAGAAAGAGTTTAGAAATGGAAAACAAAAAACAAGATGATTTTTGGGTGTTTAAATTTATGTAATAGATTTAATATTAATAGAGATGATATAGGTTTTATAAATATATAAAAAAAAAACAAAAACAATCATATCATGTTTAACAAAATATGAAATTAAACAATAAAAAAAAGTGACTAAAATTTTTAAATCCAACTTTAAAGTTTAAAACCGTAACAAATATAGTAGAAAATCACCAATGTCTAAAATAAACTAAAAAAACATTGCGAATTTGAACAACTAATATCGGTTGTCTCTCTCACCATTACATTCATTCTTTTAAGACGACATTGTCAAGTTTTTACCAAAATCTAAAACATCAAATGAGT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