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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_027535
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:16547321-16553956[+/+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence CCACCCTTGTGAGAGAAGACGAAAAAATTACAGATTTAAACTTCCTCATTGGCCCGAAACTCTATGAAGCCAATTGGCTAGATTTAGTTAAAGGAGGCTTTTCAAGATTTCTGTTTTGTTTTAGGTGCATGTGGTTCCAGCCCATATGTTTAGGAAAGTTATCAGTATCACAAAATCTCACTGCAAGCTAGGACTTACAG
Tissues leaf/root, inflorescences
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CCACCCTTGTGAGAGAAGACGAAAAAATTACAGATTTAAACTTCCTCATTGGCCCGAAACTCTATGAAGCCAATTGGCTAGATTTAGTTAAAGGAGGCTTTATTGCAAATGTTCAGTGTGCTGAAGTATGGTGTCCCATGACCAAAGAGTTTTTTGCAGAATATCTGAAGAAAGAGAACTCGAAAAAAAAACAGGTTAATGCGTCTAAGCTTTCTCCGCATTGATCTTTGTTTTCCTTGGATATTTTTACTGGATAAAGATCTTAAAATAATTGACTATCTTATTTTATGTTTGTTTGTTTTGATACACTAGAGTCCATGAATTTGATGTAGTCTAGAACCTTATAATATGGTAAACATCAATATTATAGGTTATTTGTGTATGTCTTATAATTTGGCAAATGCTTCTAATAGATCACCCTGTAATAGAAACTAGGAAACCCCTTCAATTGTTCTGACATTTACATATCTTGTCTTCTGGTGTCTGCAGGCGCTTTATGTCATGAACCCTAACAAGTTCAGAGCCTGTGAATTTTTGATACGTTTCCATGAACAACAACGTGGGGATAAAATCATCGTCTTTGCAGACAATCTTTTTGCACTTACAGAGTATGCAATGAAACTCCGGAAACCGATGATTTACGGTGCAACCAGGTTCGTTAAAGAACCACCTATTGAGAGCACAATTTTGTATGTTTCACTCAGTTTCCAATCTGATAGTTCTCTTTGTTCAATATGTAGCCATATCGAACGAACAAAAATTCTCGAGGCGTTTAAAACCAGTAAAACCGTGAACACTGTATTCCTGTCAAAGGTATTAGCGTTGTTTCCTTTCCATTGACCTGGGAATATATAGAGACTTGTTCATTCCATTTTCATCAAGTAACTTAGTTTCGGTTTCTTTTATTGACTACAGGTTGGTGATAACTCCATAGATATCCCTGAAGCGAATGTGATCATCCAGATTTCGTCACATGCTGGTTCTAGACGTCAAGAGGCTCAACGTTTGGGTCGTATCCTTAGGGCTAAGGTGTGATTTTAAGTATTATAACTCATCACATTTTGCGTCTCTCCTAGAGTTCCTCTTGGTTGTTGGATCCAACACGTTTTATTTCTCCGTGATCAAAAACAGGGTAAACTTGAAGATAGAATGGCTGGTGGAAAAGAAGAGTACAATGCATTCTTCTACTCGCTTGTTTCTACCGATACACAGGTAAATCACTTTATTGTTGAAGTAGCCATAAAAACTGAAATTCATCAGACCAAATCAGAACCAAAATATAATTCAGTTCTAGTCCGCACTCGTTTCCAAAACACAGAAAAAATTTTGCTTTCCAGAACCCGTGACTTGAATTCCTGAACCGATAAAAATCGAATGACTGATTGAATGGAGAATGACTGATGTAAGGATCGTGAATGTTGAAATGCAGGAAATGTATTATTCAACGAAAAGACAGCAGTTTTTGATCGACCAAGGTTATAGCTTCAAGGTAATAACAAGCCTCCCACCTCCGGACGCGGGTTCAAGCTTGGGCTACCACAGTCAAGAAGAACAGTTGTCTCTTCTCGGAAAGGTGTTGAATGCTGGAGACGATATGGTTGGTTTAGAACAACTTGAAGAAGACACAGATGGAAAGGCTCTAAAGACGCGACGAAGCATGGGATCGATGAGTGCAATGTCCGGTGCAAATGGAAGGGTCTACATGGAATACAACTCAGGTCGTCAAAAATCTGGTAACCAATCCAAGAAACCTAAAGACCCAACCAAACGACACAATATCTTCAAAAAACGTTATGTTTGAGACAAGAGAACTCATATTCGGCTATATGTTTTGAGTTGTAACTTTGGTGCAAATTTGTTTCAGGCACAAAATCAAGAAAACCTAAACGAAGACACCCTACCTTAAAAGACCGTTAACATTTGATATTTGTTTTATTATGTGAATTGATTAATTGATATTAGAAAGTTCTTTCCTTTTTTTTGATATTTGTTTTCTAGCATATCATGATATCGCCTCGAGAATACCTTTGAAAATTATTTTGTTATTGTCAACTGTCATGATATCTCGCTGAACCAACATATAAAACACGATTATAATTTGGTTGACAGATCCTGAACAACAGTAAAACGTACTTAGTTTTCGAGGTTAAAAAATAATTACTTGTCATGATTTCGAATTAAAAATAATAATGGGCTCAATTTGAGATTAAAGAAAGCCCACGCTAAAAGAGGCCTACTAAATGCCCATATTGGATCCGTTATTGTAGCCTTTCTATATATGAATCGAGTTTGCATTTCTGCTATAACGTTCTCTGCATTCACATGATCACATCAACTCAGTAACGGACTCGACATACCCGGACCTGGACCCGACACCGAATCCGAATCATAATGCGACGGAGACGCAGCTCGCTTCTCGGTCTAGCTTACAACGGAAAATATTTACGGTACCGTTTGTTTTCCCTCTGTCGTAGAATTTCTGTCTTCGACACCGGATTGATATAATCGATTGAAAAGACAAGAGATAATGTCTAAAATTGATTCGATGAAGAGAAAAAGATCAATATGGGGAACGATAAAAGTCTCGATCTTACTGATTTTGGTTAATTTTCATATTACCCTGCAAAAAAAAGTATTGTCAATTCTGGGGAATTTTGTTGTTCAGGTGAAAGATGAAGAAGACCCGACTCTGTGTGTTTTTTCTTTTAAGTGTCGTACTGATGAAGAAGATCTGGGTCAATTAGTCATCCGTTATGGCCCAGTTGTTAAGATGTTATCCAAATCGTAAGAAGAAGGCCCGACATGTTTTTGAGACGTTGGTAAGAAGAAGGTCTTGCTTCTTTTGTGCATCCAGATAATGTCTATATGACCAAGGTAAGAGCATCCTCATTGCACATCCTCCAATGAATGTCTTTCATATTAAATAATATTAAATTTAAAGACCCTCTCTCTTTTGACAGGTAAAATGTCTACTATTAAGACACATCCATTTATTATTTTCCACTTTTTTAAGTAGTTTAAAAGTTTAAAGACACCCATAAAAGATATGCAATGAGGATGCTCTAAGGGACCGAGATTATATACTGCTGCAGATGGGGTAATGTAATGCTATTTGTCTTGTGCAGGAGCGTTGGATGTACATTGGTCTCCTCTTGGTTCATACTTTGTGTCACTTGAGAAGGAGAAGAACGTGGCAACTCTTTGGGCATTGAATCGTCTCCCATTCTCAGACCATGTACATTGCACAATTTTTATGAGTATCATAAGCCCAAAAATATTAAATTAATGAATAAAATAACTGATTTGGGTTTAAGTAGTATCACTGGAGTGATTTCTTTGATACCAGTCTCTGATAACGTGGCGGGTTATGATTAGTTGGGAAAACATGTTTTTGTGTGAAAAGAGAGAAATTTTTTTTTTCGATTAGTCGGGAAAACGCATCTTTTCGATTTTGCAATTTTTTTTTTTTAATGATACTAATACGATTTCACCGGTGGAAACAGATTTATTATCAATATTATAAAAAGTTTCAAACAATAAATAAACATTAAAATTAATAGTAAAATATTATTAATGGTACTCTATGAGTACCAACTATGTGCATGCTCTCATGCGCTTTCCTTCCTCATCCTATGGTTTGTCTTTCATCTCCCATTTTGCATATGTAAGAATAATCTTAGAGGCTAAAAGAAAAAAGAATGGGCTCAACGTGAGAATAAGAAAGCCCACATTAAAAGAGGTCTATTAAAGCCCATATTTGATCCGTTATTTATTTGTAGCCTTTTGAATCTTCTACTTTACATTTCCCTTCCTTGACATTAATGATTAAACCAGTGATACCCGAACCCGACACCGAATCCGATTCAAAATCCGCCGGGGACGCAGCTACTCCCTCCGCCAAATAGCTTTCAACGGTAAATTTTCACGGCGCCGGTTGTCTTCCTTCTTTGTTCTTCTCAGGAATCGCTAATTGATAACTTCAATTGGAAGATACAAGACAAAAAAAGAAGATCAATATGGGAAACGGTATTAAGCAGCTCGATCTTACTGATTTTTGCTTAGTTTATCTTGCCAAACAAAAGTATGCCAATACTGTGAAGTTCTGTTGTTCAGGTGAAAGAGGAAGACCTAACAAGAAGATGAAGTATGGTGGCAAGGTTCGTCTTGATTCTTCTCCAGATCAATTTTTTATTTTATCAATTAGGGCTCTTCAGATGGTAGTTAGTGAGTGTAATTGTACTGTCAAATCTCAGGATGATCAAAAGATGAAGAACATCCAAAACGCTGAAGATTACTATGATGATGCTGATGAAGACTCTCGTGATGGTAAGATTGTAGCATACTTATTACTTACAAATGGATACATTTGGAACAAAATTGAATTGAAAAGTTATAATGGTTTTTGAAGGTGAAGGAGAGGAGAAGAAGAGAGATTTTACTAAATTGGAGTTGAAGCCAGATCATGGAAACAGGCCTTTGTGGGCTTGTGCTGATGGAAGGATTTTCTTGGAGACATTTTCTCCTCTCTATAAACAAGCTTATGACTTTCTTATCGCCATTGCTGAACCCGTTTGCAGGTTCGATTTTGATTTGGTGATTATATCAATGTACAAGTTATGATTTTTGTTGTTGATTTTCATTCATTTGTTACTATTTCAGGCCTGAGTCAATGCACGAGTATAATTTAACCCCACACTCGTTGTATGCTGCTGTTTCCGTTGGTCTTGAGACAGAAACTATCATTTCTGTTTTGAATAAACTGTCTAAGACTAAGCTACCCAAGGAGATGATTGAGTTCATCCATGCTTCTACTGCTAATTATGGGAAAGTAAAGCTGGTTTTGAAGAAGAATCGGTATTTTATTGAGTCCCCATTCCCAGAGGTAAGTTCATTAGGCTGATGCTCTGTCTCTGCTCTTGTGTATTTGGATATTGGTTTTCGTTTTTCCATTGCCTTTGCTCAATTGTAAACACAAAACAATCTCAGGTTTTGAAAAGGCT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