ncRNA ID |
ath_circ_027484 |
Species |
Arabidopsis thaliana |
Class |
circRNA |
Genome position |
5:16397256-16402335[+] |
Reference genome |
TAIR10 |
Source |
PlantcircBase
|
Method |
find_circ/NA |
Type |
exonic |
Splice junction sequence |
GGTACTGAATCCGTCATAGGTATATCGTTTGACATTTCGAAGATCGAGACGTTATCTATAAGCAAGCGAGCCTTTAATAGAATGCGTAATCTCAAATTCTGTTGGGTAGACAAGTAGTTGTTCAACAGTCTGGTGAGCCGGGGAAACGTCAGTTTTTAGTAGAGGCCAAAGAGATTCGTGATGTGTTGGCAAATGAAACA |
Tissues |
leaf/aerial, inflorescences, whole_plant |
Exon boundary |
Yes-No |
Splicing signals |
AG-GT |
circRNA sequence |
NA |
Genomic sequence |
GGTACTGAATCCGTCATAGGTATATCGTTTGACATTTCGAAGATCGAGACGTTATCTATAAGCAAGCGAGCCTTTAATAGAATGCGTAATCTCAAATTCTTAAATTTCTATAATGGAAGTGTTAGCTTGTTAGAGGACATGGAATATCTACCTCGTCTAAGGTTACTTTATTGGGGTTCATACCCGAGAAAAAGTCTTCCTCTGACATTTAAGCCAGAATGTCTCGTCGAACTCTATATGGGATTCAGCAAGTTGGAGAAGCTATGGGGAGGAATCCAGGTTGGTATTTGATACTTGTGATTGTGAATACGTTTGTTTACCAATGATATTTAACCTTAGTATGATATTCCTCATTTTTTTGTGTGTTTGACATGCAGCCCCTCACAAATCTAAAGAAAATAAATTTGGGATATTCCTCTAATTTGAAAGAAATCCCAAATCTTTCGAAAGCCACTAACCTCAAGACGTTGACGCTTACCGGTTGTGAGAGTTTGGTGGAGATTCCATCCTCTATTTGGAATCTACAGAAACTGGAAATGCTGTATGCGTCAGGATGCATTAAGCTACAAGTTATTCCCACCAACATCAACTTAGCATCTCTTGAGGAAGTCAACATGAGTAATTGCTCACGTCTGAGAAGTTTTCCAGATATATCTAGTAACATTAAGCGTCTCTATGTAGCAGGCACAATGATTAAAGAATTTCCTGCATCCATTGTTGGACACTGGTGTCGTCTTGATTTTCTTCAGATAGGCAGCAGAAGCCTCAAGAGATTAACACATGTCCCAGAGAGTGTAACACATCTAGACCTACGCAACAGTGATATAAAGATGATCCCAGATTGCGTCATAGGTCTTCCGCATCTAGTATCTCTTCTCGTCGAAAACTGCACAAAACTGGTGTCAATTCAGGGTCATTCCCCTTCGCTGGTGACCCTATTTGCAGACCACTGTATATCACTCAAGAGCGTATGCTGCTCTTTCCACGGACCAATCTCGAAATTGATGTTCTACAACTGTCTGAAACTGGATAAGGAATCAAAAAGAGGAATCATACAACAATCGGGTAACAAGTCTATATGCTTGCCAGGTAAAGAAATCCCTGCAGAGTTCACTCACCAAACTATAGGGAACTTGATAACCATCTCCCTGGCTCCAGGTTGTGAGGAGGCTTATTCTACGTTCTCAAGATTTAAGGCTTGCCTCCTGCTTTCGCCAATCAAGAATTTCGCATTTAATAAGATAAATTGTTTTCTAAGAAGCAAAGGTGTCGAAATTAGTCGCACTACAGAGTCTATATATCCTTTTGTGTCTGGTGGATCTCTATCAGAACATCTGTTTATCTTTTGTGGCGACTTATTTCCTGAAGAAAACAGAAGCCTTATGGACGTGACTCCGAACGAGATTCTGTTTGATTTCAGCTCCAGTGATGTCGAGATTGTGGAATGTGGTGTAAAGATCTTTTTAAGTAGTGGCATTGAAGTGGGCTACTGTGAAACTGGAGGCAACAGAAACCACCACATAGATGGAGAAGCAGAAGCGTTTAAGGTAACTCAAGTTGAAAACAGTAAACATACAGGCCACTGGAGTTGGCTTAGGAAGCTTCGTCTGGGGAAGAAGAAGATGAAGAATAATAAGACAGAGCTTAGTTCGAGACCAGTCTCAGGATTTAGTGATCTTACTCGGGGAATCTTTATAAGGTATCAGGAGCCTGAAGCTGTTGAGCTCACTAAAGATGAAAGAATCACAGATCTTTCGAGTTTACTATGTATTGGTTCCCTTGTGGTCTGTTTTTTTCTTTCTGTTTTTTTCGGGCAACCCCTTGTGGTCTCTGTTTTGTTGCTTTTTTCTTGCTTCTTTCTTCAGATGCAATGAGCTGCATCACAGACAGATCTTGTTGTGTTTGTATGTGCGAAACAAAAAAAGATTTCAGTTTTCTTGTTCTTATATATACTCCCTCTGGGAGAGGCCTTGTTAATCTATCCAAAGAAGCACGATGCTCTTTGGTGCATTGGGGATGCTCATACTTCATATGGGGTTTTGACTCCTGATCAAACTGAGGCTAGAGATCACTTTGAGAAAGCTACTCTGCTTTTTCAACAAGCTTTGGAGGAGGTAATTAGTCTCTTTCTTTTGTAATCCTCACCTAATCAAAGTGATTGTTATTTGTTTTTTGTGCGTGGTGTTTTGTAATTTGAGATGTATATTTACGCAGCAACCGGAGAATGCTCACTATGCGAGATCACTGGAATTGGCTTCCAAGGTACATCTTTATTGTTAAAGTTTCCTCAAATTTGTCATGTTTCATCTTTTGGTTCTGGTTTAAGAAACTGAGATCTACGTGTTGTAGAGGCTTATCTAGTTGTCTTAGCAATAGGAACTGCGAGGTGGTTTGGTTTGATGGATATATATATAATCACTCATAGACGGAGAAAAATGTATCTGAATCATACCTTTATGCCTAGATATGAAGTTTCTTTAGTGTAGAATAAACTCATTGTACAGTGAAGCAATGGTTATGAATCTTTGGTTTTTGTTCGTTAGACCAATTCTCCTTCTATTTGTGCAAAAATGCAGGGTCCAGAACTAAATACAGAGGTTCACAAACATGGTTTAGGTCCACAACCATTGGGCGGCACCGCAGGACCACCATCTACCAGTGCGAAGGTATTTTCTTTTCTTCAAATATCCCAATTGGTTTGATGAAAATCTAACATTTTTGTTCTTTCTTAGATTACTTTGAGAAAGCTACTCAGTTCCTACAACAAGCTTTTTTTGTTTGCTCTCTTTTTAGTATTCATCAAATTCAGATGAGCTTTAATGATAAGGTCATATTCGTTTGATTGAATCTGCCTGAAAATGTGAACTCTTTATGTTAGAATTTCAAAATACTCTTGAATTTGGAATATTCTTTTATGTATGTATGTATGTTAAGATGTACAGTTTTCTCTATTAAAAAAAAAAAAGATGTACATTTTGTTGAAATTCGAATTGGGTGGTTTGTTCGAATTACAGGAAATATCACAGTTTCAGAAAGTCGAGAGTCAACAGACTCTCGAATTATTCACCTAGTTTTGAAAATTTTGTCTTTATTAGTTCCATAATCAGAGGAATTTATAACTTATTCTCGTTAGCACAAAGAAGCTGATGCCTATGTATGCAAACTTTACACAATTGATTTCAAAATCATAGAAGTCAAGGTCTTCGACGGCTGTGGGGACACATTGTTTGTCACTTTGTATTTTTCTGTAGAAATTTCTTTGGTGTTTCTTACTATAGTGATAGTGGGAAACACAGTGTTCTGTGGTCTTTGATGACTTTGGGGACACATGTTTGTTTTTTTCTCTTATCTTCTCATTTTTCCCTTAATATATAGCACATTGTGATACCTTCTTCTTCAAATCTCACTTTTACTCTATCTCTTATGGCTTTTTCATCACCGTCTGACTTCAAGAGATACCATGTCTTTTCGAGTTTCCATGGACCAGATGTCCGTAGTGGATTTCTCAGTCATTTACACAATCACTTCGAAAGCAAAGGGATCACTCCGTTCAAGGATCAAGAGATCGAGAGAGGCCATACGATCGGACCTGAGCTCATACAAGCGATTAGAGAATCTAGAGTCTCGATTGTGGTGCTTTCGGAGAAGTATGCTTCTTCGGGCTGGTGCTTAGATGAGTTGGTGGAAATCTTGAAGTGCAAAGAAGCTTCGGGGCATGCTGTGATGACTATTTTTTATAAAGTTGATCCGTCCAGTGTACGGAAACAGTGGGGAGACTTCGGAAGTACTTTCAAGAAAACTTGTGAAGGGAAAACCGAGGAAGTGAAGCAGAGATGGAGCAAAGCTTTGGCCTATATAGCAACCGTAGCTGGAGAACACTCTCTAAACTGGTTTGTTGATTAAATTATAATGCTTTTATCTTTCTAAATCGATGCTTCAACGGTGGAATTTCTATGATTTAATTAGACCCACCAACTTGATTTTGTTTGCTTTTGTTAGGGATAATGAAGCAGAGATGATCCAAAAGATTGCTATAGATGTTTCAAACAAACTTAATGTTACACCTTCAAGGGATTTTGAAGGGATGGTGGGACTTGAAGCTCACCTGGCGTAACTGGACTCTTTGTTATGCCTCGAGTGTGATGATGTGAAGATGATTGGCATTTGGGGTCCTGCGGGAATTGGTAAAACTACCATTGCTAGAGCTTTGTTTAACCAACTCTTTACCGGTTTTCGGCATAGCTGTTTTATGGGGAACATTGATGTTAATAACTATGATTCGAAGCTGCGTTTGCATAACATGCTTCTTTCGAAGATCTTGAACCAAAAGGATATGAAGATACATCATTTAGGCGCAATTGAAGAATGGCTACGTAACCAAAGAGTGCTTATAGTTCTTGATGATGTGGATGATCTAGAGCAACTAGAGGTATTGGCTAAAGAAAGTTTTTGGTTCGGTCCTGGAAGCCGGGTCATCGTTACCTTGAAAGATAAAAAGATTTTGATGGCACATGGGATCAACGACATCTACCATGTGGATTATCCGTCCCAAAAAAAAGCTCTTGAGATATTTTGTCTTTCTGCTTTCAAACAAAGTTCTCCACAAGATGGTTTCGAAGAGCTTGCAAGAAAAGTAGTAGAGCTTTGCGGTAATCTTCCATTGGCTCTTCGTGTTGTGGGTTCTTCTTTTTATGGGGAGAGCGAGGATGAGTGGAGGCTTCAATTGTATGGGATAGAAACTAATCTTGATAGAAAAATTGAGCATGTCTTGAGAGTGGGGTATGACAAATTATTGGAGAAACATCAATCTCTGTTTCTTCATATTGCATGCTTTTTCAACCATGAAAGTGTTGATTATGTGTCAACCATGCTCGCTGACAGTACTTTGGATGTCGAAAATGGGTTGAAGACCTTAGCCGCTAAGTCTCTTGTGCATATATCTACTCATGGGCTGGTAAGGATGCACTGCCTACTACAACAGTTGGGTAGACAAGTAGTTG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