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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_027421
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:16095973-16107713[-/-]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence CTGGAAATTTTTTAGCCTCTGAGCAGTTTCGCCTGCAAGCCAATACACGCCTAGAGAGTGCTCAAATCTCGAATGTACAGCTCCTGGATATACCATGTTTTCTCAATGAATAATTAATGTAGTCATATATTTAGCTAACAATAGTTACCAGCAAGTCTCACAGTCTGAAGATCATGATTGTCAATACCAAGCTCCATTCC
Tissues root, leaf, aerial, inflorescences
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTGGAAATTTTTTAGCCTCTGAGCAGTTTCGCCTGCAAGCCAATACACGCCTAGAGAGTGCTCAAATCTCGAATGTACAGCTCCTGGATATACCATGTTTGTCACTCCTGAACCATTAAAGAAAAACTCCTCTCAACGAAAGAAGATACACAACTCAAGACTCATTTCTGTTAAAACTAGAAACCTTAACGAAGAATCTCCTTAAAGTTTTCAAGGAAAATTTCCTATATTTGACAATAAATACATGTTTATCGATGGGGGGAAAATAGACATAACAAGACTGTCTTCTTCGTTAAACAAGAGGAGAGGCAACTTGAGTTGAAAACGCAAGCCAACTCACCAAGTTGCTTTAGTTCACGAAGCCTGAAACAAGGAATTAGAATAATGAATCAGAACACTGTGGTTTTAGCAAGTCATTCATTGAAGGAAACAAGCACAATCCAAGACTTTACCTCTGAAACTGCTCAGTGTCAATGAATTTTAAACAAAGCTGCAAACCAAAAAGTGAACTATTAGTACAGATGCCATGTTGAGTCAATAGTAAACTACATTTGGGAACTATTAGTAATGAGATTCCATAGACATATGAACGTAGGCACTCTAGTGGTTTAGAGAATATGAAAACTCTTGTTTACACAGAAAATACGAAACAATTTTAGCAAAAGCCATTAACACCAGTAAATTTTTGCAGTTGGTTCATCAAATTAGTCTCCGACTCAAAACTCAACCATACATTTCATAATTTTCCGGTAAACAGCAATCTCTAATCCATCCGTGACTCGATAGTTCAATTAAATTCCGACGAAATCACGGCGATGAATGTAAGATAAACGAAGATAGTATCCAGATTCCAACTAGAACAAACGGCACCGGAATTTCAACAGAAATCTCCATAGAAACAGTTCTAGAGCGTCGCTCCTTATCTCTCGCAAACGAACCATTAGGAATCACAGAAACAGGAAACGAAGATGATTATAAGGAAATCAACCACTTACAGGATCGAGATAGATGTTTCCATGAACGTTATCGTAGACATGCTTGCTGAACCGGAGCTCGTTCGCCGGAGCGCCGGAGGAGAACACCGGTAAACTACTTAGGTTTTCGTCGCAATACGCTCCCATCAGTTGAAATTTCACGTCGAACTCACTCACTCGCCGCCGTGAAGCAGTTACGTTGAGAGAAACTGAAATGGGTACAACGACGAGAATTGAGAAAGCGATTTTAAAAGCTGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGTAATGATCTTTATTAAATTCCTTTTTGACGTTTTTATGCGATTAATATTCCACTAAACCTTAAATGAAAGGAAAAGTTTCGAATAGATCCCTGTACTTTGCTAATATTCCAATAAATGTGCATATATTTAAAATTACTTAGATTAAAACCTCAACTTCTATTCCGAGTATTTTTTGGCAAATATAATGACAGCAAACTGAATTATCACGGATGTGGCATATGCTCATGCATTTTGACTTGATTCTAGTTAGAAGATAATTTATGATTATCATGTGAGATTAATTTTATTTAATATTAACCTTTTCTGATTATCATGTGAAAAACCATTTTTGTTAAATTATTGGATTTGAATTCCATTAACAATAGATTTATACAATTTTATTTTTTTGATTCTAACAAAATAATGATTTAGATAGTTTTGATATAATATCTTTTTTTTTTTAATCGCAATTGTTCATTTCTTTGCATAAAGTAAAATCTAATTTTTAAAAAGAAGCAACTTTTGATAACCAAAAAAAAAAAATTGACAACCAAACTTGCAATCATAAGACAAATCAGCATTTTTGTAAAAGTGTGAGCGTTTTGGCCAATATATTACATAACTTCTAGTTTGTTGTGCATATAGTTTTAGTAAAGGGGTTTCTTTGTATTAAATGGAAAATATAGGGCTATATCGCAAATTTCGTGTTTTAGGTAGAGGTTGTTTAGGTGGTGGACTGGTGGTGGAGAAGTGGGTTTATGGTGACGGTTCAGAAAATCCGGAGGATGATCATCGTATCTCAACCGATCAGTTACGGGATAAATTAATTTTGGTATCGTTAAAACAAATCGAACCGGCATTTACCAGAACCAAATTGGTATTTTATAAAAAGACCCATTTACGTGGACGCTCGAGCACGTAAGCCCAAAACCAGATTATTGTGTTTATGAATCCCTTCTTTCTCCTTCTAGGGAATCGATTTATTGCTGCTCTCAAATCTTCCCGGGAAAAACACCGGCGCTGTAATTTAATTGGTGTGGCTCCTGATCTCTTATCTAATGTTCTATACTTGGCTGTTGATTTTGAATATTGTTTTTGCTGCTCTTCTTTTAATGATACTTGGCTCTTCTTATCTAATAAAAATACTTTTTAAATTACTACTTTAATACCTTCCATCATTACTATAAACTACTCTTACCTTCTCTGCTTCGTTAGCAGAAGCAAACTCAACAAAGCCATCGCCCACATGCTCGCCCGTGTAGTCTACAATAAGTCGAACATGTACAACTTGTCCAACGTCTTTGAAGAAATTGATGCTGTAAAACAAAGGATAAATATTAGTCATGAAAAATTTGCTCCAGTAAAATGAAAGAGAAAATTATCGGTGCTACTTACATATCTGATATTTGAGCTTCCGGAGAGAGACGGGAAACAAAGAGCGTCTTTTTTCTTACAGCAACTGCCTGAATATAACAGCCAAGTGTGTTAGCTCGACTCTTTAAGGAGAAAGAAAGAACTAAAATTGCATAACAACAAAAGTAGATTCATCCCCCAAATAAGTCATCTTTCGACTTTGTGGCAACAGTTCTGTTATTAAATATCTAAGCCTGACATATTTTGAAGATAATAAGAACAGGTACCTCAACAAAATTGGGAGTTTCATCAAGTCCTTCCACTGCTGTCTCATCTTATTCTATCACAAGGTTTTGTCGTCGAAGGTAGTCTTCGTAACTGAAACATCAAAAATTCTAGTGATCTCATACCAAGAACTACACCCAATGTGCTCATGATAACAAAACTCACAAGGAAAATAGTTAAATCCCTTACCAAAGCTTCTCTGCAAGGTTGTACCTAGTTACCAAAAATAATAGCGTTAGTCTTCTGTAAGGGTATCAAAACTCCAGGAATAAGTCACAACCAGTGTTACAGAAAACGTGAAAATCAATTTACTTGGGTCGTGTAGGGTATGGAGCTGTCTTAGCCACTTGAAGAAAAATCTGATGATCATGCAAATATTCACCATTCTTCTTTTGCAGCGCCTACAGTATAAAAGATTTAGTCAGCAATTGTACTTTTCAAATGACTACTTGAATACCTTTTTCATAATTACAACAAAACTACTCTCACCTTCTTTGCTTCGTTAGAAGAAGCAAAGTCAACAAAGCCATAGCCCACATGCTTGGTTTACAATAAGTCGAACACTAACAACTTCTCCAACATCTTTGAAGAATTCTTTGCTGTAAAAGTGAAGGATAAAATATCAGTCATAGAAAACTTGGTCCGAGAATGAAAGTGGAAATTTGAGGTGCTACTTACACATGCAATATTTTAGTTTGGGGAGAGAGATTGGCAACATAGAGTACTTCCTGAATTCAAAAAAATAGAGATTGGCAATATTTTAGTGTGTGAATAATATTCATCCCTAAAAAGAAGTCATCTTTCGACTTTGTGGCAACAGTTCTGTTATTAAAATGTGTGAGCGTGACATATTTTGAAGAGGTACCTCAACAAAATCGGAAGGTGTCTCATTTTCTTCTATCGGAAGGCTTTCTCGTTGAAGGTAGTCGTTGTAGCTGAAAAATTAAGAAAACCTAGTGAGCTCTTCATGTATTCAAAAATTCAACCAGTGTAATCAAACTCAAGAGGTAAATAGTTAAAATCCCATACCAAACCGTGTAATCTATGCAATACCTAATTAACAAAGTTAAAAGCGTTAGTCTAGCAGTAATATTGTATCAAAAGCTCTAACAGTAATTAATAACCAGTGTCACCAGAAACAAATGTCAATAACATGGAAAATTGAATTTACTTGAGTCCTGGAGGTCGTGGACGTCGTGGAGGCTGTGGACGTCGTGAATACACATAAAGAAAAATCTTATAATCGTGCAAATATTCACCGTTCTTCTTATACAGCACCTACGGTAATAAAGAGTTTATTCAGCAATCGTACATTCAAATTGAAACTTAGATACACTATATATTTTTCATCATAACTAACTATAAACTAGTCTAAACCTTTTTTGCTTCGTTAGCAGAAGCAAAGTCAACAAGGCCATAGCACCTATGGATACGCTTGGCGGTTACAAAAAGTCGAACACGAACAACTTCTCCAGCATCTTTGAAGAAATTGATGCTGTAACAAACAGTGTAAGGTAAAAATATCAGTCATGCTCAGAGAAGGAAAGTGGAGATTGAAGATGGTGCTACTTACATATCTGATATTTTAGTTTGGGGAGGGATATGGCCATTAAAGAGCGTCTTTTTTGTCACCTGGATTTAACAGCCAAGTGTGTTAGCACAAGATTCTTAATTGAACAGAAATTTGTACAAAATATCTAGCAAATCCGTTGGTTGTTTCCTCCTGTTACATATGATACAAGATCAAAGAGTAGCCATTAGAAGAAGACAGTGTAAAGAAGATTGTTTTGTCAAAGAAGAAGAGTAATACGAGGCCATCTTAGGGTTACCTTATTCTACTTATGTCTCTTGAGAATGGAATTGGTCACCAAATCATCTTCTTCAGGGTTACGCTTACCTAAAAGAAGAGCAACAAAAAAAAAACTCTTGAGACAAGTTTAACACATTAGATAAAAGAGAGAGAGAGAGAGGCAACCAAAAACAAACCCAATAAATTGCTACTAGAAGTGGCCATGGAGAAGATGAAACGAGGTTTATGTATTTTTCCGTTAAGAGCAAGCAATAATATAGCCCTAAAGAAATATAGACCTAGCCTAGGAAGAAGTTTCTAAGACCATCCTTATCAATGAACT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