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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_027414
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:16094108-16105867[-/-]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence CTGAGAACAGATGATATCTTGAGGAGTGACAGCTTTGAAATGATCGATTTTGTCCTTTGGAACCGCATATTCGTTACAGAACTGAAAGTCAAAATTCATATTGTTTACCATTCAAGAGGATTTTCTCTCCCACGAGCTAAATCAATCTTGACGTTTGTAACAGCTATATCTTCTTCTTTTAGTGTCAAGCTTGTTTGCTT
Tissues leaf/aerial, inflorescences, seed
Exon boundary Yes-No
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTGAGAACAGATGATATCTTGAGGAGTGACAGCTTTGAAATGATCGATTTTGTCCTTTGGAACCGCATATTCGTTACAGAACTGAAAGTCAAAATTCATACAGGTCAATCTTCTGAAGGGAAATTCTTAACCTAATTAAGCATAAAAGAAAAAGAAGAAACTGGGTGAAAATTTTATATACTTGGTACAACTGCCTTCTGCGAACACGGAGTATCAGCTCTTTCGCTTCTGCAAGTTCTGGATCTGGAGCTATTTCGATAGTTTTGAGGATTGTGTCGTCTAACTGCATTTGTTTATGGAGAACAAAAACTATGTAAACAAGCAGAAAGGTAATATTTGTCTTCTGAGGAAGAACTGTACCTTCCAGTATTCAGATGGGTCATTAATCATAGAAGAAATTTCCAAATGATTGTTGGCTTTGACCATGGCATCTACTATCATCAGCTCTATCGCCTGCAAATGAATGGAACGAGACAAGTGGGAAAGAGAGAAAGAATAGTCAAGGTACAGAGAGAATGATAATGGTATAATACCTTTACTTTCGAATGCGTGTAGACGGTTCGATAAAGATCAGCTCGAGTTGCAAATAACTTGTGGACACTAAGATCTGAAAAATTAACCGGGTTTAAAATGGGATAGAAGCAAACGCAAATAGAGAATTTAGGTGGGCAAAACTTACACTCCTTGGCGCGGAAGCAGATTTCATTGTCCAGGACTCTCATCGTCTCTGTCAGTCTAGAAAGTTCTAATAATTAGCAATTTCCTTATTAGAAACCAGTGAAATGACTATAGAATAGAATGAAGACCTTTGGAATTGAAAATTGGATCCCAGTCCACAAGCTCGAGAATCACGGACAAGGTAGTCAAACCTATAAATATTTGCAGACATTAAAAGTTGATGTTGTAAGATAAAGGTTCAAATTTACGCACCATGATGAGTGAAAAGGGAAAGAAAGAAACTGCAGACAAGTATACAGGTAAAGAATTACTTGTCCACATCAATCCCATTTCGACCATTAGCAACAATATCATACAAGAAACGCTTCTCTGCATTGCCCTGCAAATTATGAAAAAGGGAAAATATATACAAAGCTTAAGTAGTTGTTCATGTTTGATTAGAATAGAGAACATACTTGTTATAAAACTTACTTTCAGCTGTGAAAATTCAGTACTAGCTAGTATCATGTCCTGGTCAGTTAACATTAGAGAAAATCATCAGCAAAGAGACAAAGGAAGCAATAAATATTAAATTGGATTTGTAAAGACTGGAAATAATGTCACAATTTCCAGTTTCAAATAATAGAGGCCATTTGAGGGAAGCAAAACAGTCTTAAGAAAGAAAGTTACCTTCACTCTTTTCAGCATTTGAGCATCAATATCGATGTGATGTGTATCAACCATATGGTCAATCATGTTTACAGACATTAACTCATGAGACCTGCATCGAAGAATTGGCATATAAAGAGCTAGAGATAATCCATAGAAGCCAACTACTAAAAGTTAAGGCATAGTTCTTATAATATCAAGTAACACCATGGCATTGATCTTTTCAAGGAATGTGCAAACATACCACTGACAGTCACTTATGACCTTTGGAAGGAATTCACGCTCAAACATATGACTGAAAGGCCCATGGCCAATATCATGGAGAAGTCCTACACATACAAACAGATCAGAAATTGTATCAAGGAATAATGTAGTCATTGAGCTAATAATAGTTACCACTTACCAGCAAGTCTCACAGTCTGAAGATCATAATTGTCAATACCAAGCTCCATTCCCTATAGAAAGTTAAGCACGTACATTACAAACCTTACCATACTTAAATCAAAATGTGACTGCACCACTGAAATCCAAATTAAAACCTGGAAATTTTTTAGCCTCTGAGCAGTTTCGCCTGCAAGCCAATACACGCCTAGAGAGTGCTCAAATCTCGAATGTACAGCTCCTGGATATACCATGTTTGTCACTCCTGAACCATTAAAGAAAAACTCCTCTCAACGAAAGAAGATACACAACTCAAGACTCATTTCTGTTAAAACTAGAAACCTTAACGAAGAATCTCCTTAAAGTTTTCAAGGAAAATTTCCTATATTTGACAATAAATACATGTTTATCGATGGGGGGAAAATAGACATAACAAGACTGTCTTCTTCGTTAAACAAGAGGAGAGGCAACTTGAGTTGAAAACGCAAGCCAACTCACCAAGTTGCTTTAGTTCACGAAGCCTGAAACAAGGAATTAGAATAATGAATCAGAACACTGTGGTTTTAGCAAGTCATTCATTGAAGGAAACAAGCACAATCCAAGACTTTACCTCTGAAACTGCTCAGTGTCAATGAATTTTAAACAAAGCTGCAAACCAAAAAGTGAACTATTAGTACAGATGCCATGTTGAGTCAATAGTAAACTACATTTGGGAACTATTAGTAATGAGATTCCATAGACATATGAACGTAGGCACTCTAGTGGTTTAGAGAATATGAAAACTCTTGTTTACACAGAAAATACGAAACAATTTTAGCAAAAGCCATTAACACCAGTAAATTTTTGCAGTTGGTTCATCAAATTAGTCTCCGACTCAAAACTCAACCATACATTTCATAATTTTCCGGTAAACAGCAATCTCTAATCCATCCGTGACTCGATAGTTCAATTAAATTCCGACGAAATCACGGCGATGAATGTAAGATAAACGAAGATAGTATCCAGATTCCAACTAGAACAAACGGCACCGGAATTTCAACAGAAATCTCCATAGAAACAGTTCTAGAGCGTCGCTCCTTATCTCTCGCAAACGAACCATTAGGAATCACAGAAACAGGAAACGAAGATGATTATAAGGAAATCAACCACTTACAGGATCGAGATAGATGTTTCCATGAACGTTATCGTAGACATGCTTGCTGAACCGGAGCTCGTTCGCCGGAGCGCCGGAGGAGAACACCGGTAAACTACTTAGGTTTTCGTCGCAATACGCTCCCATCAGTTGAAATTTCACGTCGAACTCACTCACTCGCCGCCGTGAAGCAGTTACGTTGAGAGAAACTGAAATGGGTACAACGACGAGAATTGAGAAAGCGATTTTAAAAGCTGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGTAATGATCTTTATTAAATTCCTTTTTGACGTTTTTATGCGATTAATATTCCACTAAACCTTAAATGAAAGGAAAAGTTTCGAATAGATCCCTGTACTTTGCTAATATTCCAATAAATGTGCATATATTTAAAATTACTTAGATTAAAACCTCAACTTCTATTCCGAGTATTTTTTGGCAAATATAATGACAGCAAACTGAATTATCACGGATGTGGCATATGCTCATGCATTTTGACTTGATTCTAGTTAGAAGATAATTTATGATTATCATGTGAGATTAATTTTATTTAATATTAACCTTTTCTGATTATCATGTGAAAAACCATTTTTGTTAAATTATTGGATTTGAATTCCATTAACAATAGATTTATACAATTTTATTTTTTTGATTCTAACAAAATAATGATTTAGATAGTTTTGATATAATATCTTTTTTTTTTTAATCGCAATTGTTCATTTCTTTGCATAAAGTAAAATCTAATTTTTAAAAAGAAGCAACTTTTGATAACCAAAAAAAAAAAATTGACAACCAAACTTGCAATCATAAGACAAATCAGCATTTTTGTAAAAGTGTGAGCGTTTTGGCCAATATATTACATAACTTCTAGTTTGTTGTGCATATAGTTTTAGTAAAGGGGTTTCTTTGTATTAAATGGAAAATATAGGGCTATATCGCAAATTTCGTGTTTTAGGTAGAGGTTGTTTAGGTGGTGGACTGGTGGTGGAGAAGTGGGTTTATGGTGACGGTTCAGAAAATCCGGAGGATGATCATCGTATCTCAACCGATCAGTTACGGGATAAATTAATTTTGGTATCGTTAAAACAAATCGAACCGGCATTTACCAGAACCAAATTGGTATTTTATAAAAAGACCCATTTACGTGGACGCTCGAGCACGTAAGCCCAAAACCAGATTATTGTGTTTATGAATCCCTTCTTTCTCCTTCTAGGGAATCGATTTATTGCTGCTCTCAAATCTTCCCGGGAAAAACACCGGCGCTGTAATTTAATTGGTGTGGCTCCTGATCTCTTATCTAATGTTCTATACTTGGCTGTTGATTTTGAATATTGTTTTTGCTGCTCTTCTTTTAATGATACTTGGCTCTTCTTATCTAATAAAAATACTTTTTAAATTACTACTTTAATACCTTCCATCATTACTATAAACTACTCTTACCTTCTCTGCTTCGTTAGCAGAAGCAAACTCAACAAAGCCATCGCCCACATGCTCGCCCGTGTAGTCTACAATAAGTCGAACATGTACAACTTGTCCAACGTCTTTGAAGAAATTGATGCTGTAAAACAAAGGATAAATATTAGTCATGAAAAATTTGCTCCAGTAAAATGAAAGAGAAAATTATCGGTGCTACTTACATATCTGATATTTGAGCTTCCGGAGAGAGACGGGAAACAAAGAGCGTCTTTTTTCTTACAGCAACTGCCTGAATATAACAGCCAAGTGTGTTAGCTCGACTCTTTAAGGAGAAAGAAAGAACTAAAATTGCATAACAACAAAAGTAGATTCATCCCCCAAATAAGTCATCTTTCGACTTTGTGGCAACAGTTCTGTTATTAAATATCTAAGCCTGACATATTTTGAAGATAATAAGAACAGGTACCTCAACAAAATTGGGAGTTTCATCAAGTCCTTCCACTGCTGTCTCATCTTATTCTATCACAAGGTTTTGTCGTCGAAGGTAGTCTTCGTAACTGAAACATCAAAAATTCTAGTGATCTCATACCAAGAACTACACCCAATGTGCTCATGATAACAAAACTCACAAGGAAAATAGTTAAATCCCTTACCAAAGCTTCTCTGCAAGGTTGTACCTAGTTACCAAAAATAATAGCGTTAGTCTTCTGTAAGGGTATCAAAACTCCAGG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