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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_027347
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:15658461-15670552[-/-]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence CACCATTTTTGAGGTCGCCAATGGCCACACAAAAGTCTTGAAGTGGACTTGGATCATTAGCTTCGGCAAAGGAAATGACCAAAGCCGATAAGGTAATCAGACTTTGTTATTAGTGATTCCTGCTTGGTTGAGGCCTGAGGAAAAGAAATCTTCTGCCTTTGCTTGCTTTGGATCCTTGCAAAACTTACCATTCACAAAAA
Tissues root
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CACCATTTTTGAGGTCGCCAATGGCCACACAAAAGTCTTGAAGTGGACTTGGATCATTAGCTTCGGCAAAGGAAATGACCAAAGCCGATAAGGTAATCAGGATGAGAGACTTGGAAAACCTCATTTTCAAACAAAAGGTTATGCTAATCCTTTTTTGAGACTTTTATAAATGTATGTGTTGTTTGTGAATTGTGAAGCATTTGAGTTTAGTATTTATAGGACAAAAAAGCGCATGTCGTATTTGACGTGGTCCAAGATATTATCTACATATCTTGTAACTCGCATGTTTCAAAGTGGCAGTTCAAAAATGTTTAACAAGTCTATCGATAACTTCAATCTATATATTTTAATTAAATTGGATTTACATGACTATACTAGATTTTAACCCGGTACACCGCGAAAACAATTTTTTTTTTTTAAATCAGTATATATAAAAGTTTGCAAATTATATCTATTTATAAATTATTTTTATTTTATAGTTTACTGTTGTTATTAAGTAACGTCCTTCCAAACCCGTTCCGCCAAACCCGTCCCGTAAAAAAACTCCGCAGTACACCGCTAATTTAAATATATAATGAAAATAAATGTTTTACGGGATTGCAATTGTATTTTAGTTTAACAAACAAATTTTTGTTTTAAATAGTTGTCGAAATCTAGTTCAAATTTTGGAGAAATAAGTTTAGTGAATTGATAAGAAATGAATTTAAGTGTGTTTTGCTCATTTTAAGGGATTGCAATTGTATTTTGGTCTGTCAAATATTTTTTGTTTTAAATAGTTACCGAAATCTAGTTCAAATTTTGGAGAAATTTGCGTGATATATGGGATTGAAATATATTTGGAATGTTTTTTATTTGTTAATTAATTTATTGCAAAAAAAATTCAATAATTAAAAGTCAGTGGCAGCCATTGTAAATAAGTTCTAACTCCATGATTTATTTCACAAAATGGCTGCAAAAATGTATATATAGATACACAAAACCACAGCCATAGCTTATGTTGATTTGTACTAGTTCAAAAAGTTTCCGAGATACGAGACACGACTATTTCCACTGCAACAAATGGTAGTTTAAGTAACATAGCAATGGATCAACTGATGTGACTTGGAGATTACCATGACGCGAATTGAGGGCGCCAAAGAAGCCATATTTCCTCCAAATCAGAGAACTCGTAGTTTCATTCCAAAACTTAAAATGGAAGTGATGGTTAATTATAAACGAGCCATGACATGGATCTCAATAATAACACCAATTATAGGCTTGTTAAGCTTCTAATGATTTATAGTGACTAATATGTACTTAATTTTCTAGTACTTTGAATGATAAACAAGAATTTTTGGCAAGAATTGTTTAGTTCAATAAAATTTGTCAATATACAATTGTTTTTTTTTGGGTGCAAATTGTTCTAAATTTTTTCTTTGAGTAGTGAATCCAAAATTATCTGTTGTGCTACGAGTGAAACATCTCAAACATAGTAAATCTAGGGTGTTCACGAAAACGAGAATGGTGATAAACTACGGTAATTGCAGTTGTGACATATTAACTGTTATAAATGCACCAAGTGGTTCTTGGTGTAGTGGTTTCCGTAAGAGAGAAGCATCCTAGTTCGTGTCACCTGCAAAAACAAATATTTTTGAAGGAAATAGACTAAAGACTATTTATGGGTCCACGAATATTAGGATTTAAATGGTTGTGGCGGTTAGGGCAAACAAATCTGTTTAAAGTTTAGACCGTTTTTTGTTTATTATTCACAAATTTTAGTCCGTAATAGTAAATTAAAAAAAATAGAACAAGTTCGCGGCGTACTAACTACATACCGCTTTTATATAGAGAAAAACTTGGTCCTTAGCAATTTGTTCTCAAAATAGAGTGGTCTACTCTGCTAGCGGTTTAGTCAGCTTTATCCATAGCATCTATTCAAAATTTTAGAGTCTTTAACATTAAAACCAAAAAAAGAATATAAGAGTTTCTTTCTTCCTGGACAAAAAATACTAGAGCCTAGGTTCAAATCTTGGAAAAAAAAAAAAAATGTATTGTTTGTCAATATTTAGTCTAATGTTCAAAAAAGCGGTATACGATAAATAGACGGTGAATCATTGCCTAATGTCTATAATGTCTAATCGAAATCTAAGCGATTTAGGCGTTTATAACATAAGCATATTAGATATTACATATAAAAATTTATCAAACAAAATTTTAGCCAACCCTTTCTTTTAATGTATATCAAATAATATATGAATACTTATAATTAATGTATGTAAATCAAATTTAGTTGAAAATTTGAAAAAATAAACTAAAACAAAATTTATGTAATTTTAGTCTTAGCGGTCATCTACACATCGTCTAAACGTCTAATCAAGACCTAGACAACCGTATACGGTATAGACTGCTTTTGAAAACACTTGGTTTGTCTAATAACGTTATCTTGAAAATAAATAAATTATTATTAGTCAACTTGTTAGTAACTACAAAACCGCCATCCAAAAATTATATACAAGAAGCCAAACAAAGATATTTTAGCAGATTTAGACAACTCAACTACCCACGTTATAGACCATGCAAGACTGTTAAGACTAAATTAGCAGATTTATGACATATTTATATCTTTGTCTTCTAGATATATGATAGATAGAATTACAGCATTTTTTGAAAATCTGCTTTGACGTAGGTAAAACTAGAGCATACTTATCTTTGACCACGTCAAGTTTACGTTTACCGGAAGACTTGCTTAATCTGCCTTGATAAGCATATTTACAACTAACACGAACAAGTCTTCTATGTAAACGTCTGCTTTTATTTTAGATCGACTGCTACTGGTAGAATAATATAAAAAACGTTTACGTGCATTGTGCTGATTATTTGCGAAATTCATTGGTCTTTTGGAATAGTTTTAACTTATAGTATGAAAAGACTAATTCAATGTTGTTTATTAGAAAAAGAGAGTAATTCAATGTAGTGAAAGCAGTGCTTTAAAATCCGATCTAGGCGGTCGCATAAACCTCGAGTAGGCTCTAGGTTCTCGGACAATGTCTAAACAACCATGTGCTTTGACCACTTAAAATCTTATATATTTTGTTTTAGTTTATTCATCAATTTCCAACTAAGTTTTTATTTCTATATAAATAGTTATATATGTTCATATAATATTTGATATAAATTAAATAAATATTTTGTCTAACTTTGTTTACATATTTTTTTTTTTTCATTTTCTCTAATAGATATTTTTATATGTTTATTATATTTGTAGTGTTTATGCTATAAACGCATAAACCACCTAAACTTTTTCTAAACCCGGATTAATATAGTTGGCATTGAATCACCACCTACTTAGCACCTGATACTTTCTTGAACATTGAGTAAAAATAATGTTAACACTAAGATATCAAATTAAGCGAATATAGTTGGTAAATCTTATTCTTTAAGCACTACAACAAAGACAAAAGCGAGGCCAAAATTTCCACCATGTACGTAAAGGTCACATAGAAACCAACTATTATATAATTTGTGTGTATATTGTTTCCAACAAGACATGCTTTATAAAACTCATGCTTCTATCAAAATGATACTTTGATTTATGTATATTCATTTCGTATCAGTCACATGATTTATCTTTATAATCTATAAAAAACAAAGAGAAATTCTTTAAAATATCATATTTTCTAATTTTGTGTCAAAAAATATTACTCTTAGCTTATTGATTTAAGAATACCACCGAAAGTTTTAGTTTCCAAAAATATCACAAACACAAAAATTAATTTTGGAGTATTGAGGATTTACAAATTTAATTTGGATTAGCTATTTTAGATTTAGGATATAGTTTTTAGAGTATCAGAGATAGTATTCAGGGTTTAGTTTTGAAAGTTAAAAGTTAAATTTTATTTTATGGTAATTTTGGAAAATCAAGACATAGCGGTATTTTTGAAAAACCAAAACTAAAAGTGGTATTTTTGAAACTTGTCTTAAGTATTTTTTATTTACTTAATAACCTTAAATATATATTTTCTTTGATGGCTTGTCTTTTTTTTTCGTTTTAACAACTCTTAAAGACTGAATATCCAATAAAACGTTAATATCCGGACATTTAAAAATGTTGTAAGACAGAATTCTATATAGGAAAAGTAAACTTATTATGAAATATCAAATTAGGTGATAACACCTTTTTATTTTATTAAGCATAAACCTTTAATCCGTGTTACATATTACTTAAGTGTTACAACGATAAACACTCAATATTGTGGTGACTAGATTTAGTTTTTAAACTTGGCCTCAAGGTCTTTGACAACATTGACATCTAACTGAAAAGCTTGAGCCAAAATATCTGGATTAATCGGAGGCGTTGACCCAAACACAGTATCTGCGATCGTGATGACACCAGCATTTTGACTACTTAGTCCAGCAAAGGCCACTGCGGGGGTCTTCCCGATATTCACTTGAAAATGGATCATTCCTATGGGGAACACGAACACGTCTCCCGGGTTCAGCACTTTGGCGAATAAACGGTTGTTGTCTTGATTCGAAGAGACAAAACCAACATATAACGTTCCTTCAACAAGAACAAGGATCTCAGTGGCACGAGGGTGTGTGTGAGGCGGGTTTTGACCATATGGCGCATAGTCTATGCGGACCAAGGATATTCCCAAAGTGTTTAACCCTGGAATCTGATCGACATTGACTGTTGTCACGTTGGATTTGACTTTGTTATTAGTGATTCCTGCTTGGTTGAGGCCTGAGGAAAAGAAATCTTCTGCCTTTGCTTGCTTTGGATCCTTGCAAAACTTACCATTCACAAAAACTGCAAGTAGAAATATTGTTTCGAAAAATCTTTTATTACAACTTCAAATTTAGTCATTAATAAAGGAGAATAATAGTTAATTAGTAGAGAGTTAAGAAACCGAGTTTTATACGCACCACCATTTTTAGGGTCATCAATGGCAACACAGAAGTCTTGAAGTGGACTTGGATCATATGCTTTGGCAATGGTGACCAAAGCCCAGAAGGTAATC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