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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_027323
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:15517283-15521015[NA]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type intergenic
Splice junction sequence TTTTAATTGTTCAGGGTTTGACTCAAACCGTTTGAGAGCTTGGTGTTTACTTGCAACCACATTCTTGGATTCTCTAACACAAGGTTGTAAGGCTGAATATGCACGTAAGAGACGTAGAGAACATACTTGTTGGAGCATCAAATGATTTCCTCCAAAGAAATTGATTAGATTGGGAAGACTAGTGTCTCGCGGCTGAATAG
Tissues root, whole_plant
Exon boundary No-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence TTTTAATTGTTCAGGGTTTGACTCAAACCGTTTGAGAGCTTGGTGTTTACTTGCAACCACATTCTTGGATTCTCTAACACAAGGTTGTAAGGCTGAATATCGTGTGAATCAGATAAGGAATAACTATTTTAACTTATCTTGAATCAATATACAATTATATTAATCGAAATAAGCTAGAGAAAGGTTTATTTGTCTGTGGTATAAGCAGTGGCATAAGTTGCTGGAAGAACTTGCACGATAGAGTAAAACAAGAATATCAACTAGCCACGAACTCCTACTTGTAAGTTGCCATTTCCAAATCTCAAGATAATTCTATTGGATCGGACAATTTGCCTTTGGTTATGTATGTATTGCTGGTCTTGTATACATTTGCACTGATGGAACACTGTTATTTGTAAACCGTTTTGGATTTTGTTAGCTTAAAGCACCGCAATCCGTAGCTGTGAAAAAATGTGAGAGATCAAGTTCTAGAGAAAAACCAAAAGCTAAGCAAGATTCAGATTTGTGGAAGTAAAGCTTTTGCATGATAATTCAATAAAATCATATTCAGGTCTTGGTTTCTTTCTATGGTTTGGAACTTATATAGTATGTTCTACTAGTTTTTGTTGTCTTCTCAAATCGGACGCAAATAATGTCTCGGCGTGCCTCTCTTATATGGATACACCATTCTGCTTATTTCAGATCTATCGCAATGGAGCATTAAAATGGTCGTGCGTCATATTTGCGTATGTTTCTTCAATCTTTCTTATTTCTTTTATGCTTAGTCTTTCGACTTACTTTCTCTTCTCTTCTTCAGACGTAGAAGATTATATTAGTCTCTCAAAAACAAATATTTTGTTTGAGTACTGTACTGATCAAACACCCATTGGTTTGCTTCACTTTTCACATTTCATTTTACTTTGATGCAGCCATTCGAGTCCAAAGTCAAGATCTATTTAGAGCAATCAAAATACACATTTTGAAAAGAAGTAATTGTTTAATTTTGTTATTGAGAATTTACTTGAAGTTTTGTGTTTTCTTGAATTGGGAATTTTTTTTTTGCAGGTCTTCTTTCATCCTTGCACGGTGAAGAACAAAGACTCTGCTTCCCTTTCCAGGTTTCACTTTGATTTTTATCAGATATTTGTCTTTGTGCTAATATATGGTTATGAAGTTCTACTGTTTCAGATGGATTTCGTTAATAAGTGTTCATGGGATTAATACAACAATCTTCAGCATTAATACAATTTTTCTTTTCTTTCACTATAAAGGATTCTTATTCGTTTGGTTGTTGAAAGATACCAAGAACTCTCATCAAAACTAGAGTACAATTTTCCATTGAAGTAGCAAGAGTAGATCTATGGAGGTGCTTTCCAGGCATGTTTTTACTATAACTTAATTTCATTTGTTTGATCCAACTTCAAAGCTTCATTGCTATAACTAATTTTTTCAAAACATTTCAGGATTTTGAAGTAACGTGAAGCTGAATATTGAAAATATGCAAAGACAAAAAGGTAACATATAGTTTTGACATGATATCTCTAACGATTATGCCACTTACATATCCATTAATTAGTATTCAATAAGTAACTTTGCATCCGAAACGTATATAACCATCCTAGTACTATGTTACAACTTCTTAACTAACAATTGGAGTTCAGGGTGTAAAGAAAGATCAATCCTTTTATTTGGGATGCTTACTGTCCCTTTTCGGTTCGAATTACATAGTTTCAATGAGCGTCCAAGAAATTTGATTGGGATTTTCGCAGGCTCGAGCGGGAATCAGGGAGGTTCACTTCCATTGACTTACATCGACAGCAGAAGGCAGTAGTCAAGGTGCTCTCCTGATTAGGTGATGAATCTTCAACCTTACCAACAAATGTCTTTTTTACCCTTTCTCTTTATACTAATTTTATTTTCCCAACAATGACCTTATCAAAAAGGTGGTGCTCTCGATAATTGACAAGTGTGGTCTTAGGTTGTTGGCTGTTGCTCTCGTTTGACATCGATACTCATAGTTTCAGTCTTCTTTTGTTTTTCTTTACTGCGTGGAAACAAATGTTCATTTGTTAGTGTTTTTATTTCCCTCCTTAGGTGGTGCTAGAGAAAACGAAGGAAAGCCTAGGTGCATGGTGCAACATATGGTAATTTGTTGGATTGTTGCCCCCAAGACATGAAAGTACTGAAACCATTGGAAGGGCTTTGACTCTCGGTGTTAACATCAAGATGATCACTGGTGAATTTGCTCACCCATTGATCGTGTTGTAATAATAATACACCTTTGCCATTTTCCACTAACATTCTATTGGACGACGTAGGCCAGATAACCAGTTGTAAACTTGGAATGGGAATAAACATGTATCCATCTTCGGCTTTTCTTGGTACGCACAAGTGGTAGGAACCAACAAACCCCATGGATGAATATGTCTCTCAAGTCTCAATGGTACATGTCATGAATATCTTTCAGTTGTCTTTGCGAGAACCAAATTGTCCTAAAATAGAGTTTCTGACACAGGTTGTAAGTTTTGTCACGTAAGAGACATGGAGAACATACCTGGCAGAGAATCAAGTGAATTCCTCCAAAGAACTGATCAGATTAGAAAGAGCTAGTGTCTTGCGGCTGAATAGGTAAACATTCTTAGAATAAAACTACTAGCAAATTGGAAATATGTTATACCCATCTTTCTCAGATTTTTTCAGAATGGGAGATATGTAAAGGAAGGAACAAATACTTTTGACAAACTATTTAGGCCATCGTCAAAGATTTTGCAACATACACATCCATTAATTAGTATTCAGTAAGTAATCTTGCATCTATATAAATAACCAACCTAATACTTTGTCAGTAACAATCTCACTAAATGTTTGTATAATTGTGTATGGTAGGTAGACAGTGGAAAGAAGTGTCTAAAGGAAACTTGAACCCAGATGTCTGCATAGAGGTAAATCCACATAAGATCTCACACCCTCGGCCAAGTTCACATCACACATTAGAATTATAGAACCTTGGTAAGTAGAATAAACCTACTTAACTACCTATGATAGTTTTCAACTTAAAATCTGTGTGCATCGTGATTGAATTCTATAAACTCAATTTGATACATGCCAAAACGTTGATGTGAAATATGCAGACGTGTCTTTATTCGGTGGAGCATGGAATTCTTCTCATTGTAGATCGCTGCTTGACATTGTTTGACAATCCACTGGTCGACTCTCTTCACACAACTTACAATGAGCTCAAGGTAGGTTAATGAACTCGAGCTATGATTGTTATCAGCTTCTTGCATATCCACATATACATCAATAAATTCCTTCATTCGTTGAACATATGTAGTTACAGAAAGAATGCAAGAACCAGAGTAAGAAACCGATTTCTGGAAAAGATAATTCAAAGAATCTATACAGGTATCGTATCTTCGTCTGTAGAGATTTAATATTTTGACTTTTCTCTTATAGCTTAAAAATGGGTGTGTTCGGCATTCTAAATCAATGTCACAAAGGAGACAAGCGGTAAGAACCACCAAACCCCATTGACGAAGATGGTCTCCTGGAAGGTAACTGTCCTAAAACAGAGATTAGCATGTTTCAGAAGTTTTTGTGAGAACCTTACTGTCCTATAACAGACAATTTATTTTGCCACATGTTGTAGATTTGGCACGTAAGAGACGTAGAGAACATACTTGTTGGAGCATCAAATGATTTCCTCCAAAGAAATTGATTAGATTGGGAAGACTAGTGTCTCGCGGCTGAATAG