Search result

BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_027291
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:15381808-15384895[-/-]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence CTTCATGCAGCTAACTCTTCCTCCGTTGCTTGTGATGGAAGTAATGTCGTTGTTGGCCTTGCGGGTGACCGGGAAAGAAGCGGATGACTTCAAGCCGGTGTGCGGAGAAGGTAGTCAACTTCCTTAGCCAATTCGACGTCAGTAAGGTCAGGGAGGTAAGATAGAGTCTCAAACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACAC
Tissues leaf/leaf, aerial, inflorescences, seed
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTTCATGCAGCTAACTCTTCCTCCGTTGCTTGTGATGGAAGTAATGTCGTTGTTGGCCTTGCGGGTGACCGGGAAAGAAGCGGATGACTTCAAGCCGGTGAATGGAGCGACCATGGTGGCTTGAGCCGGGGAGGTAACCACAGCGGTGGAGGAGAACATAGAGGAAGCCATTACTTCTTCTTGTTGTTTCTCTTCTTCTTTTGGTTTTTCTCTTACTTACTTGTTTGTCTGTTGGTTTTGTCATCTTTATATAGTGGGAACCGCTAGAGGCAACTAGCCCTAATGATCAAAGGGGCCATAATTCATGATAACGTCGTTAATTGCCACAGGATTAAGGAAAGGTGTTGACACCCTTATCGATTTGGACCACTAGGATAAGATCACGTGGCAGAAAACTCCATAATCTTATCTTTCTCATGTAAGGGTAGGAGTGAATGTGTATGGCTACTGGTCTCCACTTGATCGGTTGCTTTTGGCTCCTTTCAATTGGGAGGCGTCAAATTGTAGATATCGGTTAAATACTTTTTACATATAGATTAAAAAAATGATTAAATTTCTATTACCTTATATTAACACATTCATATTTTTATTTTTCCACTTGATAATCTTAAATAATAAGAATATAAGTATAATCTTTGAATTCATCCCACATTTTAAAAGTATAATTAAATCAGACAGAGTTCATTCAAAATGGTTTTTAATTGGGAAATGTAAACTAGTATTTTGTGTTATTATTTTCTATGTAGTATGTACGATCACTAGAACTTTTAGTCACATAATGGATATTAAATTAGAAAACAATCCAAATGCTTGTGAATTTTCAGGTTTTACGGCTAATTAATATATTTCTGATGAACAAGAGGAACCCACGGCACCGTTCCTTTTGGAGCACAACGCAATTGCACTTACGGCCCACTTAAGCACGAATGTGGCACCTCAAGATAATTCCCACCATGACAACTTAAGCACAAAAGCCATGACGGATCATGGGGAAATTTTATAACACACTTCAATGGATGGTGTGGATCCGAGGGAAGAATCCACACTCTAAGGCCACATGAAGAAGCTCATATGGTCATGGGTCCACGAATACCACGTAAAAGCTCATATATGCCCCGGTCCAACCATATGAGAAGAAGTAGCCAAACCCATTCAAGAAACATTGATTACTTTTCATTGTAAATAAGTGTTTTAGCTTTGAATGTATCGTAAACTATCTAATTTAATGTAAAACAGTTTCCAAATTATAAATATTCATGCTTTGTTATCTCCATTATAAATTTCATTAATTCTTGCGTGTCCTTGCTTGCTATGATGTCATCTCTAAATTTTTGGACTTGCGGCTCTAGAATTCATGTTTATGGATTTAAAATATACAGTTGGATTTTTCTATGTCATTTTAAAAAAGAAAATTTTTAGATTAGATTTTAAAAAGAGAAATAAACGTGTTTACAACTTAATGCATACTTTTTTGAAAAACAAATCTAAAACAGAGGATTTGGTCTTAAGCTTGTCTTGTACCAAACCAAACTTGAAGACCTCCTTCATACTTCAAAGCTCCCCCCACTCCGTATTGTGCTCAGCCGGTTCCAAACATTTTTGTCAATTAACTTGACAAGTTTCTCCATTGGTGATGGTTGTTCACCATGCTTTCAAGCATTTCTTTCTCCCCAAATCGAATGAACCGTGTTTTGGAAGACATACCGTAGAATGAAGATTTTTGTTTTGTCATAGTTTTTGTCACAAATGGTTTTAAAGACTTCCCTCCAATATGTCGAGTACTTATCAAGTAGTATTCCCCTTATCAGCTTCTCCCATACCTTCTGCGAGTAAGAGCACCCAAAAAAAAGATGGTGTCTTGTTTCCATAGGTTCGTGACAGAACATGCAGTTTGTGTTCACTTGTTGATTCCATTTAAACATTCTGTCTCCCGTGGCAACTCTGTTTTTTGAAGCTAGCCAACTGAGAAAGGAGTAGTTAGGGTAAAGTAAAAGAAACAGATCCCTTTGTATCCGTCCATCGTAGGCTTAGTGTTGCGAATTTTTGAGCATGTATCTCTTGTGACAAACTTTTGACGGTAGTGATCATTTTTTCCTTTCCAAAGGGCTATGTAACTTTCATCTTCTCTGAGACGACATCTCTATTTTCTACGTATTTTTACTACCTTTACTGGCTGTTTTTCATCTTTAAATTAAAATGTTCTAAATCAACCCTCAAAATTTGATTGATGGACGCATCTTTGCTATGCTTTCAAGTGCGAAATGTACCTAAAAAGGGTACTCTTTCATTAGAGAACCAAAGGCAAGAATTAGGAGAGAAATTTAAAGGAACTAAAATGTTAGTTAAAAGAGATAAAACGAATAAAAAGAGTTAAAAGTGATAAGAGCAGAAATGAAGTGATATGAATAGAGATTTTTATAGAGGAAACGATAGAAAAACAAACCTTCAGTTTTTTCACTTTGGCAAAATAATTACTTAAATTTACATTGACCATACAAAATTGGGTTCCGGATAGTCAACATTGAATATTCCAGAAAAGGATTTAAGCATCAGTGAAGCTTGGGGGCTTGTAGGCAATGAAACTGATGCATTGGACTTGACGGGTGTTGTCGAATCCGATGATCCTAATGAAGGCGCCCGGGTACTCCTTCTTGCATTCTTCAACTTCCTTCAACACTTGAGCGGAGTCGGTGCATCCGAACAATGGAAGCTTCCACATTGTCCAGTACCGTCCATCGTAGTATCCGGGAGTGTTTCCGTGCTCACGGTACACAAATCCGTGCTATAAACACATAAGAAAACCATTCAATACAATTGATATTGGAGGATATGCACAAGGTGATATAGTCTATTTCGGTTCTAAAAAATCCGGTTATAGGCTAATATTTCTAGCAATGAAAACGAAAAAAATAATAATGATTAGTAGACAAAGGAAAAGTTTTGTGTATATTACCTCCAACTCGAATTCAACACAAGGAATCCATTTGTTGCGGAGAAGGTAGTCAACTTCCTTAGCCAATTCGACGTCAGTAAGGTCAGGGAGGTAAGATAGAGTCTCAAACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACAC