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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_027268
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:15377911-15384589[-/-]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence CTCTAACTCGAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGGAGAAGGTAGTCAACTTCCTTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGGGAGGTAAGATAGACGGAGTCGGTGCATCCGAACAATGGAAGCTTCCACATTGTCCAGTACCGTCCATCGTAGTATCCGGGAGTGTTTCCGTGCTCACGGTACACAAATCCGTG
Tissues leaf/root, leaf, aerial, inflorescences, seed, whole_plant
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTCTAACTCGAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGGAGAAGGTAGTCAACTTCCTTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGGGAGGTAAGATAGAGTCTCAAACTTCTTCTTTCCAATTGGTGGCCACACCTATAATCCCCAAATCCAATTCCAAATTAATATATCCTATGTTTTGTTTTATTGCACATGACAAAAGACAGTTTTTATTGATGATATTACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCCCCGTTGCTTGCGATGGAAGTGATGTCCTTGTTGGTCTTGCGGGTGACCGGGAATGCAGCGGATGACTTCAAGCCGGTGAATGGAGCGACCATGGTGGCCTGAGCCGGGGATGTAACCACAGCGGCGGAGGAGAGCATAGAGGAAGCCATTACTACTTCTTGTTGTTTCTCTTCTTCTTTTGCTCGTTTACTTACTGACTTGTTTTCCTACTGGTGTTGTCATCTTTATATAATGAGAACCCCCTAAAGGCGAAAAGCCCTCATGATCAAAGGGTCCATGATTCATGATAACGTCGTTTACTGCCACAGGATTAAGGAAAGGTGTTGACACCCTTATCGGTACGCACCACTAGGATAAGGCCACGTGGCAGAAAACTCCATTATCTTATCTTTTCTCTTGTGGGGGAAATGAAGTGAATGTGCGGTTACTGGTCTCCACTTGATCGGTTGCTTTTGGCTCCTTTCGTTTGGGAGAAAAGAAACCAGACGCATTACCTTAAATTTAATGCTTTTGGTCTTTTGGACCTCTTATTTACCATGTATGATTTAATTTGGCTTAACACTTTCTTTGGAAATAAGGTCGCATTAAAAAATAGTTATAACAAAATTATTTAAATTTGATATTTACATAAATATATTGTATGATATTTATCCGGACAAAAAAAAAAGCTTTAACCATCTCCAATATTTGTTTCTATTATTTTCTTTCTGAATATAGAGGAAAAAATATAATAGAGATTTATATTTTAACTTCAATGGTTCCTCAAAAATTCGTTAGAAAAAATAAATAAGAGAAAAAATAAAAATCTCTATTTTTTGCTTTAGAAAAAAAATTAGAAATTTCTATTTTACAAATGAAAATAGAGATGAGTTAGAGTTAAATAAATACAAAAATAGAGTATATAAATAAAAATAGAGATAGATTCGAGATGCTCTTAAAAATATTCATTACTCTTTCCGTTTTATTAATATCAATTGTTAAGATTTTTCAGGCAGACTTATAAATAAGATTCCATTTCAGACTAATGGAAGTAAACCTATCAAAAGAATTCTAACGTGCTGTAGAGAGACTCCTTCGTCATCGTCCCTTTTGTGAAAGAGTAAATTAAAGAATCCATAATGAGCATAGTGTAAGAAGAACCATTTATCTATTAGATATATTCTAGTACTGGTAGACTGTCGATTCTGGATACATCCTGAAAATCATTTACCACAATAAATTGTCGATAATCTTTTTGTTGGAAAAGTTATATATTATCTTCAAATGATAATATATTAGTCGACAAAAGAAAAGCGAGACAAAATTTGAATACATTGATTTCGGTTAATTCAATACTTTCACTTCATTTTTAGCAAATAGTACTTTTATTTCTGATTTTTATGTGGCTAGGATAAAAGCAAAACCTTACTGGTTGGAGAGAGTAAATATTTGAGTCGATACTAACAACAACTACATCATGCAAGATATGTTTGTGGGACAAAGAGACCGAGCGAACAAACGAAACGGCAAAACCATCATCTACATGTATCAAGTGCGCGGTAAACCCCTCATGGAAGAATTTCCAAGAAAACCTCCCAAAGTCCATGGTATCTTCTATATGAGGTAATGCACGCTGCCTCTAGATCAACAAGTAATATCAGCTCACGATTATCTTGCGACTCTGATCACATCACAATAACAATGGGGAACCCACATACGCAACCGTTCTCCTTGGAGTACCATGCCATTGCACTTACGGCCCCCTCAAGCACAAATATGGCACCTCAAGCTGATTTCCACCATGCAAACTTGAGTATGTAATCAAAGGTGTAGAACGGAGTCAAGAACTCATCTTAAAGTCACATAAAACTATGGTCATGCACTCATGGATCACGACTACTACCTTCAGGCTCACAAATTAATGCCCCCTTTTCAATCATATATATGAGAAGAAACGTGTACAAAGTACACATTAACTGGTCACGAAAAAACTTTCGTGTAGGGAAAAGGATCACAAGGTCCACTCCACTCCGCACCTCAGCTAAATAAATCATTTTTCGAAAGTGAGATAGTCTTAACTCTTAAGTCTTAACCCATCCATCTAAGTTACTAGTTTCTGTCTTTTATAAGTCATTTTGTTTCTTTTTCTTGGATTTTAATTGAAGCCAAAATGTGTGAATTAAATCCGGGAGATGGAAAAAATGTTCGATAATTTGAATTATTATTTTTATATGTATTTTGTATTTGAATCATGAATTTTTTATATTTCGTTTGCATAGAAGAATCCAAAAACATATGATTTTTTGTCAAAACAAAAACTTAAAACCAAACATATAGTAGATGCGACGTTTTCATTATCATTTGGAATCTAGTTTTATTTAGAACTTTTTGGGAACGTTAACTACTTTTCCTTCTAAATAACTGTTTCAGCTTTTAATGCATAACCAATGATCAAATTTAACGTAAACAAAATTTCCAAAATTTAGTAACTTCATGCTTGACAAATTTCAGTCTTTGTCGATCCTTGCTTTATGTAATGCTATTTCTTGACTTAATATCCCACTTAGGGGTTTGGAATACATGTTTTATGTTTATAATTTTAAAAGATGCATTTGAATTTTCTGTATATACTACCTTTTCCAAATCTCCAATGGCTATGTCATCTGAAAAATGGTTACACTCCCTTACATAAACTTTTCTCTAAATATCGAGGTTTGATTGATTGCTTTCATGTGCAAAATTTCTTAAAACAATGTAGCAAGTTTTTCTTTTTTTATTAGAGTTTATTGGTTAGTCTAGGGAGTCAAAAGCAAGAATTATGAGGATAATTTAAAGGAGCCACAATGTTGTTTAAAGGAGCTAAACGAAAAATAAGATTTCAAAGATTTAAGGGCAAAAATGAAATGAAATGATAACTATAATTATAGAGAAACTGATAGGAATAACATTTTCACTTTCAAACAATAGTTCCTCAACTGTTAAGTCGGCAAATAATTTCTTAAATTTGCATTGACCACATAGAAATGGGTTCCAGAATAATCAACGCTGAATATTCCAGAAAGGGGATTAAGCTTCGGTGAAGCTTGGGGGCTTGTAGGCAATGAAACTGATGCATTGGACTTGACGGGTGTTGTCGAATCCGATGATCCTAATGAAGGCGCCAGGGTACTCCTTCTTGCATTCTTCAACTTCCTTCAACACTTGAGCGGAGTCGGTGCATCCGAACAATGGAAGCTTCCACATTGTCCAGTATCGTCCATCATAGTATCCGGGAGTGTTTCCGTGCTCACGGTACACAAATCCGTGCTATATATAAAGAAAACCATTCAATACAATTGATATATATATTGGTGATAGTCTATTTCGGTTATCCACTTAAGTTTCTAGCAATGAAGAAGAAGAATAAAGGATGCTTAGAGACAAAGGAAAAGTTCAGTGTATATTACCTCCAACTCGAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGGAGAAGGTAGTCAACTTCCTTAGCCAATTCAACGTCACTAAGGTCAGGGAGGTAAGATAGAGTCTCAAACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACACCTATAAATTCGAATTCCCAATTATTCTAAAGTATTGTTCAGTTGCACTAATTGCACATGACAAAAGACAGTTTTCATTAATGACATTTACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCTCCGTTGCTTGTGATGGAAGTAATGTCGTTGTTGGCCTTGCGGGTGACCGGGAAAGAAGCGGATGACTTCAAGCCGGTGAATGGAGCGACCATGGTGGCTTGAGCCGGGGAGGTAACCACAGCGGTGGAGGAGAACATAGAGGAAGCCATTACTTCTTCTTGTTGTTTCTCTTCTTCTTTTGGTTTTTCTCTTACTTACTTGTTTGTCTGTTGGTTTTGTCATCTTTATATAGTGGGAACCGCTAGAGGCAACTAGCCCTAATGATCAAAGGGGCCATAATTCATGATAACGTCGTTAATTGCCACAGGATTAAGGAAAGGTGTTGACACCCTTATCGATTTGGACCACTAGGATAAGATCACGTGGCAGAAAACTCCATAATCTTATCTTTCTCATGTAAGGGTAGGAGTGAATGTGTATGGCTACTGGTCTCCACTTGATCGGTTGCTTTTGGCTCCTTTCAATTGGGAGGCGTCAAATTGTAGATATCGGTTAAATACTTTTTACATATAGATTAAAAAAATGATTAAATTTCTATTACCTTATATTAACACATTCATATTTTTATTTTTCCACTTGATAATCTTAAATAATAAGAATATAAGTATAATCTTTGAATTCATCCCACATTTTAAAAGTATAATTAAATCAGACAGAGTTCATTCAAAATGGTTTTTAATTGGGAAATGTAAACTAGTATTTTGTGTTATTATTTTCTATGTAGTATGTACGATCACTAGAACTTTTAGTCACATAATGGATATTAAATTAGAAAACAATCCAAATGCTTGTGAATTTTCAGGTTTTACGGCTAATTAATATATTTCTGATGAACAAGAGGAACCCACGGCACCGTTCCTTTTGGAGCACAACGCAATTGCACTTACGGCCCACTTAAGCACGAATGTGGCACCTCAAGATAATTCCCACCATGACAACTTAAGCACAAAAGCCATGACGGATCATGGGGAAATTTTATAACACACTTCAATGGATGGTGTGGATCCGAGGGAAGAATCCACACTCTAAGGCCACATGAAGAAGCTCATATGGTCATGGGTCCACGAATACCACGTAAAAG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