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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_027177
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:14684298-14685592[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence AGCTCCATGGGAAAGAAATCAGCGGCTGTAGATCTCATCAATGCACGGCTTCTTGAACGCCCAAATGACCCAAGATTATGGTAATCTATTCTCTGATAGTAGAATTAGTAATTGAAAAATATTTTGTATCAACAGCCGAGACAGCTGGCAGATATGGGAGAATTTCAGCCATGTAGCTATGGATGTGGGAAATACTGATC
Tissues leaf, inflorescences
Exon boundary No-No
Splicing signals TT-AG
circRNA sequence NA
Genomic sequence AGCTCCATGGGAAAGAAATCAGCGGCTGTAGATCTCATCAATGCACGGCTTCTTGAACGCCCAAATGACCCAAGATTATGGTAATCTATTCTCTGATAGTACTCTTTGTCTGTTCTTTTCCTGTTGCTTATATATCGTAATTATTAAATGGTTGTGAAGTGCCACAATTATCTACTTTGAATGTACTCTTAATCTATGTGCGGATATTTCTTTGATCACTAGGAAGTTATTATTGTATCATAACATTAAAGTAAATTTGATGATAAAAATTGGTTTCAGGTGTTCATTGGGTGATGTTACGATTTCCGATTCCTGTTATGAAAAAGCCCTGGAAGTTTCAAATGACAAATCAGTTCGTGCTAAGGTAGTTTGAGATACAAAACAGAAAAATCTTTTTTTGTCCATCTCTTTTAGTCCATGCTCTAATTATCTTCATCTTGCAGCGGGCTCTTGCTCGAAGCGCATACAATCGCGGTGATTTTGAGAAGTCGAAGATACTGTGGTATGTTTGAACATTTTGGTTCTTTCCTTATTAATTTTTTCTTTCTCTACAAGGGAAATGGAGTTATGAACTTGGCCCTTCAGGCTGATTTACTTGTGAGATGTCTCATTTTTTTCTCCTACTCTAGGGAGGCTGCAATGGCGTTAAATTCTCTGTATTCAGATGGTTGGTTTGCTCTTGGTGCTGCTGCGTTGAAGGTATTTTACTTCATCTTCTCCTATAGCTTAGTAGCAATATATTTCCACTCCAAATCTAACTTGATAAACAATTGGAATTCTTGTCATGCTGGCTGAGAGATATACTAATTTAACATGTCCGACATGATACAATAGGCCAGGGATCTTCAGAAAGCACTGGATGCATTCACTTTAGCTGTTCATCTTGATCCTGACAATTGGCTGGCTTGGAACAACATTGCTAGTCTGTAAGCATTTCAGTTACACTAGTCTGCTCTGTTGGTGCTGAAAATTAATTGTTTTCTTCACGAATGCCTTACTATTTAACTTGGTGTCTCACTGCTCACCTACTTTATGTTTCATATACTATGGATGGTGCTGAATGTTTAATAATAATCTGTGAGTGCAGGCATATGATTAAGAAAAAGAGCAAAGAATCATTCATTGCATTCAAAGAAGTGCTTAAATTAAAGTATCTCTCTATCCTTTACGGTCTGTTACTTGAGCTAACAAAATCAGAATTAGTAATTGAAAAATATTTTGTATCAACAGCCGAGACAGCTGGCAGATATGGGAGAATTTCAGCCATGTAGCTATGGATGTGGGAAATACTGATC