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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_027003
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:13475046-13485053[-/-]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence CTGTACAGCTCTTCCTCCATCCAAACATCCCACTGGAAGCATATTAAATGCTGTTGTTGTTAAACCACACCTAACAATCAAATTTCAATGTAAGAGAAAAAAGGAGGGTATATTTCAACAGTTGAACATACCACTCTGAGTCCAAGCATTACATAGGTTGACAAACCAAATGTAACCAATGCATTTTTCCCGAATGCTCC
Tissues root, aerial, inflorescences
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTGTACAGCTCTTCCTCCATCCAAACATCCCACTGGAAGCATATTAAATGCTGTTGTTGTTAAACCACACCTAACAATCAAATTTCAATGTAAGAGAAAACTGTCAAAATTGCTGATGAATAATATAAGCATGAGCCAAGGCATAAGACGCTACCATCCGGCAATTACAAGCGGGTGGATTGAAACTGTCGCAGCATGCAAAGCTCTGCAATCAATAGGAAAACGGAAATGGAGATTGGAGTTAGGTTTTTTCGTTTAGGGTGAACAGTCGCTAGCTGTGGAGAGCTTACGCATATCCCAGAGTTGCTCTGCTGATGAGTCCAAGAAGTAATGAACCTTGAAATAACATGCTGGGAACCTGGACCAGGTCGTTAGCTGCATCTGGTTCTGTAGATAGGAACAGACCAACAGCAAACATGGAAACTGAGAGTGCAGCTCCAGCAAATGGACCAGCTAGCGAAATGTCAACTTTTGTACTCCGGTCAGGAAGAATCGACTTGAACTGCACAAATCAACTAAAAGGATTACTAAAGGCTAACACTACTATATCAGGCTTATCAGCCAATATTATTGTCTTCGAAAAACTTCAAAATGTTCATCAGAGAAAAAAGTAGATTGATGCATTTAATAGAGAAATAGATGGATGCATTTTCGAGCATAGTACCGTTTCCTAGTTTCCTCAAAAAAGTTTGAAAGATGACTGCTTCTAGATATTAATTACATAAGAGTTCAACAGGAGATAAGTCCCCTAAACTTGAAAGACTTGCAATAGAAATGCTAAGGAATACCACCTGTGTGATTGCACCAAAGCTTCCTAGTGTAATGCTTCCTAGTGCCCTAATTCCTGCAAATAAACAAGTCATAGATATAACTCTCTAAACGAAGCACTGAGAGCAAAATAAGAAAATCAGATATCACCAATACATGAAAGTTAATCATTCCACCAAGTAAGCATCCCTGCTTGGTATGAATTTGAAAGCAAACATGTATCCACTCTATAAACGAAGATAAATAAAATAGACGAAGACAAACCTAAAAAAAAACTAGAAATTACAGCTCATTTGCCATTATAAGCCAAACAAAGGAGGATACAATTTTCCCTCAAATTCATTGTCAAAGAATGTGGAAGTTAAAATTTGGGAAGGGGCTTGAAATCAAAGGGTCCAGCTACTGCCACTCACGGCATTGACCACAGCTCCAGCTACTTCCGGGTAAGGCTGACCATGGAGAACAGTGAGAATGTATAAGCAATCCACAAACCGTGCACAAAAGATCAGGCGCTGGATCCATTTGCAAACATCTCTGACATGGACCCATATCATCTTCACACTCTTCTTTTTCTGTTGGTTCGAACTGAGGGTTTCCTGAAACAACCATATCACCATTTTCCTGGTACTGACCACCACCACTATCATCGGCTGTCAGTAGCTCGGTCAACGAGAAATAAGTTTGCGGTTCAAATTCCATGTCCTCGTAGTCGAAAAGTAGCTCACCAGACAAATCCCATTCTGTTAGAACAGGTAAAGCTTGCTCCTCTGCCTCGGGTTTCACAATAGGATGCAGTTCAGGATAGGCTGCATCAGAATCTTCTCGTTTCACTTGCCTTCTAACTGGTAGCTTTTGGGGTCCAGGCGCAAAAGCAGTGGTGCTCCATTCAAGATCGAAACTACTGGGTGTGATTTGTTTGACTTTGGAAACTGATACCAGGAGAGGATCATCTTCTGGAATAAATACATCGTCAGGAGGATATAAAGGAGTGGCAGGTAACGGAGTAGAAGGTTTCGAGTCTTTTTGTTCAGACATTCTTTCAGAATCAGAATCCAACCCAGAATTTCCTTGCCTCTGTTTCTGGTTCGTGAAGACTATTCTTTTGATCTGCTTCTGTTCCTTGAGTTTGGGATCCATGTAAGGGCAATCAGGGGATCGTATACGTCGACATTTGCAACATTTGAACCCAACAACTTCAGGAATTTGTGAATCTTTGAGCTTAACAGCTTCAGTGTGGAACCACTCTGCATTTGAGATTCAGATATTAGATAATATAACATTTAAGACGCCTTCAAGAAATTACACTTGGAAACAGTTGTCGTTGAGTGAATAATTCCTTACTTTCGCATTTTGTACAGTGAATATACGTTAACCCAGGATTATACGGCAGTAGGCAGATCCCACAAACCGGTTCCAGGCTCGGTTTATCTGATCTACCGGCCAAGAGAATGTTTTGATTCCGGAAATCAACACCTGTGTCCTCTACGTTCTTTTTCCTCCATATGACTCCACAGGACAGTGTCTTCTGTTTACTCTTAGATACACTAGAATCAGGAGTGACTTGTTTAACTCCCGAAGTGTTCTCCCGTGGCTTCTGGGATGATAATTGTTGACTAGGAGGCTTAACCTTGATGACTGGAATGACTGCATTTTGATGTCGTACGTTGATCGTGAACTGGGGTGCTGTTGACTGTCTGTGATTGATATTTGTTGGAACTCGAGTTTTTGAAAGGTAACACCGTTTGCAGGTGACCAGAACTTCAACATTTCCATTTGTGTGTTGAGACATCGAAGTGCAATCCTTGTGACAAAATCCTAAAAAAAGAAACAAAATATGACAATCCAACGCTGATGCACAAACATACTGATATACTACAACGAAAAATTTGCAGTCCAAAAGGAGCAGTGAGATTAATCCTTCTTTGTCAAGTTAGCAAATGAGATGCTAAAATAGAATAAGATAACGCAGGGCTGCATTCCCAATCCATTAGGTGGATTCGAACTTTCTAGTTTTTATACAAAATGCACATATTGAAACAGTACGAGGATGGTATTTTACCATGGCAAGAACTGCATGTTGTTGTATCCCTGTCGACATGTATACAGAACGAAGACAAAATTAATAAAGTACACCATAAAGTTTAGCAGGCACCTCAAAAGATAAAGAAACCAAAGGATTACCGTAATAGAACATCATGATCACATGATGCACAAGAACATTTCTCCATCTTGTCCCTCCTTGAGGCTATATATGAAAATATGTCCATGAGGGAAGCTTTCAGCTGCTTTCTCTGAAGCTTTGATAATTTCTTGGATGGCTTCTTGGTTGAAGAAGGCATTTGTACTCTATGCAAGCTCTCTTCAAATTCTTTGATCAAGTATAGGGGAACATGGGCTTCTTGTAACCAATACTTTTCATTTCTATCTTGGGTTTTCTCGACCTCCATTATATTCTTCATGACGCGTGATGGCAGATGCTTTTGATTTCCAAAGAAAACTCCGTAGCTAACCTTGTTATCACTAAGCTTTTTGTCACATATCCGAGCGTTTCTAAAAATGGCAACATCTGTCTCTGGGCCTTTGACATTCTGGAGATTTTGGTCTGGCCGCACAAGTTCTCTCCATCTTAAACTCATATCCAGATATCTTACCTGACATAAACGGTTGACTGGGTCTCAGAAATACAGTTAATATACCTACACAAACTAAAAACTATAAACATAGAACATAGACACAGGCCTGAAGAGCAAGCTGAGATATATTCTTGCTACTTTCAACAGCAGCTTTCCAAAAAGACCGTCTGCTTCTCCTAGGGATGTAAGAAGCATCACCATAATTTAATCCAGGAATCTTTTTAGAACCCCCTAATAAGTAAGTAAAAAATAATTAGTGATCCGAAAAACCATTTAGTGGCATGGAATACGAATTGTAGAGTGCTAGCATCTAAAGGGATTAGAAAACCAAAACCAAATTTAGTCGCACATAAAACATAAACAAACAAGTAATAGTTATACCTTGCCAAGCTGCTTTCTTTGTTGCCGGTTGTGACAAAACTGCTTTCAACAAAATAACTTTTGATAACTTCCCTCCTCGCCACCATGTAAAGCTATCAGCGTCGGAACCTTCAGCTGTAACTTCAGCCTGGGTATTTTGCTTCGTCCTACCAGGTCCACGTCTCTGTGGAACCCCAAGTGTAACTGGAGCACTTTGGAAAATAGAATGTTCTATCAACCAATCATCCATCTGTTTAAACCAATCGCATGACAGAGCAATACTGCAGATATTTTCCTCAAGCTGCAACCAGGATAAACAAACCACATTGCGGAGATGAGAACAAGAGTGATCAGATGTACAACAAAACAAATATGATTCATATATCACACTATAGTGTAGACTATCAAATTTCTAGTCTAGAGAGAAATCGACCAAGAGTGTTCTAATGTTTTAAGAAACAAAAAAATGGAGTAGATAAGATATGGAAAAAAATTTAGATTTCAACCAAGAAATCTTATTATAAAGAAGATCTACTTACTTCAAGGAGGGGTGCTTTTAGGGCTTTGCATGTCGAGGCTTCCTCTACCTGCTTACGCCACTGTTTTCTTGGACTTTCACTGAGAAATGGCCCAGCTATCAGACCACGCAAGCTTTCCTCTAGATATAGAATATATGCTGCAATACTCGAAAGGACTCCCTCCCCATTCTTTAGAGGAAAAAGACCACTGAAGATCTTCATTGCACCCTTAGTGGCACCCGCTACAGCTGCATTTAACATGCATCCTCTCCTGCTTGCAGATGTGAGTCGGCAAGAATGACACCAACCACATCTTTCTCTGGTAATCTCCTTCTTATCAGGACTTGGCCAGAAGAAACGGGGGGCTACTAATGAAAAAGCTTTCATCTGCTCTAAGATGTTACTTGATGCAGCTTTCTTGGCACTATTATACTTGCGAAGGTCAGGTTCATGGGTTTCCTCTGACGATAGGACAGCCAAACTGGCAGCAGCAGATACAGCCAATTCTCCATTTGTGTAATGATTATTGTATGTGTTGGGTTTAAACGATAAACCCAGGTAGGTAACACGAGCAGCCAATTTTTTCCCCTGTATTCCACATGAACCTCCTGTAACAGCACTGTTGGTATTACCCAAAGTAGATGTAGGGAGGTCAAACACAGTCTGGGTATGACTTCTATTGGAAATATTTGCACTATCTGACTTAGTGATCTCTGAAACC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AATGCTCC