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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_027002
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:13474728-13484897[-/-]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence CACTCTGAGTCCAAGCATTACATAGGTTGACAAACCAAATGTAACCAGTGCATTTTTCCCAAATGCGCCCTGCACAAGATCCATGCCCATATGTCTCAGAGAAGCTGACTCGTATTGTTGAAGTTGCAGAGTTAAGAAATTTTGTGTACCTGGCAGATTAATACGTAGAGTCCCCAAGGAAGTGCCAAAGGGCCACCGAG
Tissues leaf/root, aerial, inflorescences
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CACTCTGAGTCCAAGCATTACATAGGTTGACAAACCAAATGTAACCAGTGCATTTTTCCCAAATGCGCCCTGCACAAGATCCATGCCCATATGTCTCAGACGTGATTGATAATATCAACAATTTGATCTCTTATATGAATATCTCAGACCCTTTTCAGTTCATACTTCATCTAAAGTACACTACTTTTCAAGATTATATAATAGTATACACTTGAATCAACTGCAACACTTTCCATCCCTGATACGAGTCAGGAATGCACCATTAAGTTTCTAGTTTTCAAATAGAGTATGCACCATTCCTTATATACGAGCAAGTACCTGTACAGCTCTTCCTCCATCCAAACATCCCACTGGAAGCATATTAAATGCTGTTGTTGTTAAACCACACCTAACAATCAAATTTCAATGTAAGAGAAAACTGTCAAAATTGCTGATGAATAATATAAGCATGAGCCAAGGCATAAGACGCTACCATCCGGCAATTACAAGCGGGTGGATTGAAACTGTCGCAGCATGCAAAGCTCTGCAATCAATAGGAAAACGGAAATGGAGATTGGAGTTAGGTTTTTTCGTTTAGGGTGAACAGTCGCTAGCTGTGGAGAGCTTACGCATATCCCAGAGTTGCTCTGCTGATGAGTCCAAGAAGTAATGAACCTTGAAATAACATGCTGGGAACCTGGACCAGGTCGTTAGCTGCATCTGGTTCTGTAGATAGGAACAGACCAACAGCAAACATGGAAACTGAGAGTGCAGCTCCAGCAAATGGACCAGCTAGCGAAATGTCAACTTTTGTACTCCGGTCAGGAAGAATCGACTTGAACTGCACAAATCAACTAAAAGGATTACTAAAGGCTAACACTACTATATCAGGCTTATCAGCCAATATTATTGTCTTCGAAAAACTTCAAAATGTTCATCAGAGAAAAAAGTAGATTGATGCATTTAATAGAGAAATAGATGGATGCATTTTCGAGCATAGTACCGTTTCCTAGTTTCCTCAAAAAAGTTTGAAAGATGACTGCTTCTAGATATTAATTACATAAGAGTTCAACAGGAGATAAGTCCCCTAAACTTGAAAGACTTGCAATAGAAATGCTAAGGAATACCACCTGTGTGATTGCACCAAAGCTTCCTAGTGTAATGCTTCCTAGTGCCCTAATTCCTGCAAATAAACAAGTCATAGATATAACTCTCTAAACGAAGCACTGAGAGCAAAATAAGAAAATCAGATATCACCAATACATGAAAGTTAATCATTCCACCAAGTAAGCATCCCTGCTTGGTATGAATTTGAAAGCAAACATGTATCCACTCTATAAACGAAGATAAATAAAATAGACGAAGACAAACCTAAAAAAAAACTAGAAATTACAGCTCATTTGCCATTATAAGCCAAACAAAGGAGGATACAATTTTCCCTCAAATTCATTGTCAAAGAATGTGGAAGTTAAAATTTGGGAAGGGGCTTGAAATCAAAGGGTCCAGCTACTGCCACTCACGGCATTGACCACAGCTCCAGCTACTTCCGGGTAAGGCTGACCATGGAGAACAGTGAGAATGTATAAGCAATCCACAAACCGTGCACAAAAGATCAGGCGCTGGATCCATTTGCAAACATCTCTGACATGGACCCATATCATCTTCACACTCTTCTTTTTCTGTTGGTTCGAACTGAGGGTTTCCTGAAACAACCATATCACCATTTTCCTGGTACTGACCACCACCACTATCATCGGCTGTCAGTAGCTCGGTCAACGAGAAATAAGTTTGCGGTTCAAATTCCATGTCCTCGTAGTCGAAAAGTAGCTCACCAGACAAATCCCATTCTGTTAGAACAGGTAAAGCTTGCTCCTCTGCCTCGGGTTTCACAATAGGATGCAGTTCAGGATAGGCTGCATCAGAATCTTCTCGTTTCACTTGCCTTCTAACTGGTAGCTTTTGGGGTCCAGGCGCAAAAGCAGTGGTGCTCCATTCAAGATCGAAACTACTGGGTGTGATTTGTTTGACTTTGGAAACTGATACCAGGAGAGGATCATCTTCTGGAATAAATACATCGTCAGGAGGATATAAAGGAGTGGCAGGTAACGGAGTAGAAGGTTTCGAGTCTTTTTGTTCAGACATTCTTTCAGAATCAGAATCCAACCCAGAATTTCCTTGCCTCTGTTTCTGGTTCGTGAAGACTATTCTTTTGATCTGCTTCTGTTCCTTGAGTTTGGGATCCATGTAAGGGCAATCAGGGGATCGTATACGTCGACATTTGCAACATTTGAACCCAACAACTTCAGGAATTTGTGAATCTTTGAGCTTAACAGCTTCAGTGTGGAACCACTCTGCATTTGAGATTCAGATATTAGATAATATAACATTTAAGACGCCTTCAAGAAATTACACTTGGAAACAGTTGTCGTTGAGTGAATAATTCCTTACTTTCGCATTTTGTACAGTGAATATACGTTAACCCAGGATTATACGGCAGTAGGCAGATCCCACAAACCGGTTCCAGGCTCGGTTTATCTGATCTACCGGCCAAGAGAATGTTTTGATTCCGGAAATCAACACCTGTGTCCTCTACGTTCTTTTTCCTCCATATGACTCCACAGGACAGTGTCTTCTGTTTACTCTTAGATACACTAGAATCAGGAGTGACTTGTTTAACTCCCGAAGTGTTCTCCCGTGGCTTCTGGGATGATAATTGTTGACTAGGAGGCTTAACCTTGATGACTGGAATGACTGCATTTTGATGTCGTACGTTGATCGTGAACTGGGGTGCTGTTGACTGTCTGTGATTGATATTTGTTGGAACTCGAGTTTTTGAAAGGTAACACCGTTTGCAGGTGACCAGAACTTCAACATTTCCATTTGTGTGTTGAGACATCGAAGTGCAATCCTTGTGACAAAATCCTAAAAAAAGAAACAAAATATGACAATCCAACGCTGATGCACAAACATACTGATATACTACAACGAAAAATTTGCAGTCCAAAAGGAGCAGTGAGATTAATCCTTCTTTGTCAAGTTAGCAAATGAGATGCTAAAATAGAATAAGATAACGCAGGGCTGCATTCCCAATCCATTAGGTGGATTCGAACTTTCTAGTTTTTATACAAAATGCACATATTGAAACAGTACGAGGATGGTATTTTACCATGGCAAGAACTGCATGTTGTTGTATCCCTGTCGACATGTATACAGAACGAAGACAAAATTAATAAAGTACACCATAAAGTTTAGCAGGCACCTCAAAAGATAAAGAAACCAAAGGATTACCGTAATAGAACATCATGATCACATGATGCACAAGAACATTTCTCCATCTTGTCCCTCCTTGAGGCTATATATGAAAATATGTCCATGAGGGAAGCTTTCAGCTGCTTTCTCTGAAGCTTTGATAATTTCTTGGATGGCTTCTTGGTTGAAGAAGGCATTTGTACTCTATGCAAGCTCTCTTCAAATTCTTTGATCAAGTATAGGGGAACATGGGCTTCTTGTAACCAATACTTTTCATTTCTATCTTGGGTTTTCTCGACCTCCATTATATTCTTCATGACGCGTGATGGCAGATGCTTTTGATTTCCAAAGAAAACTCCGTAGCTAACCTTGTTATCACTAAGCTTTTTGTCACATATCCGAGCGTTTCTAAAAATGGCAACATCTGTCTCTGGGCCTTTGACATTCTGGAGATTTTGGTCTGGCCGCACAAGTTCTCTCCATCTTAAACTCATATCCAGATATCTTACCTGACATAAACGGTTGACTGGGTCTCAGAAATACAGTTAATATACCTACACAAACTAAAAACTATAAACATAGAACATAGACACAGGCCTGAAGAGCAAGCTGAGATATATTCTTGCTACTTTCAACAGCAGCTTTCCAAAAAGACCGTCTGCTTCTCCTAGGGATGTAAGAAGCATCACCATAATTTAATCCAGGAATCTTTTTAGAACCCCCTAATAAGTAAGTAAAAAATAATTAGTGATCCGAAAAACCATTTAGTGGCATGGAATACGAATTGTAGAGTGCTAGCATCTAAAGGGATTAGAAAACCAAAACCAAATTTAGTCGCACATAAAACATAAACAAACAAGTAATAGTTATACCTTGCCAAGCTGCTTTCTTTGTTGCCGGTTGTGACAAAACTGCTTTCAACAAAATAACTTTTGATAACTTCCCTCCTCGCCACCATGTAAAGCTATCAGCGTCGGAACCTTCAGCTGTAACTTCAGCCTGGGTATTTTGCTTCGTCCTACCAGGTCCACGTCTCTGTGGAACCCCAAGTGTAACTGGAGCACTTTGGAAAATAGAATGTTCTATCAACCAATCATCCATCTGTTTAAACCAATCGCATGACAGAGCAATACTGCAGATATTTTCCTCAAGCTGCAACCAGGATAAACAAACCACATTGCGGAGATGAGAACAAGAGTGATCAGATGTACAACAAAACAAATATGATTCATATATCACACTATAGTGTAGACTATCAAATTTCTAGTCTAGAGAGAAATCGACCAAGAGTGTTCTAATGTTTTAAGAAACAAAAAAATGGAGTAGATAAGATATGGAAAAAAATTTAGATTTCAACCAAGAAATCTTATTATAAAGAAGATCTACTTACTTCAAGGAGGGGTGCTTTTAGGGCTTTGCATGTCGAGGCTTCCTCTACCTGCTTACGCCACTGTTTTCTTGGACTTTCACTGAGAAATGGCCCAGCTATCAGACCACGCAAGCTTTCCTCTAGATATAGAATATATGCTGCAATACTCGAAAGGACTCCCTCCCCATTCTTTAGAGGAAAAAGACCACTGAAGATCTTCATTGCACCCTTAGTGGCACCCGCTACAGCTGCATTTAACATGCATCCTCTCCTGCTTGCAGATGTGAGTCGGCAAGAATGACACCAACCACATCTTTCTCTGGTAATCTCCTTCTTATCAGGACTTGGCCAGAAGAAACGGGGGGCTACTAATGAAAAAGCTTTCATCTGCTCTAAGATGTTA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