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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_027000
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:13474592-13484762[-/-]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence CCGGCAGATTAGTACGTAGAGTCCCCAAGGAAGTGCCAAAGGGCCACCGAGCTGAAAAGTAGGAAAATGCCAGAGCAATAAACTAGCAGGTTCGAGAAGTCAGGAGTGTCAAAACCACCAGGATTAGTGCAATCCCTACAAGGGCCTTCCTCCACGTTCCAACCTCGGTCACGTCGTTTAGACACGGTTTTTCAGGTGTT
Tissues inflorescences
Exon boundary Yes-No
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CCGGCAGATTAGTACGTAGAGTCCCCAAGGAAGTGCCAAAGGGCCACCGAGCTGAAAAGTAGGAAAATGCCAGAGCAATAAACTAGCAGGTTCGAGAAGTATAAATCAACACTACAACATTAACAGTTGAACATACCACTCTGAGTCCAAGCATTACATAGGTTGACAAACCAAATGTAACCAGTGCATTTTTCCCAAATGCGCCCTGCACAAGATCCATGCCCATATGTCTCAGACGTGATTGATAATATCAACAATTTGATCTCTTATATGAATATCTCAGACCCTTTTCAGTTCATACTTCATCTAAAGTACACTACTTTTCAAGATTATATAATAGTATACACTTGAATCAACTGCAACACTTTCCATCCCTGATACGAGTCAGGAATGCACCATTAAGTTTCTAGTTTTCAAATAGAGTATGCACCATTCCTTATATACGAGCAAGTACCTGTACAGCTCTTCCTCCATCCAAACATCCCACTGGAAGCATATTAAATGCTGTTGTTGTTAAACCACACCTAACAATCAAATTTCAATGTAAGAGAAAACTGTCAAAATTGCTGATGAATAATATAAGCATGAGCCAAGGCATAAGACGCTACCATCCGGCAATTACAAGCGGGTGGATTGAAACTGTCGCAGCATGCAAAGCTCTGCAATCAATAGGAAAACGGAAATGGAGATTGGAGTTAGGTTTTTTCGTTTAGGGTGAACAGTCGCTAGCTGTGGAGAGCTTACGCATATCCCAGAGTTGCTCTGCTGATGAGTCCAAGAAGTAATGAACCTTGAAATAACATGCTGGGAACCTGGACCAGGTCGTTAGCTGCATCTGGTTCTGTAGATAGGAACAGACCAACAGCAAACATGGAAACTGAGAGTGCAGCTCCAGCAAATGGACCAGCTAGCGAAATGTCAACTTTTGTACTCCGGTCAGGAAGAATCGACTTGAACTGCACAAATCAACTAAAAGGATTACTAAAGGCTAACACTACTATATCAGGCTTATCAGCCAATATTATTGTCTTCGAAAAACTTCAAAATGTTCATCAGAGAAAAAAGTAGATTGATGCATTTAATAGAGAAATAGATGGATGCATTTTCGAGCATAGTACCGTTTCCTAGTTTCCTCAAAAAAGTTTGAAAGATGACTGCTTCTAGATATTAATTACATAAGAGTTCAACAGGAGATAAGTCCCCTAAACTTGAAAGACTTGCAATAGAAATGCTAAGGAATACCACCTGTGTGATTGCACCAAAGCTTCCTAGTGTAATGCTTCCTAGTGCCCTAATTCCTGCAAATAAACAAGTCATAGATATAACTCTCTAAACGAAGCACTGAGAGCAAAATAAGAAAATCAGATATCACCAATACATGAAAGTTAATCATTCCACCAAGTAAGCATCCCTGCTTGGTATGAATTTGAAAGCAAACATGTATCCACTCTATAAACGAAGATAAATAAAATAGACGAAGACAAACCTAAAAAAAAACTAGAAATTACAGCTCATTTGCCATTATAAGCCAAACAAAGGAGGATACAATTTTCCCTCAAATTCATTGTCAAAGAATGTGGAAGTTAAAATTTGGGAAGGGGCTTGAAATCAAAGGGTCCAGCTACTGCCACTCACGGCATTGACCACAGCTCCAGCTACTTCCGGGTAAGGCTGACCATGGAGAACAGTGAGAATGTATAAGCAATCCACAAACCGTGCACAAAAGATCAGGCGCTGGATCCATTTGCAAACATCTCTGACATGGACCCATATCATCTTCACACTCTTCTTTTTCTGTTGGTTCGAACTGAGGGTTTCCTGAAACAACCATATCACCATTTTCCTGGTACTGACCACCACCACTATCATCGGCTGTCAGTAGCTCGGTCAACGAGAAATAAGTTTGCGGTTCAAATTCCATGTCCTCGTAGTCGAAAAGTAGCTCACCAGACAAATCCCATTCTGTTAGAACAGGTAAAGCTTGCTCCTCTGCCTCGGGTTTCACAATAGGATGCAGTTCAGGATAGGCTGCATCAGAATCTTCTCGTTTCACTTGCCTTCTAACTGGTAGCTTTTGGGGTCCAGGCGCAAAAGCAGTGGTGCTCCATTCAAGATCGAAACTACTGGGTGTGATTTGTTTGACTTTGGAAACTGATACCAGGAGAGGATCATCTTCTGGAATAAATACATCGTCAGGAGGATATAAAGGAGTGGCAGGTAACGGAGTAGAAGGTTTCGAGTCTTTTTGTTCAGACATTCTTTCAGAATCAGAATCCAACCCAGAATTTCCTTGCCTCTGTTTCTGGTTCGTGAAGACTATTCTTTTGATCTGCTTCTGTTCCTTGAGTTTGGGATCCATGTAAGGGCAATCAGGGGATCGTATACGTCGACATTTGCAACATTTGAACCCAACAACTTCAGGAATTTGTGAATCTTTGAGCTTAACAGCTTCAGTGTGGAACCACTCTGCATTTGAGATTCAGATATTAGATAATATAACATTTAAGACGCCTTCAAGAAATTACACTTGGAAACAGTTGTCGTTGAGTGAATAATTCCTTACTTTCGCATTTTGTACAGTGAATATACGTTAACCCAGGATTATACGGCAGTAGGCAGATCCCACAAACCGGTTCCAGGCTCGGTTTATCTGATCTACCGGCCAAGAGAATGTTTTGATTCCGGAAATCAACACCTGTGTCCTCTACGTTCTTTTTCCTCCATATGACTCCACAGGACAGTGTCTTCTGTTTACTCTTAGATACACTAGAATCAGGAGTGACTTGTTTAACTCCCGAAGTGTTCTCCCGTGGCTTCTGGGATGATAATTGTTGACTAGGAGGCTTAACCTTGATGACTGGAATGACTGCATTTTGATGTCGTACGTTGATCGTGAACTGGGGTGCTGTTGACTGTCTGTGATTGATATTTGTTGGAACTCGAGTTTTTGAAAGGTAACACCGTTTGCAGGTGACCAGAACTTCAACATTTCCATTTGTGTGTTGAGACATCGAAGTGCAATCCTTGTGACAAAATCCTAAAAAAAGAAACAAAATATGACAATCCAACGCTGATGCACAAACATACTGATATACTACAACGAAAAATTTGCAGTCCAAAAGGAGCAGTGAGATTAATCCTTCTTTGTCAAGTTAGCAAATGAGATGCTAAAATAGAATAAGATAACGCAGGGCTGCATTCCCAATCCATTAGGTGGATTCGAACTTTCTAGTTTTTATACAAAATGCACATATTGAAACAGTACGAGGATGGTATTTTACCATGGCAAGAACTGCATGTTGTTGTATCCCTGTCGACATGTATACAGAACGAAGACAAAATTAATAAAGTACACCATAAAGTTTAGCAGGCACCTCAAAAGATAAAGAAACCAAAGGATTACCGTAATAGAACATCATGATCACATGATGCACAAGAACATTTCTCCATCTTGTCCCTCCTTGAGGCTATATATGAAAATATGTCCATGAGGGAAGCTTTCAGCTGCTTTCTCTGAAGCTTTGATAATTTCTTGGATGGCTTCTTGGTTGAAGAAGGCATTTGTACTCTATGCAAGCTCTCTTCAAATTCTTTGATCAAGTATAGGGGAACATGGGCTTCTTGTAACCAATACTTTTCATTTCTATCTTGGGTTTTCTCGACCTCCATTATATTCTTCATGACGCGTGATGGCAGATGCTTTTGATTTCCAAAGAAAACTCCGTAGCTAACCTTGTTATCACTAAGCTTTTTGTCACATATCCGAGCGTTTCTAAAAATGGCAACATCTGTCTCTGGGCCTTTGACATTCTGGAGATTTTGGTCTGGCCGCACAAGTTCTCTCCATCTTAAACTCATATCCAGATATCTTACCTGACATAAACGGTTGACTGGGTCTCAGAAATACAGTTAATATACCTACACAAACTAAAAACTATAAACATAGAACATAGACACAGGCCTGAAGAGCAAGCTGAGATATATTCTTGCTACTTTCAACAGCAGCTTTCCAAAAAGACCGTCTGCTTCTCCTAGGGATGTAAGAAGCATCACCATAATTTAATCCAGGAATCTTTTTAGAACCCCCTAATAAGTAAGTAAAAAATAATTAGTGATCCGAAAAACCATTTAGTGGCATGGAATACGAATTGTAGAGTGCTAGCATCTAAAGGGATTAGAAAACCAAAACCAAATTTAGTCGCACATAAAACATAAACAAACAAGTAATAGTTATACCTTGCCAAGCTGCTTTCTTTGTTGCCGGTTGTGACAAAACTGCTTTCAACAAAATAACTTTTGATAACTTCCCTCCTCGCCACCATGTAAAGCTATCAGCGTCGGAACCTTCAGCTGTAACTTCAGCCTGGGTATTTTGCTTCGTCCTACCAGGTCCACGTCTCTGTGGAACCCCAAGTGTAACTGGAGCACTTTGGAAAATAGAATGTTCTATCAACCAATCATCCATCTGTTTAAACCAATCGCATGACAGAGCAATACTGCAGATATTTTCCTCAAGCTGCAACCAGGATAAACAAACCACATTGCGGAGATGAGAACAAGAGTGATCAGATGTACAACAAAACAAATATGATTCATATATCACACTATAGTGTAGACTATCAAATTTCTAGTCTAGAGAGAAATCGACCAAGAGTGTTCTAATGTTTTAAGAAACAAAAAAATGGAGTAGATAAGATATGGAAAAAAATTTAGATTTCAACCAAGAAATCTTATTATAAAGAAGATCTACTTACTTCAAGGAGGGGTGCTTTTAGGGCTTTGCATGTCGAGGCTTCCTCTACCTGCTTACGCCACTGTTTTCTTGGACTTTCACTGAGAAATGGCCCAGCTATCAGACCACGCAAGCTTTCCTCTAGATATAGAATATATGCTGCAATACTCGAAAGGACTCCCTCCCCATTCTTTAGAGGAAAAAGACCACTGAAGATCTTCATTGCACCCTTAGTGGCACCCGCTACAGCTGCATTTAACATGCATCC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