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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_026784
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:9541275-9543231[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence GAGCTTGTAAAAATGCTAATACTGTTTGAGACGCCAGGTGGTTTTGCCATCTTCAAAGTATTAAACGAAGGAAAGCTCTCTAATGTTGAGGTTACTAACTTTTAGGACGTCTATCTGGCTCAGCTAAAGGCAAACCAAAGATTGAAGTATATGACAAAGATAAAAAGAAAGGATCCGGAGGTCTGATCACTCCTGCTAAG
Tissues inflorescences
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GAGCTTGTAAAAATGCTAATACTGTTTGAGACGCCAGGTGGTTTTGCCATCTTCAAAGTATTAAACGAAGGAAAGCTCTCTAATGTTGAGGTTACTAACTAAATCATTCTCCTTTGTTCATTTATCTTAACCTTGTTTCTGTGTGTGGTTTGGTTTTTTAATTCTAAGTATGTCAAATTTGTGATTGTAGGATTTGGGTAATGAGTTCTCGACCGCAAAGTTAGCCCGAAAGGTGATTTATTTTGTTCTAGACATAGTTCAAATTTTGTATCTGGCTAATAATATTTGTTTCTCATAGCAATTTTTGGTGTGTTGTTACAGATGGTGAAGCTAGTAGCTTTTGACAAGTTTGACAACACAGCTGAAGCTCTTGAAGCAGTGGCTAAATTGCTTGAGGGAACTCCAAGCAAGGGTCTACGCAAGTTTTTGAAAGCTAACTGTGTTGGTGAAACATTAGCTGTTGCTGATTCTAAGCTTGGAAATATCATCAAGGAGAAACTGGTGTGTATTTTGTTCCGATACGCTCTTTTATTTCTGAGTAAGGGTTGTTTCTTACGGTTTTGCTTCACTCGTGTAGAAAATAGTCTGTGTTCACAACAATGCTGTTATGGAGCTGTTAAGAGGTATCAGAAGCCAGCTAACTGAACTTATATCTGGATTGGGTGATCAAGATCTAGGTCCAATGAGCTTGGGGTTGTCTCACAGCCTTGCCAGATATAAACTAAAGTTCAGTTCCGACAAGGTAGTCATTTGATTTGTATTGGTTTTTGGTTCTCTGAATTATTTGTTGAGTTAGCCAACTTTTGATAAATTATGGAACTTTTGGTATCCCTTTTTTTACTCTTCCAACATTAGGTCTGAATTGCAATTGAGTTTGTCTATATATCCTGTGTTTGTTTGACCCTTATGTTACTTCACCTTGTACTTGTATGTTAGGTGGATACCATGATAATCCAAGCTATTGGTCTGCTTGATGATCTTGACAAAGAGCTTAACACTTACGCTATGAGGGTTCGTGAATGGTTTGGTTGGCATTTTCCTGAGCTTGCTAAGATCGTACAGGACAATATCTTATATGCCAAGGCTGTTAAACTAATGGGGAATCGGATTAATGCTGCAAAGCTAGACTTCTCTGAGGTAAAGGCCTGTTTGAGTATTTGACTTCCTTGTGCTTAACACTAGTTTTTTTTTTTTTGAAACATTGTTTCTGTGTCCTCCTCTCAGATATTGGCTGATGAAATTGAAGCAGAACTGAAAGAGGCTGCTGTGATATCTATGGGAACTGAAGTCAGTGACCTTGATTTATTGCACATCCGAGAACTCTGTGACCAGGTTCTTTCTCTTGCCGAGTACAGAGCTCAGCTTTATGACTACTTGAAGAGCAGAATGAACACAATTGCACCAAATCTAACTGCCCTTGTCGGGGAGCTAGTCGGTGCTCGCTTAATATCTCACGGTGGTAGTTTGTTGAACCTCGCAAAGCAACCTGGAAGCACGGTTCAGATTCTTGGAGCTGAAAAAGCCTTATTTAGAGCCCTTAAGACCAAACACGCTACTCCAAAGTATGGTTTAATTTTCCATGCATCTGTTGTTGGCCAAGCTGCACCGAAGAACAAGGGTAAAATTTCACGGTCACTAGCTGCAAAATCTGTTCTTGCTATCCGTTGTGATGCTCTTGGTGACTCCCAAGACAACACTATGGGAGTTGAAAACCGTTTAAAGGTATCCTTCAATTTTTTTTTTTCCGATCTTCCTCTCGATCTGATCTAAAAATACTCTACCTTGATTGATGTTTACCATGCGGGCTATTTTCTTCTGACAGCTTGAAGCACGGTTGAGAACTCTCGAAGGAAAAGATTTAGGACGTCTATCTGGCTCAGCTAAAGGCAAACCAAAGATTGAAGTATATGACAAAGATAAAAAGAAAGGATCCGGAGGTCTGATCACTCCTGCTAAG