Search result

BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_026678
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:9226620-9229793[+/+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence GAGATTGGTTTTGTACGTGAATGGTAATGAAAAGGACGGTGGAAAAGATCATGTTTCACTTTACGCGAAGATCGTAGAGACAGAATCTCTTCCAGTAGGAGACCATCGAGTAAGATTCTGACAATAACAAACTTCTCTGTGATTAAGGGCAGAGTAGAACCCTATGAATCCTCTGTTTTTGAGGCTGCTGGTTACAAATG
Tissues root, whole_plant
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GAGATTGGTTTTGTACGTGAATGGTAATGAAAAGGACGGTGGAAAAGATCATGTTTCACTTTACGCGAAGATCGTAGAGACAGAATCTCTTCCAGTAGGATGGGAAGTGAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCTACAATGGAAAGCTAAACAAATATTTGATTGTTACAGGTACTTTAAACTGTGAATGGATTTTTATTAGATCCATATATATATTCTAGCGGAAAACGGTCTATTTCTCCACGATAAGTATGACATCATAACAGATAGAGCCCAGGCTTTAACCTCGTGCTAGATATGATGTCATATTCTAGCTCTATATGTTATGATGTCATATTCTAGCCATTGCTATTTTAAGAAAGTAGACTTCAAATACTAGTCTCATTAGTAAATGAACCGATAGTTGATTGTGATTTGCCTTTTTTTTTTTTGCATAATTGTGGATTGTAGATGGTACAGTGAAACGATACAACAATGCGACAAAAGAGTTGGGTTACGGACAACTTATTCCTCAATCAACATTCTACGACGGGAACGATGGGTACCGTGAGCAGGACACTGGTACATTTGGTGCTGAGATCTACATCGTTAAACCAGCCCAACAAAAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAGACAATGTTTTCACTTGGAAGATACTTCATTTCTCTACCTTGGAAGATAAAGTCTATCAGTCTAACGAGTTTCTTGTTGGAGACCGATACTGGTTAGTCATTTTCGTAACCGGATATTTTAGACCAAAGTCCAAATTAATCTTAAAAGCTTGTTACTGTTATGTGACTTTCACAGTATTATTGTATAATCAGGAAATTAGGATTAAACCCGAAAGGAGGCTTAGTCCCAATCTTCCTATATGCTCAAGGCTTTAAGGCAAACGCAGTTGTTACAACCACTTATGCAGCGACTAATCTGCGGTTAAAGAATCAACGAAGCAGCAACCACGTAACAACATATAGTAAGAAAACTAACCTAAGAATAAAAGTTTATCTCCAGGAGAAAAAAACAACAATGAATGAAACTAGGAATAGCTAAAGTAAATTTGTTTATGCTGCTCTGTTTTTTCTTTGCAGCTGCATATTGGTACCTGATTCCAAGCGGATTAGGTTTGGGAGTGAACACTATACCGTTATCAGATGTAAAAGATGCATCGAAAGGATATGTGGTGAATGATTCCATTATCATTGAAGTTGAAATGCTTACGGTCTCGGTGACGAACATTGTATCCGCTTAAAGATCTCTACTTCTTTACCATAGTTCAAACAACCTTATGAAGAAAGAGATGTTTGTAATAAGACAACGTTAATGTTTGTGATGTAGTCGTTACTTCGGTTTTTCCGAGTTTTCTCTTTTCTGTTTTGTTATCAATGAAAATAAAACTCTCCGGGTTTTAAATTTTATAAAAAATGTTGAGGACGTGAAGTGTTAAAAATCGACTTATCTGGAGTCAGAAATAAACTTATAATTTACTTTACATAATTTGTTTTGTAGCCAAATTCAAACATAACCCAAAAGAAAAAAGTATTGAATGTTTTTTTTTGTAGCCACATTCTATTTATGCGACCGTTGCCCGTTGGAGTAAGGGTCATGCCCTGATCTACAATTTTCAATGTACAACGTTTTGAACGCTTTAATTTGACCACTATAATTCATTACTCTCATTAAGTTAACCATATTTATCTCGAAAGTTCATCAACCAATATATGTTTCATTCCACTTCTAACATTTCTTATTTCTACCACTTTTACCACCTCTATTTTAAGCATTTCGCATTAGTACCGGTTGATATTATATATGTATCAAGTTTAACAAGATTCTAACTCAAAAATAAGTGGCAACAAACAAGTGAGGAAATGCATATTTACTATATATTTGTGTTGAATTACCTTTACTTTTAAGATTGGTTATATACCCATTTGTGTTTATTAGATTTTAAAATCAATTACCAAATAAGTTATTATGAGTTCATTTGAAAAGTTATGAGCTGCCAACTCAAGACTATGTGAATGGATTGTCATATAAGTATGTTATGGGCTTGATTGGTATAACTAATTAATTATAGTAGAGTTGTAGCAATTACGAGCAAAGCAAGTAAGTTGATGAAGTTGTAATCTGTTATATATTAGGTTGATGATATATATATAAATAAGTTGTTGCTGAAATTGACCAAGTTTTGATCAGGTGGTCATGAACGATGGTGAATGAAGATGAATGATGGTCAATGAGAGATAATTGAGTGATGATAGCTCAAACCTCTGGATATTGGAATGCAAGGTTTATCCGTCTACGTACGTGGATATGAACATTGATTTTGACTACTCGGTCATGATCCACAGTTATCGATTGGTAGATTCGGCCTTCCGCGATGATCGGTATGTCTATGGTCATTAATTAGAGGTAAGGGTGGTGTGATGTGAGTCCTTACTTCATAGCTTCATATGATTGGATTGTTAAGCTTAACAATCCAATCATATTTAATATTTTGAACATTATGCTACCCACATCGAATCTGATACTTGACACATTCCAAGTCAAATACAAAAATAATAATAAGTGAATGTGCATATATATATATTCTACCATGAATCCACTTTCAGTATTATATAGTAGTAACTTAACTTGTTCAATAAGTAACTTTGTCTATATATATGTAAAAGTCTTACCAATGTCTAGCTCATCTAAGAAAATGGATGATCAGAAATGGAGTCTGGTTTTCATATGTCTTGCTTTACTCTTCACCACTTCCTCTTCAGCTGAGTTTCTCATTCAACAGGTACAGTTTTGTTTGTTTTTTTCCCTTTTTCGAAACACTTTTTTGATTGATTGGCTTATTACTAAAAGTAGCTTTTTACAAAATCCAGGTCACAGGGGGCAGAGGAGCAGAGTACAACAGTTCTTACAGTCTCAAGGAGAATTTTGGTACACTTGTTGTTATGAAATCTTCTTTCTTTAGATTTCTTGGTTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGAAACCCACTTCTTGGAACTTTTTGTGTTGACAGGAGGGACAAGAGTGTTGAGAGATGAGCGACCATCGAGTAAGATTCTGACAATAACAAACTTCTCTGTGATTAAGGGCAGAGTAGAACCCTATGAATCCTCTGTTTTTGAGGCTGCTGGTTACAAATG