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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_026645
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:9200802-9208950[+/+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence TGACGACAAGAGAGTTGAGAGACGAGCGACCATCAAGTAAGATAGTGACAATCACAAGCTTCTCTGTGATTAAGGACAGAGGAGAACCCTATGAATCATCTTTACTAAAAGTAGGTTTTAACAATGAAACTACAATATATAGGTCACAAAGGGCAGAGGAATAGAGTACAACAGTTCTTACAGTCTCGAGGAGAATCTTG
Tissues root
Exon boundary No-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence TGACGACAAGAGAGTTGAGAGACGAGCGACCATCAAGTAAGATAGTGACAATCACAAGCTTCTCTGTGATTAAGGACAGAGGAGAACCCTATGAATCATCTATTTTTGAGGCTGCCGGTTACAAATGGTTAAGATAATTTACACTCTATTCAATTTCTCTCTTTTTTTTTTTTTAATAACTTTAATTCTATCTTTTGAGCTAATTTTGATGGAAAACAAAATCAGGAGATTAGTTTTGTACGTGAAGGGTAATCCGAAAGGCGGTATAAATAATCATATTTCACTTTACGCGAGGATAGAAGAGACAGAAACTCTTCCAAGAGGGTGGGAAGTGAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCCACAATCGGAAGTTAAAGAAATATTTGTCTGTTACAGGTACTTTAAAATGTGAAAGGAGTTTTACTAGATCTATTATCTATTTATAAGATATATTGGCCAATGCTACTTTTCCTTAGCAATTGTAAATACATGAACCGAGTTGATTGTGTTTTGGATTTGGATTATAGATGGAACAGTGAAGCGATACAACGATGCAAAAAAAGAGTGGGGATTCACACAATTGATTTCTCTTCCAACATTCTACAACGCGAACGAAGGGTACCTTGTGCAGGACACAGCTTCTTTTGGTGCTGAGATCTTCATCGTTAACCCGACAGAAAAACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAGACAATGTTTTCACTTGGAAGATACTTCGTTTCTCTACCTTGGAAGATAAATTCTATTACTCTGATGATTTTCTTGTTGGAGACCGATACTGGTTAGTGCTCTTGGCTAGACTAAAGTCTAAATTAAGCTCAAGGCTTGCAACTGTTATGTGAATCCCGTAGTGGCCAAGTATAATAACGGGATTTGTTTTTAATGTATATTCAGGAGACTAGGATTTAACCCGAAAGGATCTGGTGGAGGAAGACCACATGCACTTCCAATCTTCCTATATGCTCAAGGCCATAAGGCAAACGCAGTTGTTACAAACACTTGGGGAGCGGTTAATCTGCGGTTAAAGAATCAACGAAGCTCCAACCACAAACAATTATATTGTAAGAAAACTAAAAAAAAAAGGCTTAATTAACTCTAGGAGTGAAAATCATCAATGAATAGTAAGGATATAAATTGTTTTTTTTTTTTTTCTATCTTTGCAGCTGCAGCTTGGTACCCGATTCGAAGCGATTATGGTGTGGGAGTGAACAATATAATATTGATGTCAGAGCTAAAAGATGCATCAAAAGGGTATATGGTGAATGATGCCATTATCTTTGAAGCTGAAATGGTTAAGGTCTCTGTGACAAACATAGTCTCCGTTTAAATATCACTACTTCTTTTTCAACAACAACCTTACGAATAAAGTGGACTTTGATGAGTTTAATTTGTTATACGACAACGTTGTTGATGCTTGTGATGTAATCGTTGTTTCTGCTCTCCGAGTTTTCGTTTTACTTTTTTTTTCATGTTTTGCTATCAATGAAATAAAGGTATAAAACTCTCTTGGTTTTAAAGTATTTTAAAGATCCATGTTAGGGAAAGCTGGAAGGTTAAATTACAAAAATAAACTCAACCATTGGAAAACATTTTTTATAGCCAAATTCAAACAGAAGTGCAGGATCAATAGACAAAATGAGTTTAAAGCACGTAAATGACGACATGGTTATGTTTGGTGTATATATGTGGAAGAATGGATATAATTAGTTATTTCAGCTAGAAAATCACAGAAAGAACCCTGATTTAAGAGCTCTAGTGGTTGATGAAATGTTTTTGAGATATTAATAGAAAGTTGCTAGAGTATAACCAATGTAGTTTGGTGTAGTCACCTCCTCAGATTAAGGCATAAAGACTTTCGCAGAGTGATGTTTTAACAGGGTCTAGAGAAGAACATATATTCAAAAGGGAAAGGACAACTTCAAATCCAAAGTGGAAACACTAAACCCTCTAGTTCATACCAAGGTCCAAGGACGGAAATATCTTAGAAGCAATGGGTCATGTGCCCCCGGTAAAAAAGAGAGCATATTAGTTGTTTGTTTTAATTTATTGTTATGGACAATTTTACATCCTCCTATCTCCGAGTAACATGTGAAATCGTCATTGAAACAGTAAAAGTAAAGTGAAGTAAATCCCTATCGGGAATTCACCGAGAATTCGAAGAAAGGACAAATAAAACATAGAAGCTAATTATGAAGAAAGAAAGATCAACTCAGAGAACATTGATTTGGTGATGGATGATGATAAGTGATTATATATATATATATATATATATATATATATAATTTTAAAGGAAAATGGTAGGATATTTTTCTTCTAATTACTTATGCCAAGTCTTTAGATTACTTTTCAATTGAAAATGATAAAAAAAATTCATGGGGCTATTACAGGATGATGCACTTTTTGGGGCAGAAATTTGAAATAAGGCATAATCCAAATGGGCTTATGAGATTGGGCACTTTCAACAACCTGGAAAGACTAAATTACCCTTGAAAGAGGCATCTTTGTTTTCGCGTGAGATGTTTTGTTGAGGAACGGCGTGAGAGAAGCTTTGTGAAGACAATGACATTGGTAGACATAAGTGTAAAAGAGAGCATCAAATGTGAATAAACTGTAAATCTTGTTACAGTATGGAGGTTTTGAGAATTTCAAATATAAACCCTAAGAATTGGAAAACAGGGAACCCCAGGAGAAAGTGACTTAGACGACATGTGTTCTATGGAGGTAAGCATTTTCAAAAATATATACACTAAGGATTGTAATTAGGGAACCCAAGCAATTAGGGAATAGAGAACAAACCTAAGAGGAGAGGAGAGGACCGGAGCCAAGATGAATCTTGTTACAATGAATCATGAGAAATTATCATTTTCTCTTGTTCGCTGTATCAATTGCAGAGGCAGAGCAGACGGTGTTAAGCGCGAGAAAAGCAGCGAATCAGACGGCGTTAAACGGCGCAACTTTGGCGAGAAAAGCATCGGCGGAAGAAAATAATTGTACCTGATCAGATTAGTTGGAGAGAAATCTCCAAATATAGAAACGAGTGAGTGAATGGTCGGGTATATGGGCAACGACACTAGTCAGGTAGGTGGCTCTAAAATGGGGAAAAATTTAGAAGATGCTTCAACAGTAGAGGAAGAAAAGAAATAAACTAGAAATCAAATAATTTAGCGGAAGCTTTGAGGGGTGAAGTTGTAAAAGATTAGAATGTATAAGTACCTAATTTGGTGAGTAATTTGAGATGTTCCTAAATTCACAAAGGCATAGAGTTTTTTGTGCCAATCTCATAATTGATCCAACTTTTCATATGAAACATTTACAAAGAACATGGTAGGATTATTTTCTAAAAAATTCCTACCCGAATAACGGAAAATTTTGAATTGCTTTCAATCTCGTACCATATTTCTTACTAACATTTATGTTGCAAAAAGGTAGGATATTTCCTAACCTTTTTCAAAATTTTCTTACAAATTTCCTATTAGTTCAGGTTTCGTCAAAAAATCATAGGTTAAAATTAGGATATTTTCTTGTAGTATATATCTTATTATATAAAGTATGATTTTCAAAGTTACTAACTCAGAAGATTATGCCACTTGTTGATTTGATCGATCTTAGATTGTGACACGTGTTAGAAGAAAATTTCTTGAAATAATCTTAAAACAATAAAATTATAATTATAAGGAAATAAAAAAAAATGGATATGTAAATAAGATCATTATAAAAACCTATAATTATAAGGAAACTAAACAATTTGAAATTTTAAATAAGATACATTTATAAAACCTAAGTTAGTAACTCATACGATTGTCCTATGTGTCAATTTATCGATCTTAGATTTTGAGACATGTAAAACATTTTTTATTAATTTTAAAACAATATAATAAAATATAACAAATTTTTGAAACAGGAACTTGTTTAAATATATATTATTATTAGATAACTCTAAAATATAGATGTCAGCAAAATACATAAAATGTTGAGATGCATAGATAAATTTATAATAGAAAGAATCAATAGTATCAACGATGTTAGAATTAAGTACAATCATGTTTGAGTAAGACCTTTAGTACAAGTTAATAATGTTCAAAGTTTAAGTCACATAGTAGTAGTAATTTTGTAAACAAAAGATAATAACTTACATGATTTAAGGATAAATCTAGATAGATTGGATAAATTGATATAAGCGTTAAAATATTAAATATTGAAAAAATTTGTGTGGTTTACTATTTAAAATTTAAATATAAAACAATAATATGGAGTGAGTGTAATTAGTATTTTAGCTTTTATTTTAAGATGGAGTCTATAGACTAAAAATCCAGTTTATTTTAATAAAATAAATAGGTTAATTTCATTGTAAAATAATATGTATAAAAATGAAATATAATTTAAAAATATTTAGATAAAATGAATAAGTATGAATTACTAAAAGAATTCAAAAATTATTAAAAATTCTATTTATTTGTCAAATCCGCCTATTTAGGAGAGTTTTATCTAGTATATATATACATGTTTCCTGTAAACTTTTAAAGGAAAATGTTTTTCGCCAAAGAAGGGTATTATCAAAGTTTATCATTAAGAAGGGTATTATCAAAGTTTGATTATCTGGATAGTGATATTGTCTTGTGCCTGGATAAAAGACAATCTACCTTTCCCAAATTGTCTTGTGTTTGGACTTTGGATAAAAGTTTGGTTATCGGTGACAGTGATATTACCATTGACACTAAATCGATCATTGTAGTAATATATCGTGTACAATGTTTTGCTTAAAAATATAATCATGTTCTGCAACCCACCGGTGTTCAAAGGAAAAAAAATAGTTTTATGCCACCCATTACTCCCAAAAATCCATCGAAATATTGTTAAATAATAGACTCATTCTAAGTCGAAACAAAAATAATATCGTTTCCCCCACCTTTTTAATATATTGTAATATCTCGTGTACAACGTTTTGCCTAATAATATAATCATATTTCGAAAACTT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