Search result

BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_026642
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:9200657-9208810[+/+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence GTCACACAGGGCAGAGGAATAGAGTACAACAACTCTTACAGTCTCACGTCGAATCTTGGTACACTTATTTTTTTTTTCTTGGTTAAAACAAAAAACCAATCATATCTCAAAATATGAATAATCAAAAATGGAGTATAGGTTTCATATCTCTCGCTTTTCTCTTCATCACTTCCTCTTCAGCTGAGTTCATCATTCAACAG
Tissues root
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTCACACAGGGCAGAGGAATAGAGTACAACAACTCTTACAGTCTCACGTCGAATCTTGGTACACTTATTTTTTTTTTCTTGGTTAAAACAAAAAACCAATTATTGATTTTCTTGTATTTTTGTTGTTGTAATTGATATATAGGAGTGACGACAAGAGAGTTGAGAGACGAGCGACCATCAAGTAAGATAGTGACAATCACAAGCTTCTCTGTGATTAAGGACAGAGGAGAACCCTATGAATCATCTATTTTTGAGGCTGCCGGTTACAAATGGTTAAGATAATTTACACTCTATTCAATTTCTCTCTTTTTTTTTTTTTAATAACTTTAATTCTATCTTTTGAGCTAATTTTGATGGAAAACAAAATCAGGAGATTAGTTTTGTACGTGAAGGGTAATCCGAAAGGCGGTATAAATAATCATATTTCACTTTACGCGAGGATAGAAGAGACAGAAACTCTTCCAAGAGGGTGGGAAGTGAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCCACAATCGGAAGTTAAAGAAATATTTGTCTGTTACAGGTACTTTAAAATGTGAAAGGAGTTTTACTAGATCTATTATCTATTTATAAGATATATTGGCCAATGCTACTTTTCCTTAGCAATTGTAAATACATGAACCGAGTTGATTGTGTTTTGGATTTGGATTATAGATGGAACAGTGAAGCGATACAACGATGCAAAAAAAGAGTGGGGATTCACACAATTGATTTCTCTTCCAACATTCTACAACGCGAACGAAGGGTACCTTGTGCAGGACACAGCTTCTTTTGGTGCTGAGATCTTCATCGTTAACCCGACAGAAAAACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAGACAATGTTTTCACTTGGAAGATACTTCGTTTCTCTACCTTGGAAGATAAATTCTATTACTCTGATGATTTTCTTGTTGGAGACCGATACTGGTTAGTGCTCTTGGCTAGACTAAAGTCTAAATTAAGCTCAAGGCTTGCAACTGTTATGTGAATCCCGTAGTGGCCAAGTATAATAACGGGATTTGTTTTTAATGTATATTCAGGAGACTAGGATTTAACCCGAAAGGATCTGGTGGAGGAAGACCACATGCACTTCCAATCTTCCTATATGCTCAAGGCCATAAGGCAAACGCAGTTGTTACAAACACTTGGGGAGCGGTTAATCTGCGGTTAAAGAATCAACGAAGCTCCAACCACAAACAATTATATTGTAAGAAAACTAAAAAAAAAAGGCTTAATTAACTCTAGGAGTGAAAATCATCAATGAATAGTAAGGATATAAATTGTTTTTTTTTTTTTTCTATCTTTGCAGCTGCAGCTTGGTACCCGATTCGAAGCGATTATGGTGTGGGAGTGAACAATATAATATTGATGTCAGAGCTAAAAGATGCATCAAAAGGGTATATGGTGAATGATGCCATTATCTTTGAAGCTGAAATGGTTAAGGTCTCTGTGACAAACATAGTCTCCGTTTAAATATCACTACTTCTTTTTCAACAACAACCTTACGAATAAAGTGGACTTTGATGAGTTTAATTTGTTATACGACAACGTTGTTGATGCTTGTGATGTAATCGTTGTTTCTGCTCTCCGAGTTTTCGTTTTACTTTTTTTTTCATGTTTTGCTATCAATGAAATAAAGGTATAAAACTCTCTTGGTTTTAAAGTATTTTAAAGATCCATGTTAGGGAAAGCTGGAAGGTTAAATTACAAAAATAAACTCAACCATTGGAAAACATTTTTTATAGCCAAATTCAAACAGAAGTGCAGGATCAATAGACAAAATGAGTTTAAAGCACGTAAATGACGACATGGTTATGTTTGGTGTATATATGTGGAAGAATGGATATAATTAGTTATTTCAGCTAGAAAATCACAGAAAGAACCCTGATTTAAGAGCTCTAGTGGTTGATGAAATGTTTTTGAGATATTAATAGAAAGTTGCTAGAGTATAACCAATGTAGTTTGGTGTAGTCACCTCCTCAGATTAAGGCATAAAGACTTTCGCAGAGTGATGTTTTAACAGGGTCTAGAGAAGAACATATATTCAAAAGGGAAAGGACAACTTCAAATCCAAAGTGGAAACACTAAACCCTCTAGTTCATACCAAGGTCCAAGGACGGAAATATCTTAGAAGCAATGGGTCATGTGCCCCCGGTAAAAAAGAGAGCATATTAGTTGTTTGTTTTAATTTATTGTTATGGACAATTTTACATCCTCCTATCTCCGAGTAACATGTGAAATCGTCATTGAAACAGTAAAAGTAAAGTGAAGTAAATCCCTATCGGGAATTCACCGAGAATTCGAAGAAAGGACAAATAAAACATAGAAGCTAATTATGAAGAAAGAAAGATCAACTCAGAGAACATTGATTTGGTGATGGATGATGATAAGTGATTATATATATATATATATATATATATATATATAATTTTAAAGGAAAATGGTAGGATATTTTTCTTCTAATTACTTATGCCAAGTCTTTAGATTACTTTTCAATTGAAAATGATAAAAAAAATTCATGGGGCTATTACAGGATGATGCACTTTTTGGGGCAGAAATTTGAAATAAGGCATAATCCAAATGGGCTTATGAGATTGGGCACTTTCAACAACCTGGAAAGACTAAATTACCCTTGAAAGAGGCATCTTTGTTTTCGCGTGAGATGTTTTGTTGAGGAACGGCGTGAGAGAAGCTTTGTGAAGACAATGACATTGGTAGACATAAGTGTAAAAGAGAGCATCAAATGTGAATAAACTGTAAATCTTGTTACAGTATGGAGGTTTTGAGAATTTCAAATATAAACCCTAAGAATTGGAAAACAGGGAACCCCAGGAGAAAGTGACTTAGACGACATGTGTTCTATGGAGGTAAGCATTTTCAAAAATATATACACTAAGGATTGTAATTAGGGAACCCAAGCAATTAGGGAATAGAGAACAAACCTAAGAGGAGAGGAGAGGACCGGAGCCAAGATGAATCTTGTTACAATGAATCATGAGAAATTATCATTTTCTCTTGTTCGCTGTATCAATTGCAGAGGCAGAGCAGACGGTGTTAAGCGCGAGAAAAGCAGCGAATCAGACGGCGTTAAACGGCGCAACTTTGGCGAGAAAAGCATCGGCGGAAGAAAATAATTGTACCTGATCAGATTAGTTGGAGAGAAATCTCCAAATATAGAAACGAGTGAGTGAATGGTCGGGTATATGGGCAACGACACTAGTCAGGTAGGTGGCTCTAAAATGGGGAAAAATTTAGAAGATGCTTCAACAGTAGAGGAAGAAAAGAAATAAACTAGAAATCAAATAATTTAGCGGAAGCTTTGAGGGGTGAAGTTGTAAAAGATTAGAATGTATAAGTACCTAATTTGGTGAGTAATTTGAGATGTTCCTAAATTCACAAAGGCATAGAGTTTTTTGTGCCAATCTCATAATTGATCCAACTTTTCATATGAAACATTTACAAAGAACATGGTAGGATTATTTTCTAAAAAATTCCTACCCGAATAACGGAAAATTTTGAATTGCTTTCAATCTCGTACCATATTTCTTACTAACATTTATGTTGCAAAAAGGTAGGATATTTCCTAACCTTTTTCAAAATTTTCTTACAAATTTCCTATTAGTTCAGGTTTCGTCAAAAAATCATAGGTTAAAATTAGGATATTTTCTTGTAGTATATATCTTATTATATAAAGTATGATTTTCAAAGTTACTAACTCAGAAGATTATGCCACTTGTTGATTTGATCGATCTTAGATTGTGACACGTGTTAGAAGAAAATTTCTTGAAATAATCTTAAAACAATAAAATTATAATTATAAGGAAATAAAAAAAAATGGATATGTAAATAAGATCATTATAAAAACCTATAATTATAAGGAAACTAAACAATTTGAAATTTTAAATAAGATACATTTATAAAACCTAAGTTAGTAACTCATACGATTGTCCTATGTGTCAATTTATCGATCTTAGATTTTGAGACATGTAAAACATTTTTTATTAATTTTAAAACAATATAATAAAATATAACAAATTTTTGAAACAGGAACTTGTTTAAATATATATTATTATTAGATAACTCTAAAATATAGATGTCAGCAAAATACATAAAATGTTGAGATGCATAGATAAATTTATAATAGAAAGAATCAATAGTATCAACGATGTTAGAATTAAGTACAATCATGTTTGAGTAAGACCTTTAGTACAAGTTAATAATGTTCAAAGTTTAAGTCACATAGTAGTAGTAATTTTGTAAACAAAAGATAATAACTTACATGATTTAAGGATAAATCTAGATAGATTGGATAAATTGATATAAGCGTTAAAATATTAAATATTGAAAAAATTTGTGTGGTTTACTATTTAAAATTTAAATATAAAACAATAATATGGAGTGAGTGTAATTAGTATTTTAGCTTTTATTTTAAGATGGAGTCTATAGACTAAAAATCCAGTTTATTTTAATAAAATAAATAGGTTAATTTCATTGTAAAATAATATGTATAAAAATGAAATATAATTTAAAAATATTTAGATAAAATGAATAAGTATGAATTACTAAAAGAATTCAAAAATTATTAAAAATTCTATTTATTTGTCAAATCCGCCTATTTAGGAGAGTTTTATCTAGTATATATATACATGTTTCCTGTAAACTTTTAAAGGAAAATGTTTTTCGCCAAAGAAGGGTATTATCAAAGTTTATCATTAAGAAGGGTATTATCAAAGTTTGATTATCTGGATAGTGATATTGTCTTGTGCCTGGATAAAAGACAATCTACCTTTCCCAAATTGTCTTGTGTTTGGACTTTGGATAAAAGTTTGGTTATCGGTGACAGTGATATTACCATTGACACTAAATCGATCATTGTAGTAATATATCGTGTACAATGTTTTGCTTAAAAATATAATCATGTTCTGCAACCCACCGGTGTTCAAAGGAAAAAAAATAGTTTTATGCCACCCATTACTCCCAAAAATCCATCGAAATATTGTTAAATAATAGACTCATTCTAAGTCGAAACAAAAATAATATCGTTTCCCCCACCTTTTTAATATATTGTAATATCTCGTGTACAACGTTTTGCCTAATAATATAATCATATTTCGAAAACTTGCCACCCACTACCTCGAGGTCTCTCCCACAAATCTATAAAAATATTGTTTAATAATAGAAATGGGAACTTGCAAAAAGCATTAAAATAACAATAACATCCAAAGTCAAACAAAAACAAGAAAAAATGATTTGTGTAAAAACATATACATATACATATACATATACATATCTCTCGCTTTTCTGTTCATCACTTCAGCTGAGTTTCTCATTCAACATGTAACTTTTTTTTGAAATATGTTGCAAAAACAAATTCCAACATATTTATAAAACTAGTAACATTATTATTTATAATTTGCAAAATAGGTCATGAATCCCTTTTTTAATCTTTTTTTTTTTTCATTTCCCCTCATGTTTAATTATTAAACTACTTAATAGTATAATATTTTTCAAATTTTCTATTTATATACAAAAGCCTATGTTTTTTTTTCTATAATTTGATATGTAGTGTCTAATAAATTCAAAAACATTTTTATTCATACATCTCATTAATTGTTAAGATGTATACAAATTGATACATTTTTATTCGTACAACTTATTTAGTATACATTAGCTATGAATATATGAATAAAATATGTATATTATGTACATTTGTATACTAAATGTGTTGTATGACTCTTAGTATACAAAACAACACAAAAAACTTTATCAAAAAAAAAAAAAAAGCTCCCAGACCCGACTCCCGAGGAAACCTAAGCTTCTTCTTGCTATGGCCTTCGTGGCCGCCGGCGAGGACCCTCCCTTGCCAGAACCCCCTGACCCGCCTGATCCTCCCTCCATCTTCGCCCAAACCTTCATACCCGATCCACCTTCTACTTCTTCTCTCTTTCCACCTTCATCGAGTCTAGATCTAGATCTATGTTCTACCGTTTCTTCCTATGGTGTTACTCCTTTCGTTTTTTTGCGATTCTTTACTGCTGTGTGCAGTCCCTTCTATCAGATCTGTACCCGTTCCGTGTCTTTGCGGTTCTTTACTGCTCTATGCAGTCCATGGAAACTAGCCTATTCCCAGATCTTGGGATATCCTCTCGTTTCAAGTGGATATGTTTCACAGGCCATAACCTTTGATGTCCACGCTGCCCCTCCTACCTCAACTCAGAGAGCCTCTCCTACTCGTTCCATGGCCCAGACACGACAACGGTTTGTTACTTCTGTAAGATGGTGTATGTCTTTGTTTCTGGTTTTACCCCTCATTCAAAATTTCGTAGTGGTGCGATTTAATGCTGCAGTATGCAGTCTCTTTGAACTCAATCTGGCCTTTTGTGCTGTTTGTTTTGTTTCTCTTTCTTGGTGGCAGTTTGAAAAGAAACTAATTAATACACCTCGCCTGATGAATCTGGTTTTATCGGGTATTTGGTACCCTAGTAGCTTCTTATCGGAGCTAGTTATCTTCCCAAAGTTCCCTCCTCAGTGGAGTGGTTTGGATGTCCAAGAGTCGTCGGTATTGCAAGGATCTTCCTCCCGATTGATGTTCTTCTCTGCATTTGATGCAGTTCTTGTAACCTCTTGTGTTACGTTGGATACAGTCTTCCAAGAATCTAGCCAGATCGTTCTTATTGTTCGTTTTGCCTTATGTTATTCTTATGACTTCTGTTGCATATCTATCTATCCTTTAACCATTGTTATATGGTCTGTTTTGGCTTCTGTTGTTGTGTTTTATGTAGTTTTCTTCATGTTGGTTGTAATTCCTCTTTCTGAGGCTCCTAAAATTTAGTGAAAACAACTATTGGTTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATCTTAGTATACAAAACAAAGAGTAAAATTGTCTATTTTGCAAATTGTAAATAGTAGTGTTACTAGTTACATAATTATGTTTCCAAAAGTAACTATATTTCCAACAAACCCTTTTTTAATGTATTTTTTTGATAGATATATTAGTAGATTTTTTTTAACAATGGAAAACGAACAAGGTTATAAGGGCAGATGAGCAGAGTACAACTGTTCTTAAAGTCTCATGGCAAATCTTGGCACACTTGTGTTATCTGAAATAGCCAGTCTTTAGATTTTCTTGTACTTTTTATTTTGTTGATTGGAGTTTGAAGAGTGTTGAGAGAGGAGCGACGAGGACAATAACAAATTTCTCAGTGATTAAAGGTAGCAGAGAACCCTATACAATTATGGGTTCCGCATTATCCTTTCGTAACCTAGATTTTTTTTTTATATATAGTTAAACTCCTAGCCTAAAACTAAAACACAGTTGATGACTAATTGGTGGAGAACCATTAAAAAAAAAAAAAAAAGACAGAGTAGACTAACGAAACCACACCTTTACATTTTTCTATTTATCTCACCTTCCTAAATAAAAAATATTTATTTTAAACAAAAACACATTTTCTGTACAGACGTGGGTTTCGTAATGTCCATAAGTCCATCCATAGTCTACCATATAATTTAACATCTACTTCTCTCCAGTGGACGCAAAAGCTTCGAATTGAATGTGGGCGTTGCTTCTCTCGTGTCTAATATAAAATTTGGATAATCATGAATTCTTCGATGATAGTGATATACCGTTGACACTGAGTAGTTCATTGCAATAAGTAAGATCTTGTTTTTGCTAAAAAGATTCAATCATATTTTGAACACTTGCCACCCACCACTTCCAAAACTTCCACAAATTCATAGATATAGTAATACACAGGTTACTTGACAAAAGGAATAAAAGTACAATATGATGCTTTACACATTCTCAGTCAAACAAAAACGATAAAATGAATGTGTAAGATAATATTGTTTAAAAAAGAAAAAAAGAACAAAAAAAAGATAATATTGTTTTCCCGACGACTAATCCACTTTCAGTATTTTATAAAATAACTGAACTCAAGTTGCTCGATCAAACAAGTACCCTTAAATGTCTCTCTGTCTATATAAATGTACACTCTTCCCAAACAAAACCATATCTCAAAATATGAATAATCAAAAATGGAGTATAGGTTTCATATCTCTCGCTTTTCTCTTCATCACTTCCTCTTCAGCTGAGTTCATCATTCAACAG