Search result

BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_026542
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:8737164-8737557[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence ACACATTATGTGTTGCTACTGTGTTCATTTAAAGAGCAATTGCAACAACATGTGCGTGTTCATGCAATGGAAGCTGTGATGGCTTGTTGGGAGATTGAGCGGGATTAGATGTGTTGGGTTTTGGTCCTTTGATTCCTACTGAGAGTGAGAGGTCGTTGATGGAAAGAGTTAGACAAGAACTTAAACATGAACTCAAACAG
Tissues leaf/whole_plant
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence ACACATTATGTGTTGCTACTGTGTTCATTTAAAGAGCAATTGCAACAACATGTGCGTGTTCATGCAATGGAAGCTGTGATGGCTTGTTGGGAGATTGAGCAGTCTCTTCAAAGCTTAACAGGTGAGAAAATGAATCCTGTGATTAGCTCATGAATCCAATAGTTAGTTTTATGACATTGACAAGTTTTGTGTTTTATTGGTGAGATTAGGAGTGTCTCCTGGAGAAGGGATGGGAGCAACAATGTCTGACGATGAAGATGAACAAGTAGAGAGTGATGCTAATATGTTCGATGGGGGATTAGATGTGTTGGGTTTTGGTCCTTTGATTCCTACTGAGAGTGAGAGGTCGTTGATGGAAAGAGTTAGACAAGAACTTAAACATGAACTCAAACAG