Search result

BaseInfo

ncRNA ID	ath_circ_026279
Species	Arabidopsis thaliana
Class	circRNA
Genome position	5:7703617-7704269[+]
Reference genome	TAIR10
Source	PlantcircBase
Method	NA
Type	intronic
Splice junction sequence	GTTTTTTCTTTATTTCCTTCACTTAAATGATTATGTACATATTTTAACACACAAAAAAAAACTTGATATAATTTTATGTTCAAACTATATATATATAGTTTTAATATTATATAGTCATTACTAGTTGGTTTTGTGTTGAAACTCATGAATGCTCCCAAATGGAGCGAGTAACGGTCAAAGTTGACAACAACGAACATTAA
Tissues	root
Exon boundary	Yes-No
Splicing signals	AG-TT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	GTTTTTTCTTTATTTCCTTCACTTAAATGATTATGTACATATTTTAACACACAAAAAAAAACTTGATATAATTTTATGTTCAAACTATATATATATAGTTGATAAATTGCACATGACCCTTATAGTTGAGGCCGAAATAAAGAAAACAAATTATGTGTTTAGAATTTTTTCAAAAACGGCTGATGAATACATTAGGACTATTTGTCTTAATTTATAAACTGTATTAGTATTTAAATTTTACTACTAATTTTGCGGTCCTTATTTATTTTTATTTTAATCCGTTTGTTGTAGCCTGCTGCTTTTTTTGTTTTCCTTCACTTGGATGTAGTTTTATTCGTGTTTTTTTTTCCTACCATCTATTCTTCTAGTTATAGTGTTATTTATAATTAGCCAAGTTCTAACGGGTTAGAGAAAGCACATGCACATGATTAGTTAGAGCCGGTCGTATAGTTAAGATTTTTTTTTTGTGACATATATATGACAAAATTATGTGTAAAAGTGTAAGAATCCCATATATATCAGAAATACAATTCTAGCATATACAATATATGAGTTAATATTATATAGTCATTACTAGTTGGTTTTGTGTTGAAACTCATGAATGCTCCCAAATGGAGCGAGTAACGGTCAAAGTTGACAACAACGAACATTAA