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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_026253
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:7609707-7614434[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type intronic
Splice junction sequence AACCTATAAGCAGTGCTAGAATTTTCTGGAAGAACTTCATCTTAGAGTTAAACAATACATTCCGCCAACAATGAACTGTCACTTGTAAGTTGTCTAACTCTCGTTTCTTCTCTTATAACTTGAAGTTATCATCTCTTTTACTTTTATGCAGGAGCCGATTTCATAGCCAACGAACCTTGTGAACTAAAAGAAGTTATGTG
Tissues root, aerial, inflorescences
Exon boundary No-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence AACCTATAAGCAGTGCTAGAATTTTCTGGAAGAACTTCATCTTAGAGTTAAACAATACATTCCGCCAACAATGAACTGTCACTTGTAAGTTGTCTAACTCTTAAGACTCAATGAACTTTTTTTTTTTGTTCTTCTGAAAACTACAACAATCTTTTTTGAAAACAGGCAAATTTTATGTTTGTTGTTGGTGTTGGTGGCTGAGACAAGCTCAAGAATCATTAGAAAATGTACTCATCGATCTTTATAAGGTAAATAAACTCTAACTGAGACCATCCTCTCGTTTCTCTCAGTTTTTGTTATTAGATTGTAGAATTGACAAAATTGAATCGGAATTTTGAGCAGAAAGGTGGAAGAACAGAAGAGCAAGTTGAGCTCTTGAAGCTACAACTTTGGATGATATATCAAGAAGAAGCATTCAATGGAAAACCAGCAAAAATTGCGAGATCTCATGGCCGGAAATTTCAGGTCACGGTCGAGAAGGAAACCTCTAGGATGTTGGTAAGATTAATCTCACTAGTCTTTAGTTTTGATTAGATTTCTGAATTCTTTTGATCAATGAACTGATGAATTTGAATGTGACGTTACAACAGCTGAAGCCGTGTATCGGAAACACAAGTGATAGAGCCAGATGCAAACAAGGCTTGTAAAAAGTTGGCAAACATAAATCTGATGCATCGTTTTAAGGTTGGTTGTTATATACAAAATTTTGGCATAATCTTGGCTTGTTATGCGTTTGGATCTATCTATTTGATCAAAGTTCTGGTATCATATTACAGATTCAAGTATATTCAGAACCAGAGTCTTCTTAAAGTGGATGAGTCAGACGATGAACCACTTGACACAAAACAAATCAGCTCTTTGAACCTCTTTCAACAAGATTTCGATGTGGAAGGACTTTTAATCATTTGTGAAGGCTATATCTGATGTAGATTTTGATGCCAGAAACAACAAATATTGTGAGATCTCATGGCAATAAATTTTAAGTCACAATCGAGAAGAAACCACTAGGATCTTGGTAAGAGTAATCTCACTAGTCTTTAGTTTTGATCAGATTTTTGAAGTCTCTTGATCAATGAACTAATGGATTTGAATAAATGTGGTGTTACAACAGAATTTTGGATGGGCTTATATGCAACTAAGGGACTATACAGCAGCTAAAGACGAAGTCTTACTAAAGTTGCTACAAGGAAATGGAATAACCTTTTCAAAGCAAAGGTTTGCTTCTAATACCTGTTTTATAAACGCAGTATTCCCAATCTTTGGTGCCTCGAAATTAAATTTCATATTTCTGCAACTTTACCTTCTCTCAAACATACAAATGTTGAGTTCCTGCTAGTACATTAACTTTCTTGCGTTTCCCCAAACATACATACTAGTTGTAAGCATATATATTAAGATTCTTGTCCCTCCTTTAGAGTCAGGTTGGCATTAGAGGTGAGGCTTCGGTTGGAGATGCTTATAACCAAATTTGGGTTGTGAAACTTGAGGAAAAGATGAAAATCCTGAAAATACGAAAAATTTGCTTACAATGTTCGAAGTTGGCTAGATTTCAATATTTGTGTTAACTCACATCTTCTCTTGGTTCATCTCAGATCAAGGAACGTAAGGAGAAAATATATGTAGCTGGTTCTAACATAAGGAGATCGCAACATTCAAATGATATTTCATTAAAAGTACCTTTCCAATTCTGTTGACAAATGCTCTCATAGAAGTATTTGAGTGCTCAATCCCTGATGTTCTTGATTTATGTTTTTCATTACTAATAGGTGGAAAGTCTTTGGATGGGGACGAGGACAATGATGGGGACTATATGAATGCGGTGTCGCATGGCCATAGCAAGGCTTCCTCGATTTTTAAATCTAAGAAATCTAAGGCATCTCTTTGAGGTTGGTTGTTATAAAGTATACACATTTTGGCATAATCTTCGTTTGGATCTATCCATTCAACTTTTTGGTGACATATTACAGATCCAAGTTTATTAAAACCAGAGTCTTCTTGAAGTGGATTACTAAGATGATTAAGCGCTGACTTAATGGATTAATACAAAACAAGATTAGCTCTTTGAACAAGTGAGGTTTGCAATTGAGTTAGATGATGTGGAAGGACTTCTAATCATCCGTGAAGGAAATATCTAATGCAGACTTGGATGCCAGGAACAACAAAGCCAGTCGTTTCTCTGTAAATTAATGGAGAAGGAACATTACTGGAAATACAAGGATCGAAATCTATTATCATTCTTCATTAACTAGATTTTAGGGCTTATATATATATATACCAAGAGTTATACTAGGTATTCTGGTTTGTATCTAAATATTTTACTTGTTGGTTGCAGCTGTTTAGGGTTTGAGATGTTGGCGTATCTTGCAACCAGCTTCTTAGAATCCACCTATGGATTCTCTGGCACAAGGATAATGGCTGAATACTGCATTTTCCCCCGAGGATATTATTTCATTTCAACTGATTTGATGTCAAAGTTACGATACCAAATCAGATAAGTTATAATTATCTTAACTTGTCATACCATATATACAAAGCTAGACAAGAGTTTATTTGATGTACATTCTTTCGTATCATTCAATTTTTAGAACCTATAAGCAGTGCCAAAAGGTTTCTAGAAGAACTTCATCTTGGTATAAAATAAGACGATCCGCCAACCACGAACTCCCACTTGTAAGTTGTCATTTTAATGTAATGTTATAGTTACTCAACAAATTATATAAGATATAATTTTCTTAAATTTTCGTGAATGAATATATAGTCAGATCAATGGAACTAAGCTTGAAGAAGGTTTATTATTTTGTACACTCCGTATCAAACATTTTATACAAGCTAGAAGCATTGCCAGAAGATTCTAGAAGAGCTTCATCATCGAGTATTTTAAGACGATCAGCCAGCCACGAACTTCCACCTGTAAGTTTTCATTTTATTGATCCCATGATTATTCATTATGCATAGGACAACTTTTTAATCGTACCAACGACTTGGTAGGTCATCTTGTATATATTTGCACTGATGGTACATTATTTTAAGTGTATATTGTTTTGGATTTTGCAGCTTAAAGCACTGCAATCCGTAGCTAAGAGATGAAACATAAGAGATGTAGTTCTAGAGAAAAGCCAAAAACTGGATCAAGAAAGAGACTTGTGGAAAAATATCAAATTTTTTGAAAAGAACTTATTGGGGTCTTTGTTTCTTGTGTTCTTAAATCAAAAACACATTATGTCGCTTATCTCCCAGGCATCGTTTTGCTTATTTCAGGTATATTGCAATGACTTCGGACATAATTAATGTATATCGTTTCTTAGGTTGACTCCTTTCCCTAGTATGTTACTCCAATGTTTTTCTACAATAATATAGTTTCTAGTAACTTAAATCTTTTTGATATTATATAGTAATATGTGATCATGTGGGTCTCAATCTATGAAAACTAATCAAATATTGATTCAGCTTTTTTTACAGGTAAGTAAAGAGAAAAAGATACCGAGCATATGACATGCTTGTTCAGATTGGTCATGCATACGCAGATGAAAAAAACTACATAGGTACTTCAATATGTTATGTTTAGTTCAATCCTAACAAGTCATTGTAACATTGTTCAGGTCTTTGTTTTTCTTTCGTGCGTCAAGATTAATTGTTAGCCTCTGCTATAATTGTAACAGGTGGTTGGTTGCCTTGATGAAATAACCTTAAGATCATTAGTGTTGTTGTTAAGGGCGTAGCTCGTTTGGCATCTGGTCTTATAATAGTGCTTTTAATCTGCTTCCTTCAACATTGCTTCTCCTTCAACGGAAAAACAAGGAAATTGCAAAAATTAGTGATCTTCTTCCTTTTCAAGGGTGTTCCTGTGAGTAAGCCATTTGTCTCACTTGTTTAATAACCAGACCCGGTGAACTGTTTTCCCTTATCTGAAAAACATGCCAATTTACGTTTGTTGAAGGTGCTGGGTGGCTAAAACTACGCGTTGCAGAACGACACAGAAACTTAAAGAACATGGTCGAAGGTTTACTGAAGTTGCCAGAAGAAAATGAATTACCTTTACAAAGAAAAGGTGTGCAACTAATATCTTTGGTGCCTAGAATTTAATTTCACATTTGCACAGCTTTTCTTTGTCTCACACATGTAGACGCAGACAATTACAAATGTTTGGCGCCTTGCTAGTACATAAAAATTGATTGCTTAGCCGTAAATATACATACTAGGTGTTAATATCTATATTAGGATTGTTTCTGTGGATTGTTGTTCTTTTGAAGAGTCGTTTCAGTCTTATAGGTGATGCTTTGACTGGAGATGCTCATCAAGAAATATGACATGAAGGATTTCAAGTCTGTGAAGCCTAAGGAACATATAAAACTCCTAAAAACACAAAAGGTTTGTTTACGATATTCAAAGTTGTCTAGATTTCAATGTTATGCCTTGCATATTCTCTTGGTATCAATGCACTTATGGAGAAGAATATGCAGCTCCCTCTGACGTAAGTAGATCACAACATTGAAAATAAACTTCATGAGTGCTCGAGTATTGATGTTCGTGGAGGCGTTGTTTTAGAACTCTAGAGTTACCTTCTAGTTTCTTAAGTTCTCAATCATTTTCCCAGGTATGTCTTTAATATTTTTCTACTGCGTAGTATCTCGTTTCTTCTCTTATAACTTGAAGTTATCATCTCTTTTACTTTTATGCAGGAGCCGATTTCATAGCCAACGAACCTTGTGAACTAAAAGAAGTTATGTG