Search result

BaseInfo

ncRNA ID	ath_circ_026252
Species	Arabidopsis thaliana
Class	circRNA
Genome position	5:7609581-7614438[+]
Reference genome	TAIR10
Source	PlantcircBase
Method	NA
Type	intronic
Splice junction sequence	TTCTAGGACTATTCAAAGTCCTTCAGAGCAACCAATCAGCTAAGTTATAAATGTCTTAATTTGACAGACCAAATGAACTAAGCTACACAAAGTTTATTTGTTCTTCTCTTATAACTTGAAGTTATCATCTCTTTTACTTTTATGCAGGAGCCGATTTCATAGCCAACGAACCTTGTGAACTAAAAGAAGTTATGTGGTGA
Tissues	leaf, inflorescences
Exon boundary	No-No
Splicing signals	AG-GT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	TTCTAGGACTATTCAAAGTCCTTCAGAGCAACCAATCAGCTAAGTTATAAATGTCTTAATTTGACAGACCAAATGAACTAAGCTACACAAAGTTTATTTGATTATTTCTTATCATTCAATTTATAGAACCTATAAGCAGTGCTAGAATTTTCTGGAAGAACTTCATCTTAGAGTTAAACAATACATTCCGCCAACAATGAACTGTCACTTGTAAGTTGTCTAACTCTTAAGACTCAATGAACTTTTTTTTTTTGTTCTTCTGAAAACTACAACAATCTTTTTTGAAAACAGGCAAATTTTATGTTTGTTGTTGGTGTTGGTGGCTGAGACAAGCTCAAGAATCATTAGAAAATGTACTCATCGATCTTTATAAGGTAAATAAACTCTAACTGAGACCATCCTCTCGTTTCTCTCAGTTTTTGTTATTAGATTGTAGAATTGACAAAATTGAATCGGAATTTTGAGCAGAAAGGTGGAAGAACAGAAGAGCAAGTTGAGCTCTTGAAGCTACAACTTTGGATGATATATCAAGAAGAAGCATTCAATGGAAAACCAGCAAAAATTGCGAGATCTCATGGCCGGAAATTTCAGGTCACGGTCGAGAAGGAAACCTCTAGGATGTTGGTAAGATTAATCTCACTAGTCTTTAGTTTTGATTAGATTTCTGAATTCTTTTGATCAATGAACTGATGAATTTGAATGTGACGTTACAACAGCTGAAGCCGTGTATCGGAAACACAAGTGATAGAGCCAGATGCAAACAAGGCTTGTAAAAAGTTGGCAAACATAAATCTGATGCATCGTTTTAAGGTTGGTTGTTATATACAAAATTTTGGCATAATCTTGGCTTGTTATGCGTTTGGATCTATCTATTTGATCAAAGTTCTGGTATCATATTACAGATTCAAGTATATTCAGAACCAGAGTCTTCTTAAAGTGGATGAGTCAGACGATGAACCACTTGACACAAAACAAATCAGCTCTTTGAACCTCTTTCAACAAGATTTCGATGTGGAAGGACTTTTAATCATTTGTGAAGGCTATATCTGATGTAGATTTTGATGCCAGAAACAACAAATATTGTGAGATCTCATGGCAATAAATTTTAAGTCACAATCGAGAAGAAACCACTAGGATCTTGGTAAGAGTAATCTCACTAGTCTTTAGTTTTGATCAGATTTTTGAAGTCTCTTGATCAATGAACTAATGGATTTGAATAAATGTGGTGTTACAACAGAATTTTGGATGGGCTTATATGCAACTAAGGGACTATACAGCAGCTAAAGACGAAGTCTTACTAAAGTTGCTACAAGGAAATGGAATAACCTTTTCAAAGCAAAGGTTTGCTTCTAATACCTGTTTTATAAACGCAGTATTCCCAATCTTTGGTGCCTCGAAATTAAATTTCATATTTCTGCAACTTTACCTTCTCTCAAACATACAAATGTTGAGTTCCTGCTAGTACATTAACTTTCTTGCGTTTCCCCAAACATACATACTAGTTGTAAGCATATATATTAAGATTCTTGTCCCTCCTTTAGAGTCAGGTTGGCATTAGAGGTGAGGCTTCGGTTGGAGATGCTTATAACCAAATTTGGGTTGTGAAACTTGAGGAAAAGATGAAAATCCTGAAAATACGAAAAATTTGCTTACAATGTTCGAAGTTGGCTAGATTTCAATATTTGTGTTAACTCACATCTTCTCTTGGTTCATCTCAGATCAAGGAACGTAAGGAGAAAATATATGTAGCTGGTTCTAACATAAGGAGATCGCAACATTCAAATGATATTTCATTAAAAGTACCTTTCCAATTCTGTTGACAAATGCTCTCATAGAAGTATTTGAGTGCTCAATCCCTGATGTTCTTGATTTATGTTTTTCATTACTAATAGGTGGAAAGTCTTTGGATGGGGACGAGGACAATGATGGGGACTATATGAATGCGGTGTCGCATGGCCATAGCAAGGCTTCCTCGATTTTTAAATCTAAGAAATCTAAGGCATCTCTTTGAGGTTGGTTGTTATAAAGTATACACATTTTGGCATAATCTTCGTTTGGATCTATCCATTCAACTTTTTGGTGACATATTACAGATCCAAGTTTATTAAAACCAGAGTCTTCTTGAAGTGGATTACTAAGATGATTAAGCGCTGACTTAATGGATTAATACAAAACAAGATTAGCTCTTTGAACAAGTGAGGTTTGCAATTGAGTTAGATGATGTGGAAGGACTTCTAATCATCCGTGAAGGAAATATCTAATGCAGACTTGGATGCCAGGAACAACAAAGCCAGTCGTTTCTCTGTAAATTAATGGAGAAGGAACATTACTGGAAATACAAGGATCGAAATCTATTATCATTCTTCATTAACTAGATTTTAGGGCTTATATATATATATACCAAGAGTTATACTAGGTATTCTGGTTTGTATCTAAATATTTTACTTGTTGGTTGCAGCTGTTTAGGGTTTGAGATGTTGGCGTATCTTGCAACCAGCTTCTTAGAATCCACCTATGGATTCTCTGGCACAAGGATAATGGCTGAATACTGCATTTTCCCCCGAGGATATTATTTCATTTCAACTGATTTGATGTCAAAGTTACGATACCAAATCAGATAAGTTATAATTATCTTAACTTGTCATACCATATATACAAAGCTAGACAAGAGTTTATTTGATGTACATTCTTTCGTATCATTCAATTTTTAGAACCTATAAGCAGTGCCAAAAGGTTTCTAGAAGAACTTCATCTTGGTATAAAATAAGACGATCCGCCAACCACGAACTCCCACTTGTAAGTTGTCATTTTAATGTAATGTTATAGTTACTCAACAAATTATATAAGATATAATTTTCTTAAATTTTCGTGAATGAATATATAGTCAGATCAATGGAACTAAGCTTGAAGAAGGTTTATTATTTTGTACACTCCGTATCAAACATTTTATACAAGCTAGAAGCATTGCCAGAAGATTCTAGAAGAGCTTCATCATCGAGTATTTTAAGACGATCAGCCAGCCACGAACTTCCACCTGTAAGTTTTCATTTTATTGATCCCATGATTATTCATTATGCATAGGACAACTTTTTAATCGTACCAACGACTTGGTAGGTCATCTTGTATATATTTGCACTGATGGTACATTATTTTAAGTGTATATTGTTTTGGATTTTGCAGCTTAAAGCACTGCAATCCGTAGCTAAGAGATGAAACATAAGAGATGTAGTTCTAGAGAAAAGCCAAAAACTGGATCAAGAAAGAGACTTGTGGAAAAATATCAAATTTTTTGAAAAGAACTTATTGGGGTCTTTGTTTCTTGTGTTCTTAAATCAAAAACACATTATGTCGCTTATCTCCCAGGCATCGTTTTGCTTATTTCAGGTATATTGCAATGACTTCGGACATAATTAATGTATATCGTTTCTTAGGTTGACTCCTTTCCCTAGTATGTTACTCCAATGTTTTTCTACAATAATATAGTTTCTAGTAACTTAAATCTTTTTGATATTATATAGTAATATGTGATCATGTGGGTCTCAATCTATGAAAACTAATCAAATATTGATTCAGCTTTTTTTACAGGTAAGTAAAGAGAAAAAGATACCGAGCATATGACATGCTTGTTCAGATTGGTCATGCATACGCAGATGAAAAAAACTACATAGGTACTTCAATATGTTATGTTTAGTTCAATCCTAACAAGTCATTGTAACATTGTTCAGGTCTTTGTTTTTCTTTCGTGCGTCAAGATTAATTGTTAGCCTCTGCTATAATTGTAACAGGTGGTTGGTTGCCTTGATGAAATAACCTTAAGATCATTAGTGTTGTTGTTAAGGGCGTAGCTCGTTTGGCATCTGGTCTTATAATAGTGCTTTTAATCTGCTTCCTTCAACATTGCTTCTCCTTCAACGGAAAAACAAGGAAATTGCAAAAATTAGTGATCTTCTTCCTTTTCAAGGGTGTTCCTGTGAGTAAGCCATTTGTCTCACTTGTTTAATAACCAGACCCGGTGAACTGTTTTCCCTTATCTGAAAAACATGCCAATTTACGTTTGTTGAAGGTGCTGGGTGGCTAAAACTACGCGTTGCAGAACGACACAGAAACTTAAAGAACATGGTCGAAGGTTTACTGAAGTTGCCAGAAGAAAATGAATTACCTTTACAAAGAAAAGGTGTGCAACTAATATCTTTGGTGCCTAGAATTTAATTTCACATTTGCACAGCTTTTCTTTGTCTCACACATGTAGACGCAGACAATTACAAATGTTTGGCGCCTTGCTAGTACATAAAAATTGATTGCTTAGCCGTAAATATACATACTAGGTGTTAATATCTATATTAGGATTGTTTCTGTGGATTGTTGTTCTTTTGAAGAGTCGTTTCAGTCTTATAGGTGATGCTTTGACTGGAGATGCTCATCAAGAAATATGACATGAAGGATTTCAAGTCTGTGAAGCCTAAGGAACATATAAAACTCCTAAAAACACAAAAGGTTTGTTTACGATATTCAAAGTTGTCTAGATTTCAATGTTATGCCTTGCATATTCTCTTGGTATCAATGCACTTATGGAGAAGAATATGCAGCTCCCTCTGACGTAAGTAGATCACAACATTGAAAATAAACTTCATGAGTGCTCGAGTATTGATGTTCGTGGAGGCGTTGTTTTAGAACTCTAGAGTTACCTTCTAGTTTCTTAAGTTCTCAATCATTTTCCCAGGTATGTCTTTAATATTTTTCTACTGCGTAGTATCTCGTTTCTTCTCTTATAACTTGAAGTTATCATCTCTTTTACTTTTATGCAGGAGCCGATTTCATAGCCAACGAACCTTGTGAACTAAAAGAAGTTATGTGGTGA