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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_025983
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:6912487-6930323[-/-]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence CTTTAGAGCTTCCACCTCTGATGTTAATGAATTGAATTTTTCAGTATCCTCAGAATTCTCCTTAATGACTTGAGGAGCTTCTTCAATAGCTTTCCTTGCACATTTTCAAGCTCTGTCGCCAGCTCGGAATTTCTAGCTTCTGCCTCAGAGAAAGCTTTTCTCAAATTTTCTGCGGCTTGTCGTTCAGCCTGAAGCGAAGC
Tissues root, aerial, inflorescences, seed
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTTTAGAGCTTCCACCTCTGATGTTAATGAATTGAATTTTTCAGTATCCTCAGAATTCTCCTTAATGACTTGAGGAGCTTCTTCAATAGCTTTCCTTGCAGTCTCCTGTTCTCTAATCACATCAGCTTTTGCTTCTTCAGCTAGCAAGCACATTGCGTGCAAAGCCTCCTGTAGTTTTGCATATTCAAAAGCAACAACTTTTGCAAACGATTCAGGGTCTCTTAATGTATAAGTTGGGTACAAGAATGACAGACACTAATGAAGAGGGTTCTATGATAATGACCTGAAGAATCCTAGTAACAGCCTCAGTAAAAGGTTCCAAGTCCTGTGACATTTATAGACGATACCCAAATTGAAGAAACAATGAACAAACATGATTTCTTGTATACATATAATCATATGTAACAGAAATTGAGAAAACGAATTGATTCATAAGTTGAGCAAACGAAAGACGCTGCCGTGTTCATAAATGATCTGGAACATGTTGAGAGAGTACACATAAACATGTTGAAATAGTACATACATTATTCTAAAAATGATGAAACAGAACAACAATGAAGCAAGAAACAACCAACTTCAAATTTTAACAAAAGAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGCAATCAACTTCAAATCCATATGTACCATCATCTTCAAATCAGAGCCACCCGCTAAGAAACGGCTTGAACAAGACGAGATTCACCAGTGAAAGGAGTTCGAAATTGAGAATCTACTACGAAACAAGCTACACGAAACCAGTCGGAGGATTACAAAATCGCCGATTTGGGGAGGGACTAAGTTGGGATATTCTTCGCTTGAAGTGCTCGTGAGTGACTGAGTAGGCTTAGTATTGGGCTTTGGTATTTGGGCTTTAAAGTTTTGGTCTACATAAAGGGTTTAACGATGATAACAATTAGGTCCCTTAGTTTTTTTTATTGGTTTTTAGTTTTTGGTTTTTGATTTTTGTAGTTTTTGATTTTTGTTGTAGATTTTAGTTTTTGCAAAATCATGAATGGAAATTTGTTTAATTTATAGTTTTCTACATATTAATTTTAAATGTTTATAGTTTTCTACATATTAATTTTAAATGTTTTTAAATTGTGTATTTTTTATATATATTTTGTGTTTAAAATAAAAATTAGTTAAAACTTCACAGAATAATGTTTTAGTTTTAGATGAAAATCTATGGAATAGGGTTTTACGTTTTTTTTGGATAGGCTAATAAGATTTTATGTTTGGATGAATTGGTAAATGGTAAAAATAGCATAATTAAATAATAATAGTAAATTAAAAAATAAATGTTACGTAAGTTTAATGTTCCAATATAAGACACTTTAAACGTAAGTTTAGACAATATAGGCACTTTCCAAGTTAGAAGCACTTTTCCTTCTTTTTGAAGGAAAACTTGACTTTTATACCCCTTAACTAAACAATCGAAAACAATAATTAAATATATATCTTAACCAAACAATTAAAAAAATAAAAGAATTTAGATACGTAGTTATTAATATAGACCATTAGATTGAAAAATAAAAATTAAGATCTATGAGATTAAAGACAATAAATGGATTAATTTTTTGATGTTATATATCTGATTAGAAAAAGGTATTTCTCTTCGTCTCTAGAACTAAATCTCTCTCTCTAAAAAAACAATTGTTTCTCCGTTTCTCCTTCCTGAAGATCGTTTTTTCATATATCCATAGTAGTTTAAAAACGAAGCAGAGAGATGTTGAAAATCGTTTCTCATGGAATTAATCGATTATTCTCTGTGAAGTTCTTTAATCCACACAACTTTCCTCATGAACATGATAATAGTAGTAAATGGAGGTTTTTCCTATGGTTACTCTAGACGAAGGAGGATCTCCTTGTGTTGGACAGGTTTGTGATTTCTTTCCATGGATTAAAAAAATTTGATTGTTTGTTTATGATGAACGATTCTTTGGCTACGGAAGAGTGTCATGGAGTTCTGGCGAATTCTTTGGCTATGTTTGGTGATTTCGTTTTTAATCAAGTTGGGAACCAATAGGAAACAACTAAGCATACAACATAGATTAGAAGAGATATCAAGATGGATCTAATTTAAGTAAGATTTGGCGACTAATTCTAGATGATTAGGGTTATTTGTGATTTATTACAAGGCATTTGTGTTCTCATTGATTTGGCGAGTAATTCTGTATAACTAGGGTTATTTGTGTTTTCTTAAAAAGAATTTGTGTTCTTGTTGAAATCTTGTTCATTGGAATTATTTGTGTTTGGTAAATCTTCATTGGTGGCTAAGGATGTGTTTGTAGCTCTTACGGCGTTTGTTATTGGTGATGTCCATTATGGATGGCAAATTATGGATGGCACATTATGGATGATGAATCATGGATGACATATTATGGATGACGCATCATGGATTGTATATTATGGATTGATATGGTGAGATTTGTAAATCTTTTGGTCTTACATGTTAAGAGTAAAAGATGAAGAATTGGAGAAGCATGTCTAACATCCTAAAAACAAGCTATATGCGGTTGATTTGCTACAAATAAATTTTTGGTATCCATAATAACAAGTCCATTTAAATATATCCATTCAGAAACCTTTCTACTGATCCGTATCCATTCTATATACCATGTCAATAATAATAGGAGATTCGATTAACCGTGTTTTGTAAAGAAACCAAAGTTCCATGTCCATAAGGTTTTGAAGGTGGAGGTCTCTGCAAACTGAAAAAAAAATCAACAAACAATTTTTTGGTGTCCATAATAACGAATCCATTTCAATATATCCATTCGGAAACCTTTTTACTGATCTATATCCATTTTATATAACATGTCCATGATAACAGGAGATTCGATTAACTGAAATCTCGATGCTACGTAGATGAAACGAGTTTGACACATGAGAGAGAGCAAAAATCAAATCAAGCCGCCATTGTTGAAGAAGAAGAAGTTTCTTCTCATTTTTTACAAAGATGAAGAGAGAGAGAGAGGTGAAGAGAGAGAGAGAGAGATGAAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGATGAAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAGAAAACGTGGGTTAAGAGAATATTTTAGTTAAGAGGGTATTTTAGTAAAATAACATAAAAAAAGTGCCTAATCTTTTGAAAGTGCCTAAACACGGAAATAGTTTTAAAAAAGTGTGTAAAAGTGTAATATTCTCTTTAAAAAAACCACAAAACTTGGTTTTTAAATTCTATGATGAAATAGTTAAAAGCTCATAAAATCTGGTTTTCCTATTTTTTAGGAAATCTACTTTTTGTAGAATCATGAACGGGTAATTATTTGGATTTTGCAAAATCAAAATCCAAAAATTACTTCAAAAACTCCAGCCGTGTCCCGTGTCTAGTTTTTTGGTTTTTGATTATTTGTAAATATATTTTTTTCACCTTTCGATATTTTTTAAGAAATTAGTTTCTTAAAAACATTTAGGGAAACTAGTATTTTTTTAATGGTTTCTCTAAACATAAAGTAGAAAGTAGAGACCATGATTTTCAGCTTTTTGTGGAAAGCTTTTATTTTTAGGAAATAAGGTTTCCTTTTTATTTATTATTATAAAACTTTTATCAACGAAAAACTAAAAATCAATTAAAAATCTTTCGTCGTTCATAACCTAAAGAATTTGGATGGGATATGGAGGAATGCCATGTTGATTGATAAAGCAGAATTGGCTCCTCTTAAATATAAGTTATGAGTCGTTTATTGCAACAACACTCAAACCAGCAAAATATATAAATAACTAAATTAAAATCCATCCCAAAAAAAAGATTGAATACATTCTCAATGCAGGACTACATCGTCAAACACACCAATGCCAGTTTATGATGGACTAGCTTCTTTACGAGTGAGTAAGAAGCTGAAACTTGAGTTTTCGCGGATCAGCTGAGGAAGTTCAATGTCGTTTACATTCACTTGTTCCATTGACTCTGTTATATCCCCCACCGTGAATGGAATGCTGCGTTTTGATTGATTCCCTCGCATTAGTTGAGAAATGAGAAGGATAGAAACAGATTGCCTAAAAAATATTATCAGGTTACCTATCGTCCTCGTCCAAAAGGAAGGAGCTGCTTACGGCATTGTTCGAGTCCTCTGTCATCATAACCCTCATGTTTGCAATAACCTATGGTTTCGGAAAGAACACAATTAGTACCATATCTAGACAAAAGAAGGAAGCCTAGTTATTTTAAAAGTGAAACATACATCTGAAGAAACACTATGAGTGCCATATTTCTCATCCCAGTAATTTGTGCTGATTCTGTATAGCTGCTGTATACTTAACACCTGACCCAGAAAAGCAACTTCAACTATAATCTCATTAAAATACACGAGCTAAAGACAGCTTTAACAGAGTAGACGAGACTAAATACCGGAAAGAAACTTGTAATTACGGCTAAGCTCATTTTTGGCTTTTGATAAGTAACCTAAACAAAGAGTCAAAACAAGCAAAAGTCACATAAGCACAATTTAACGGCAGTGCATAAACGGAGTGGCATAGCATCGACTAAGAGTTTTACCAGGAAGCCAACAGCCTGCCTGATATGCCTTAACTCATCCCAAGCTGAGCCAGCATACTTTACGAAATGAAACAACAATTCCAATTCAAAAGATAAAAAAATATTCAAGCGATCTAGAGGCAAAGCGTGACGAAATCTCGGCTTACTTCATCCGTAGCCTCTATACACCACTGCTCTAATTCAGCCAAACCAGCTTTAACGTACTCCCCATTGCTGAATGAGCAACACTCACCACGTAGAAGAACACTGCACAAGTTTAATGACATAATTCTTTCTGTCAACCAAGGAAAAAGTGGTTTGACAGGAAAAAAAAAGGAAACAAAAGAGAGATTCGAAGTGAAACATGCCTGTGGAAGAGTTGCAAGTTGATGAAGGAGAAGATTTGTGTGAATAATTGGCCGACTATGAAGGGTGGAGCCTGTATCATGTTAACATATATTGTATTAATCATCATTTGCCAAAAGAAGT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