Search result

BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_025698
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:6204331-6214304[+/+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence GTGCACCATGGCTTTTACAGTGCTTATCACAATACAACTTTACGGCCTGCGGTTTTGGATGCAATAACACGAGTGAAAAAAGTCTACGGGGCGAACATCATGCTTGTTCATCCAAAAACTTGTGCAGCATACAAAATTGGGTCTCAGACTTGTTCTGGAAACAGCTCGATCTAAATTACCCTGATATGCCAGATGCAATG
Tissues leaf/aerial, inflorescences, whole_plant
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTGCACCATGGCTTTTACAGTGCTTATCACAATACAACTTTACGGCCTGCGGTTTTGGATGCAATAACACGAGTGAAAAAAGTCTACGGGGCGAACATCAACATCATAGTGACCGGTCATTCAATGGGAGGAGCCATGGCTTCCTTTTGTGGTCTAGACCTAGTTGTAATCATCCTTGCATTGAATTTTTTTTTTATCTTATTGTTTTGTCCTTTGAGTTGTTAATGGCTTATATTGGATACAAATCGCAGGTAAATGAAGGTGAAGAAAACGTACAGGTTATGACATTTGGGCAACCTCGTGTTGGGAATGCCGCTTTTGCATCTTATTACAGTTTGCTTGTGCCCAATACCTTCCGGATCACGCATGACCGTGATATGGTTCCTCATCTGCCTCCTTACTATTACCATTTCCCTCAAAAAACATACCACCACTTCCCAACAGAGGTAACATCACTTTCTCAGTGCACTGGATGTTTATCAGAATAGCAGTTTTAATTTTGCAAAAATCTGGAATACTCAGTAGTGATCAGACAAATTTCTCCGCTTGGTTTATTAACTTTCTGAAAAAACGAAGAAAGCAGTAATGGTGTGTTCCGGGATGCAGGTGTGGGTGAAAGATTTCAGTTTTTCGAATTTTGTTCTTTTTGGTTTGGAGAAAGTTTGTGACAACACTGGTGAAGATCCTACTTGCAGCAGGTAACTATCAATCCCTCTGAAACAACTTACTGATATAATTTCTCTCCACTACATTAGCAAGAACAAACTTCCAAGTCGAAAATTGTGATCGTAATTTACTACCAGATTTCACCAGAGCGATGGCTATTGGTCTTAAATCGTTACAACATGCATATAGGTTTTACATGAATCCAGTATAACTCTCTAGGCAATTGTTGTTTCAGATCGGTAAGGGGAAATAGCATTTCTGACCATTTAAGGTACTTTGGGGTAGAGTTGAAGTGTGAGAGTTGGAGACAGTGCAGCATAGTGATGAATCAAGATATGGAGCGTTACAGCAGGAAAGATTCAAGGGGTAACTTATTCCTCTCGCGGACAGTTCCTCCTAAGGACGTAGTCAAAACAAGTTCTCTATCGAAAACCGGAATCTCTAGTCTGTAGGTATATGTTGATCTCAAGTCTTGAACAAGAGAAAGCTCGCTGGAAGAGGAGGTTTGGGGGATTCAATGTGTGGAGGAAGAACAAGGGTTCTTTGATTCTTTGTGATGGCAAGAGAAGGTGAAAAAATGATTCTGTAAATAAATCCTACGTTGGTAGCATGTAAAATCTTTTTCAATTTAAATGTGAATGAATAATCACATTGTACAGTAGCAGATTCCGAATTCTTTAAATTTGTATCCATCAATTTCTTCTGTCAATTATTAATCAAAGTACAAACATCATTTTACTTAATAGTCAACAGCTTTATTACCAAATTATTTTTGCAACATATTTGAAATGTCTTTTTAATAACTAAACATATTTGAAATCGCAGGTTGTGTTGGGAAAGTGATGACTGTGGAACTAGAAAAAATCTCAAGCACAAGACTATATTAGGGTTCAGGTGCTCCTTGATGTTCGAAATCCTTTGCGTAACTTTAAGGAAGTTCTGCTCCTACCGGGTGAAATGATATCAGTATCTTTTGATTTTGAAAGGATTCGGAAAAGATGTTTCCTTTGTCAACGTCTCACTCATGAGAAAAGTGTTTGCCCCTTTGCTACTGTAGGAAACACTAGAGATTCAGAGGAAGATCATAGGAGTGTAGACTCAGGTTTTCTATTTGGAAAGAAATGCTTACTGAAACCAGGAGAGATGATTGTTCCTACAAAGTTATCGTCTATCTCCACTCACCAAGAATATTCAATATTGCCGGAGGTAAATGATATTCCAAACCATGAGACTGGTGATTCAAAAAGATCTAGTCATCCTTCTGGTAATCTGGACTATCCTACATCTAAAGGATTCCTCTTTGGGTTTAATGAGTCTGGTTCATCTGGATTAAGTATTAAGCAGAAGAATCCAAGAAAAAGAAAAGCTCTTTTAGTTCACAAGAGGCAAGATTCTTTCGCTGGTATAAAAGAGAAAGAGGTTAGTCTTAATATTGAGTTTGCTTCTGCTATCAAAAGGAATAAGAAAATTACAGACTCGGAAAGATCTGATAGTACAGTAAAGTCTCTCATTACGGTGGTTCCTCAAGAACCACCGCAGTATCAATAAGACATCCTTAGTTGGAATTGCCAAGGACTGAGGAACCCTTGGACAATTCGGCACTTGAGGGAAATGAAAAAGGAATATTTCCCTGACATCTTGTTCCTCATGGAGACCATGAATTCTGACCTGTTTATTTTGAAAGTTTTTAGGTGGTTGGGTTATGGTTACTTTCATACTATTGAACCGGAAGGAAAGAGTGGTGGATTAGCAATATTTTGGAACCAACATCTTCATATAGAGTTTCTTTATGAAGACAAAAATTTGCTGGATTTGGAAATATCTCAAGGATGTAAGAGATGGTTTATCTCTTGTGTTTATGGTAATCCAAGGCAGAATCTCAGACACTTGCTTCTGGATAAAATCAGTAACATTGGTGTGAATCGAATGGCAGCTTGGAGTCTGATAGGGGATTTTAATGATATCTTGTCTAATAAGGAGAAGATAGGTGGCCCATCTAGAGTAGAATCCTCCTTTCAGGACTTCAAGAATATGTTATCAACCTGTGATATGCATGAACTGAGCAGTACTGGGAATAGTTTCACTTGGGGAGGGAAAAGAAATGAAGAGAATGGATTCAATGTAAATTAGATCGCTGTTTTGGAAATTCACAGTGGTTTTCTTTGTTTCCTAATTCACATCAATGGTTTTTGGAGAAGCTTGGATCAGATCACAGACCGGTTTTGGTGAAATTTGTCAATGATCAGGAGCTTTTCCGAGGAACTTTTAGATTTGATAAAAGATTTGCTGAAGACCCTCAATACCAAGACGTTATTCACAAAGCATGGATAGGTAATATTTCTTCTCATAATTCTTCTTCTATGCATCGACTGGTTGACTGTAGGAAATCTATTAGTCATTGGAAAAAAGGGAAGGATTATAATGCTGAGAATCGAATTAAGAGGTTAAGGTTTGAATTGGATGAAGAAAAGAGTTACCAATTTCCGTGTTGGAACAAGATTTCTGTTATTCAAAATCAGTTGGGTATTGCCTTTAGAGAGGAGGAATCTTTCTGGAGATTGAAAAGTAGGGATAAATGGATGGCTGGTGGGGATAAGAATTCTAAGTTTTTTCAGGCCTCTGTAAAAGCTAATAGAATTAAAAACTGCTTGAGTTTTCTGGTGGATGAAAATGGTATTGAGCACACTCTCAATAAGGAAAAAGGAAAAATAGCAGAACAGTTGTGGATCTGTTCACCTCTTCTTATCCTGCAAATATGGATTCAGTCTTGGAAGGTTTTCAGACGAAAGTTACACAAGATATGAATCATGATCTCACTCAGAAAATTACAGAACAAGAGATCTATAATGCTGTCTTTTCCATTAATGCTGAAAGTTCACCAGGTCCTGATGGCTTCACGGCGACTTTTTTCCAGACTCATTGGAATTTAGTTAAGAATCAAATTATTGCAGACATTATGGGTTTCTTTGAAACAGGCATCCTCCCTGAAGATTGGAATCACACTCATTTATGTTTAATTCCAAAAATCTCAAATCCAGAAAGAATGAGTGACATAAGACCTATCAGCTTATGCTCGGTTCTTTACAAGATAGTCTCCAAAATCTTATCAGCTAGACTGAAGAAACATCTGCCAGCCATAGTTTCACCAACTCAATCTGCTTTTGTAGCTGAGAGGTTAGCCTCTGATAATATTCTCCTGGCTCATGAGATAATTCATAATTTAAGAACCAATGATAAGATTTCCAGAGATTTTATGGTGTTCAAAACAGACATGTCTAAGGCTTATGATAGAGTAGAATGGCCTTTTTTAAAAGGTATTTTAAGGGCCTTGGGGTTCTGCAACCAATGGATAGGTTGGATAATGGGATGTGTCTCTTCTGTTTCTTATTCAGTACTGATTAATGGTCAACCTTACAGTCATTTCTTACCACAAAGAGGTATAAGACAGGGAGATCCGTTATCACCTTTTTTGTTTGTCATCTGTACTGAAGCTCTTACTCATATCTTAAACCAAGCTGAACGATGTGGAAAAATTACTGGAATTCGATTTAATGATGCAGGTCCTTCAGTGAATCATCTATTATTTGCGGATGATACTTTGATCATCTGTAAAGCAAGTCAAGAGGAATGTTCTCAGATTATGCATTGTTTATCACAATATGGGCATATTTCAGGACAAATGATCAATGTGGAAAAATCTTCGGTCACCTTTGGAAACAAGATTGAAGCAGAAACAAAAGATTGGATTATGCATAGATCTGGAATTCATGTGGAAGGAGGAACTGGCAAATATCTAGGACTACCAGAATGTTTCAGTGGCTCAAAACAGGTTTTGTTTGGCTTTCTTAAAGAAAAACTTTTATCTAGACTCAATGGTTGGTATGCTAAAACCTTATCTCAAGGTGGAAAGGAAGTGTTGTTGAAATCAATTGCTATGGCATTTCCAGTTTATGCCATGTCTTGTTTTAAACTTCCAAAGAGTCTATGTTCAAAGTTGACTTCTGTCATGATAGATTTCTGGTGGAATATGTTGCCTGGAAAAAAAAAAAATACACTGGATTGGAGCTGAAACTTTAATGCTACCAAAAGTTCTGGGAGGCTTTGGATTTAAAGATCTTCAGTGTTTTAATCAAGCTCTGTTAGCTAAACAAGCGTGGAGACTGCTTAGTGATAAAGACAGCCTTCTTTCTCAGATCTTGAAAAGCAGATATTATCTGAATTCAGAGTTCCTATCTGCAACAAAAGGCACACGTCCTTCATATGCTTGGCAGAGTATCCTTTATGGTCGAGAATTATTGAGAAAAGGTCTGAAAAAGGTCATAGGAAATTGAGAAAAAACATTGGTTTGGATAGACAATTGGCTTTTTGAGGGTAAAACGAGAAGACCTGAGAGTGTTCAGGTGATGGTGGATATTACTTTAAAGGTCAGTCAACTAATTGATCCAGTTTCAAAGAACTGGAACTTGAACATGCTCAGAGACTTATTTCCATGGAAAGATGCTCAATTAATTCTTAATCAACGACCAATGCTTTCAAAAGAGGATGCTTATTGCTGGTCAGGTACAAATCATGGTTTATACACAGTTAAATCAAGATATGATTTGAGCAGTAGCCAGAATCATAAGGAGATGTTTCACAAAGCACATGAACAACCTTCTGTCAATCCTATTTTCCAAGGTATTTGGAGTCTATACATAGCACCAAAAATCAAAATTTTCTTATGGAAAGCAGTTAAAGGTGCTGTCGCGGTGGAAGAGAGATTAAGGACACGAGGAATTCTAATCAATGATGGATGTTCTATTTGTCCTGAGGAGAATGAGACAATAAACCATGTCTTGTTTCAATGCTCTTTGGCCCGTCAGGTATGGGCTCTATCTTTGATGCAGTCACCACCTTCTGGATTTGGAAATTCGATTTTTACTAATATGAACCATGTGCTTCATAACTGTAAGAATCAAAGTATATTAAGACTCATGCGATATGCTAGTCCTTGGATCATATGGACTCTATGGAAAAATAGAAATAAAAGTCTTTTTGAAAGTGATGTGTCTATCTCTAATAGCATAGTACAGAAAGCATTTGAGGATTGGAATCATTGGTTATCTGCTCAAGATCCAAAGACTCAGTCTGAAGACACAAAGAAAGAAATGAAATGGATTCCTCCGCCTTGGAATGAATTGAAATGCAACATTGGTGTGGCGTGGTCAAGTAAAACTCAATTAGCTGGTGTTTCATGGGTAGTTAGAAATGATACAGGAGAGGTGCTTATACACAGTAGGCGATCTTATTCTCAGGTACATTCTAACTTTGAAGCTAAACTGAAAAGCTGGGAATGGGCTTTAGAGAGTATGGATAAACTACATGTTGATAGAGTTACTTTTGGAGCTTCTTCTCATGATATTATCAAAGCAATGAATAAACCAGGAGAGTGGCCAGCTTTGAGAGGACATTTGGATGCATTGCTAGATCTCACTTTGGATAAACCGCATTGGTATATGGCAATGGAATTAAGACAGTGTAACACGGGAGCTAATGAGATAGCAAAAAGCGTGATAACAGGATTGAGATGGCAGAGTTATGTTGCTAAAGGACCTCCCCAATGGCTACATTATCTTTTTGACTCTGAATTAATTCATCAGAGGAGTCGATGTTTGTCTCCTTTATAGGAGAATTTTGTGCTGAGGGTCTAAAGAGTAAGTCTAGTTCATACGAAGGACTTCTTGTCAGATAGTCAACATCAGAGTGTTGATTTGTTGATTAGTTTGAGTTGAAAAGTGTCTTATTCTACATCTCCACACGTTTACTTCAGAGTAAGGAAGGGTAAGATATTTGAAATATTTAGCATGATCCATTAGCTTCTAAGTTCCCTATTGGAAAGGAAGTCTGGCTGTCTCAGAAATGACTCAGCAAAAAAGCTAATGACTTAGCTATTCAGAGTTCATAATTAGTGACACATGTTTGACTCAGGATCATGGCTAAATAAACGTGGCCGTTGGTTAGAATAGCTAATAAGGAGGTTAGTGGTTCAATTATGGGGGTGATAGGGATCGGGAATTTCCTTTTTCTTGTCTTATATATATAAGTCGGTTATGTTAAGTCCTATCATCTCTTAGTATCCAAATTAGGCGAGAGTTCTTTTTAATATTTTGTTAGTTTAATATTATTTTAGTCGGTTCTGTTATTTCTCTAAGTCTTTATATATCTTTCCTGCTCTCCTTAGTTAGTCTATTTCCCATCCCTTTAGTTCCTAGTTTTCTTCTCTCTTATCACTATGGCAGATGAGTTGTGGGATGAGATACAAAATCTAGAATTAGGACAAGAGGATCCAGCCCTTTTCATTCCCCATGAGGCTTATGTGATGGTTGAAGCTTCAAATAACTTAAGTCTGATAGCGAGACCTCTGAACCCAAGAGTTCAAAATCTTAACTCTGTCGTGGTAGCACTTCCAAGATCATGGGGACTAACGACTCAGGTGCATGGAAGAGTTCTTGATGCAACGTATGTCCAGTTCGTTTTTGCAAATGAAATTGATCTGATGATGGTGCAAAGAAGGGAACCGTGGCTTTTCAACAATTGGTTTGTGGCAGCAACTCGATGGCAGGTGGCTCCAGCTCACAACCTTGTCACTACCATTGATCTCTGGGTGCAGATTAGAGGTATTCCCTTACCTTATGTTTCTGAAGAGACGGTTTTGGAGATAGCTCAAGATCTAGGAGAGATCATTTCACTGGACTTTCATGAGGCTACCTCTCCTCAGATTGCTTTTATTAGAGTTAGAGTTCGTTTTGGAATAACAGACAGACTGAGGTTTTTTCAAAGAATCATCTTCGATTCTGGTGAAACTGCAACCATCAGGTTCCAATACGAACGTCTCCGAAGACTCTGCAGTAGCTGTTTCAGGTTCACTCACAATCGAGCTTACTGTCCTTATCGTCAACGTTCACTCAGCATCGCAAGAGAAAGAGCCCTATTCTGTGATAGTGTTCAAAGATCATCAATGAATTCCCAGTCTCAAATGACTGAAAGTTCATTTCCAGTACCCATGACTCCACCTCCAAGAGTTGATCCTCCTCCAATGAATCACTCTGAATTTGTAGCTGCTTATCCACATCTTGCAACAGCTACAAATGTGAATTACAGGTTTACAGGAGACTCAAGCACCTCCAGACAAGACTTATCATCTGGTTCAAACAATATTCTGCCAAGAAGAACTACTCATTTCACAGACCATCGAAGGTGCTTTGAAGCTGGTCAATCCTCAAGACAAAATGAAAACAGAGAACCAAGAAGACCTACAGAAAGAATGTTGCCTCCATCTCACTTTGATCATGTTCAACGCTCTGGAGGGATTCTGAAACCTCCAAAAAAACGCTAACCAATCGATCAGTTTCTGTCATTTTTTGGGAAAGTTTGCAGGCCTAGTAGCAACACAGCTTCAAGTTTGAAGAAGTCTGCTTAGTTGAGTATGGTTTTTGGTTATGACATACTCTCTCTAAATTCCTTTTGATGTAATGTTTTAGTTTGGTTCTACTTTACTTTTAGTAATGTTTTTTCAATTTCAGTTTGCTAAAGCTTTGTAAGTGGAAAGTCCACTGAAATGAAAGGCAAATTGTCAGTGAAAAAAAAAAATAACAACTAAACACATGAGACAATCATTAAAAATCAAATTAAAATAAAATACAGATATTTGTCGAGTTTTGATTATTGTAAGGGTTTTAACGTAATTTAGACAAACAAATTGGGACCCTCTAAACAATAAAGAGTCTTTATAAGGATATCGAATCTCCGTCCGCTAAGTCAATCAGAAACCGCATCTGTCTGCGACTCGGTCGTTCCTGGTGTGGTTTCGTGTCGTAGTCATTAAAATCTCATCTCTCTCACTCTCAGTTCCAATAATACCCCTTCCTATCAGAGCCAACACGCATCCAGCATCCTTCATCAGCCTTTGCGTATGAAAATGATGAAACTTGAATAGAGATCATTCGTATTTCATCGACGTTTCTAATTCGCAATCACAATTGTTTTCTTCAAGGAATTGGTTTGCTTGCTTTGATCCTCAGTTTTGTCAAAGGTCTTTTTTTTTTTTCCTGGACTTGCTAAAATCTCTTGTGGCTTTTGCTCTGATACTTGTTAGTTTGGGTTTCGTGAGTCTCGCTTTATAAAGGTAAGACTATATTTTTGACTAAACTGCTTCCGGATTCTGCTTTGTTTTAGCTCAATTTTACTCTTCTTTAGGTTGATGAACAGAAGATGATGTGGTTGTGTGTTATTGTCATTTTGCAGGATATGGGACAAAAGAGATGGTTCTTCTTGTTGGCAATTTTTGTTTGTCTTGTTTCATCTTCATGTGGTAGAGGTGATAATGAAACTTATCCTCTGAGTCTCTTTGAGCCTAATCAAGATTTGAAATTTCTGTAGAATTATAGTGAATGGGAAGATGACAAATGAATTAAGACTGAACTTAGTGAATTTATGGTGACTTTTTTCTTTTAATTGCAGTTCTCAAGTTTAAGAGCGATGATGGTCGACCTGTGTACAATCATACGCTTGCCATCACACTTGTGGAGTATACTTCTGCGGTAAGTTAATAGCAGATTTCTACAGTATGCATTTCATATTATCTCTGCTAGATAGGAAGGAAATTCAAGATGTGTAACACTCGTCCTCATATTTTCATTTATTTGTTACTAGCATTACTAGAGAACAGAGCTTATGCTGATAAAGTGATAAGTGCACCAGATGGATGAATCGAGTTTATATATGTATGCAGGTCTATATGTCTGATTTGTCAGAACTCTTCACTTGGACATGCGAAAGATGCAATGGTTTGACAAAGGTATAACATTTGTTGAAGCAGATCACTATTTGAAGCCACAGTATCAGTATGTATAAAGCTAATAGCTTTAATTGGATATTCTGATGTCTTTAAGGATGTTGCAGGGTTTTGAGGTAATAGAGATAATAGTTGACGTTGAGCACTGCTTACAGGTCTGCCCTGAATCCTGATATCTTAAGCTACATCTGGACATGATATTTTTTTGTTAAACAATTTTATTAATATCAGTACGTGTAACTTTTAACACCAGGCATATGTTGGGGTGGCTAAGGATTTGAATGCTATCATTATTGCATTTCGGGGAACTCAAGAACACAGGTATTACTCTCCTCATGTAATCTAAAAGCTACACATTTGCCTAAACTTGGCTTATGCTTGTTCATCCAAAAACTTGTGCAGCATACAAAATTGGGTCTCAGACTTGTTCTGGAAACAGCTCGATCTAAATTACCCTGATATGCCAGATGCAATG