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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_025504
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:5596322-5597351[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence AGCTCCTAAGTGAAGAGGTTTTTGATTTCTCAAGAGGAGAAATGACTCAGCAGAAGATTAAAGAGCTGAAACAATCTCTAAACAGGTCTATTTGAGAATCCGTTCATTTGAATAACTTATCAAGGTTATGACTCGGAATTTTATGTGTCACCTCTAGGCATTTATCCAGAACCTGGCACTATTTTTCACTTCCTTTTTCA
Tissues inflorescences
Exon boundary No-No
Splicing signals TT-AG
circRNA sequence NA
Genomic sequence AGCTCCTAAGTGAAGAGGTTTTTGATTTCTCAAGAGGAGAAATGACTCAGCAGAAGATTAAAGAGCTGAAACAATCTCTAAACAGGTCTATTTGAGAATCTCAATTTTAGCATAGTAATTATTAGTTTTCAATCTTTATTATCGTGTATATGTTGATTAAGTGACGTTGTATCTCATTATTTACCTATTTGTGCTTTTTTTATGTGCAGTGAGTTTAAACTCATTCATGAGTTATGCCTATATGTCCTCTCAGCTTCTCAAAGACAGGATCTTATACGTGCAACACTGTCTGCATTGCATGCCTATCTTTCCTGGATTCCATTGGGTTACATTTTTGAGTCTACTTTGGTAATAGACTTCAAATAATTTATAGATTGATGTTAATTGGTACCACAATATGTTCTTCTGATAGCTGCTCTGGTTATTTACAGCTTGAGACCCTCCTTAAATTTTTTCCTGTGCCAGCATATAGGAACCTCACTATTCAATGTCTGACCGAGGTACCTCAGTTTTTAAGTTCAGTTTTTCCTAATGTTAATTGAATGTATTATTTATTTCTCTATTGGCTCGAATTTTGTCGATCAGGTCGCAGCTCTTAATTTCGGGGACTTCTACAATGTTCAATATGTCAAAATGTATACCATATTTATAGGGCAGCTGCGGGTAAATTAATCGTCTTCTTGTTATTTATTTATTTTTGTCTTTTAGTTCATTGTATTATTAAGAATGATTTTTCTTTCATTCTTATTAAGTTAAAGTAGTGAATTTGGTCTGCTTCTTGTTTGTCTTGGCTTCTTGCCTGATGGTCTACACTTGTTCTCGTACTTGCAGATAATTCTCCCACCGAGTACAAAGATCCCTGAGGCATATTCCAGTGGAAGTGGTGAAGAACAAGTAAGTATTTTCTGCACGCTTGGTTTTAAGGTAGATCGTTCATTTGAATAACTTATCAAGGTTATGACTCGGAATTTTATGTGTCACCTCTAGGCATTTATCCAGAACCTGGCACTATTTTTCACTTCCTTTTTCA