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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_025418
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 5:5349546-5357119[-/-]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence CTCAACACTACTCACATTCTCACCTCCCGTTATAATTATATCTTTCGATCTATCTTTAATCTCTAGATAACCATCGGAATGAATCACACCAACATCTCCGAACTAACAAACGCACACGGCGTCTCTCCCCAAAACACATCAGGTCTCGCCACCACCGCCACTTCATTCACCGCCGGATTCGTATACAAAACCGTTTCAAC
Tissues seed
Exon boundary No-No
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTCAACACTACTCACATTCTCACCTCCCGTTATAATTATATCTTTCGATCTATCTTTAATCTCTAGATAACCATCGGAATGAATCACACCAACATCTCCGGTGTAAAACCACCCGTTCTTTAAAGCTTTCTCTGTTCCGACCGGATCTTTTAAGTAACCGAGCATGACCGAGCTTCCTCTCATCACAATTTCTCCGACAGTTTCTCCATTTCTCTCAACGCTCAAACCCGATTCAGGATCCACCACGTCGATTTCAGTAAACCCGACGGTTCTCACTCCTTGCCGTGCCTTCAATCTCGCTCGATCGCTTGCCGGTAAATGATTCCATTTTGGCTTCCACGCGCACGAGACGATTACACCGGCGGTTTCCGTTAATCCGTAACCGTGACTGATAACGAAACCAATTGATTCGGCTCGGAGGAGGACGGTAGCTGGAGGCGGAGAACCGGCGGTTAAGATGTTGACGGGATGGTTAAGAGGCTGAGATTCCTGAGTCGCGGATAACATGTTGAGCACCACCGGAGCTCCACACATGTGTGTGACGCCGTGATCACGGATCAGACGGTAGATTAACGGCGCGTCAAATTTACGCAAACAGACGTTAGTTCCTCCGACGGCGGCGATTCCCCATGGATTGGTCCAACCGTTAGAGTGAAATATCGGTAGAGTCCATAAGTAAACCGGATTTTTCGGTACGGCCCAATCAATTAGTGAATCAACTGACATTACGAAAATTCCTCTGTGGCAGTGTACCACTCCTTTAGGAGCTGAAGTCGTACCGGAAGTGTAATTAAGCACAACCGGATCCCATTCGCTTTCGGGTCGGATCCATTTAAAACCCGGATCACCTCTTTCGATAAGATCATCGTAAGTGTAACTGAATTTTGAAAGATCAGCCACGTCAGCAACTCCTCCTTCCTCTTCTTTATCGGCGATGACGACGAGAATCGGCGGATCAGTCGTCATCATCGAGACCGCTTCAACGGCGAGATCAACGGAGAAGACGTCGACGAAAAGAAGCTTAGATTCACAGTGACGGAGAAGAACAGAGACGGTGCGTGCGTCGAGGCGTGTGTTGATGTTGTTGAGGATTGCGCCGGACATGGGAACAGCAAACTGGAGCTCGTACATAGCCGGAGTATTGGGAGAGAGAACAGAGACTACGTCAGACCTGCCGATTCCGATTGAAGACAGAGAAGACGCCACGCGGAGACAACGGAGGTTTGTTTCACGCCACGTGTAAACGGTGTTGCTGCCATAAACGATGGAGGTACAGTCACCGTAAACGGTGGCGGCTCTCTCTAAAAAACCTATCGGCGTCAACGGCGGCGAGTTTGCGGCGCATGGCTTCATTTCCTCCATCTCTTCCTCCTAGTGGTAATCAAAGACTCTACTGTACTGTACTGTTCTTACTGTTTATTATATAATGACATTTTATTTCCAAGTGAACAATCCACGTGATGAAAAATTTGTAAAACAATATTTTGGGTTTAGAAATTGAGAACAAATCTAAACCATTAGCTGGAAATTAATTATCTTCAGCTTCCACCACATTATAATCATAGACATTTGTTACCTACCCTACACAACCACTAGCGTACTAAGTCTTAAACCAATGTTCGAAACTACTAAATATAATTAGATGTTGATTTATAATGTATTGTTATTCGACACCACAACTTTCTTTGTTTGCTGATCGTCACTCAAAGTCACATTAATTGTAATCTTACTATTACGCCAATATAGATTGTTAAACAAACAAACAAAAAAGTTTATAGAGAATAACCTTAAAATATCGCTTAATCTCGTTGCAATATTGTTTGGTGGATCTAAATGTCGTATGTGGTAATTTCAATGTTAAAAACAAATATAATTGGCATATTATCTTTTATGTTGGTATGGTATTTTTCTACACTTTTATAACATGAAATGATTTTTCTTTAGATAATATTGTTAAACTTTGTAAAAGAAATAATGGTTGTAATATTGAAAATGATGTTAATATTTATGTACTATTCTCTTGTTAAACATTCATTTTAATTAGGCTATTCTTAATTAAGTATAGTATGTGATGTTGTTATTAACATTTTTACGATACCAAGATATATTAATTTGTCATTTTTTCCGATATAAATTTGATCATTTGTATAGAATATTTTAAATCTATATATTGAACTTAAATTTTAATGGAAATATTTCTTGGTTTAGTACGTACAGTATATATTATTTAGAGAATTTTTCTGATATCCATCTTTTAGTGACTAACTAATTTACTTCAAAGGTTTTGAATGAATTTTAAAATAATTTACTTAGATATATATATATATATATATATATATATATAATGACTAAATTAATCTACTTTAAACCATCGTTAACTAACAGTTTTGGTCGAACTATTTTGACGAAAAAAAACTGAAGTAAAAAAGTTCCAAAATTGGTTACAAACGGATAAATGGAAACCATAATTTCAACCAAACTCTACAGAATAAGAAAAAACAATTATGAAGTCAGAGATAAGAAAATTGAGAGATATTAAAAACAATTTACATTTTATTTTTTTGTTAAATTTCATTTTCTTTAACCAATATAAATGTTTCAAAACTTTAGCTCCGAATAGTAACTGCGTTTTGCGCTATGGGAGAAATGCGGTGCGGTTCAAATAGTAATGAAAATACATAGATACATATGTATATGTAGAAATTTTGATAGGGTTACAGCACTGTTGTGATACGGTTTTGAGTGCGGTTTTAGTTACCTTTCACAGCCTTAATTGGTTCAGGGATCAACCGATCGTCCGCGTTCGCGTCGTGGGTCATGTGATGGTTTAGCCATTTCGAATTCCAAAGCACTCACATGTTTTATCCCTTTTATTTATTACGGGATATGCTTTGCTACATTTTCCTCACGACACATTAATACATTATTAATGAGATTGGACTAGTGGCGGGTGCAAAATTATATGGGAAGGGGAAAGATTTTTTTGTTCTTTTTTTTTCAGCCACATTAAAATTATGAACATACACAACCACTTGAGTACTAGCTAATTCCAAACCAATGTTCAAAAAAAACCCAAAAAAAAACCATTATAGACAAACTTAATAAATAGCGTTGGAGAGAGAGAATAAACATGAACATCTAAAAAGGGAAAGGAGAATGAAGAATGAGGAGGAGGAGCCGCTCAGCCCGATGGCTCGTGTATTCCAATCGCCGGACATAGACTTATGTGCCATCATCAACATTGGGTTCAAAACAAAAATTAATCCCGACGTTGTTCTTGATGCTTTGAAGCAAAATGTTTACAAGCATCCTCGTTTCTCCAGCAAACTGGTACCCTCCTATAAATATACCACACATTCTTTACATAGTTATTTTCCATCACTTATATGTGATGCATTCATACATGACATCATTTAGAATTACATATATATGTTTATGTACAGATGGATAAATTGATTTTTTTTTAAAATGAATTATATGTTTGATATATAATTAATTTACCTGATCTCTACACAGTTTTGTCGGCGGCCGTGTTTTTGTAGATATATGTATAAATTTTGCTTAAATCCTACTTGAGATTTGACATGATAGTGTTTTGGTCTCCATCTGTCTTATCTTAATAGTCTGAAAATGGTGAAAAATGGATCGAGACCGAAGTCAATGTAGAAGATCATGTAATCGTACCATACATAGATCCAGAAGATATATGTGAAGGTGGACAAAGCTTCGTCGATGATTATATCTCACGTCTCACATTGATTCCTCTTGATAGATCAAGACCTTTGTGGGACATTCACATCCTTAATGTCAAAACCTCATATGCTGAAGCAGTCGGTGTAATAAGATTTAACCATGCGTTGGCAGATGGAATGTCCTTCATTTCCCTAGTTCTTGCATGTACCCATAAAACATCAAATCCTGACATGTTGTCTACTGCTATTCCTTCGGTGAAACGGCGAAGCACGGTGTCACATAGCCTAAAAAAAACCGGCTGGTTCTTAACGGCAATATTCACCATTGGTTCTACAATGAGACTAATTTGGAATACATTGGTAGATATGTTCTTGCTTTTTGCTACTATGTTGTTTCTGAAGGATACAAAAACACCACTAAAAGGCGGTGCGAATGTCAGGAGCAATCCAAAGACATTTTATCACCGAAATATCTCTCTAGATGACATTAAACTTATCAAGAACGCTATGAACATGGTACGTTAATTGTGATTTATGTTCATAACTCACTTGAGGGTCATTTTCTCTTACCTTTTTAAAGGATATGTGCTTTATCTTCATATATTGCATATGGTGCTAGACTATCAACGATGTTCTACTCGGAATTACACAAGCTGCTCTTTCTAGCTATTTGAACCGACGATATGGTAAACATTAAACTCAATATATTTATATATGATGTATTATTAAGATCCTAACCAGAAGTGGATCAATATACAAAGAAAAGAATAAGCTTATATGATCAATCTATATCTAATTAATATGTTTCACACGCGTATCTTATTATTCTTGAAGAACACGAAAATAATAATGAGGAGGATGGAGTATTGACTTCATATACAAACAATCTTCCAGATCGAATACGATTTCGTGCAGGTTGTACGGTAAACCTAAGGTCAGACATCGGGTTCAAGGTTAGAAACATACTCCTCAAATTATATAATTTGAGCTCTTTCTTATCAACAAACAATATTTATGTAACATATTATTTCTTTCTGTATAAATTAAGCCTTTGGCAGAAATGATGGTCAAGGATTCAAAATGCAGATGGGGAAACTACTTTAGCTTTATTATTTTACCATTATCGATTAGTTTAGAAACCGATCCATTGGTTTATCTAAACAAATCCAAAGCTATGATGGCTCGAACGAAGCACTCTTATCAAGCAGCTCTAACGTATTTTCTTATCAAAATATCCCTAAAAGTGTTAGGAGCTAAGGTAAACAAATTGAGTTTTGTTTGCATATTTGTGGACTATATATAACACTT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