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BaseInfo

ncRNA ID	ath_circ_025417
Species	Arabidopsis thaliana
Class	circRNA
Genome position	5:5346860-5355993[-/-]
Reference genome	TAIR10
Source	PlantcircBase
Method	NA
Type	exonic
Splice junction sequence	CGTGATGAGAGTAGATATAAGCGTTACGCCATGAATAGATGTGATCTCCTGGTTTAAGTTTATCTCTGGAGATTTGGTTTGAGATAAATCCTATCTTCTCATTGAAATATCGATGATCTTGTCCAAAACTGTTCCTGTTCCGAATTCTAGACCACCTCCACGAGTGAAATGAATGACTTTCTCATCTCCTACGTAGACTC
Tissues	root
Exon boundary	Yes-Yes
Splicing signals	AC-CT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	CGTGATGAGAGTAGATATAAGCGTTACGCCATGAATAGATGTGATCTCCTGGTTTAAGTTTATCTCTGGAGATTTGGTTTGAGATAAATCCTATCTTCTCCAGAAAGTGGGAATCCATTTTGATGACTATCTCTCTTCCTAGCTTTGTTATGGTTGTGATTTTATAACCAAAATTTAAAGTCAGCAGCCATATTGTTTTTTTACGTCTGTAGCTGAATGTTTCTTCTTTATTGGCTTTAGTAAAAGGAGTAGTGGTATTAAAATAAGAGAAAATTTGATTTCAGAGTCTTCCCATCTATCTTTGTCAACTTATATCCCCCCTGCACGAACTTTCTTCCCCTACAAGGCAGGAGAAACAGTTATGTGAGTCTACGAAAGTTCCTTTGTCGAATATGTTACTTGTGATCAATATCCATACAGCATAACATAAAATATAGAGTTGGACAATTCAACAAAAGCAGCCGCAGATCCTCTACTTCACAACAACAACTAGGTAAGTTAGTTACTGATAGCTCAGAAAGAGCCAAGAAAGTGTCTTCGTCTTCTACGACGGCATATTCGTGGAAGCAGTTTCATCGATTCCGGCTCACTGAAGCGGCGTCACTCTTAAAACGAAACAACACCTCTGAAGCAGCATAAACCAAAGAACTGCTGGTTTATTTAATCCAGCTGATGACTTTGGTTGGATTCTGTTATATTGTTCTTTCATAATCTAAAGAGTCTTGAAGAGTTCATTTCTTGGACAATTAATGTTACCAAAATTGTATTTCCATTTGATAAATAGTTAAAACACAGTTTTCACAATACAAAACAAAGCAGAAAAGCAAAATCTCTCTTACTCAACAACTAGTGATCAAACAAACATCAATAACGTCAATTAACTAGACTTGTTCTTTTCCATGAGTTCAATAAGGAAAACGAGCCTTTCCACAGGAACCTAATTAACATCGGATCTCATACCAATGTCGGAATGCAAACGATTCATACAATACTTACTATACCCACCAACCAACACCAGACCACCAACTTCCAGAAACGGGAACTACATATCGAAGTGTCGAAGAAAACACAGAAGCAGAAAAGCAAAATCTTTCTTTACTCAAACTAATTAGTCATCAAACATACATAATGCACATACTCGCCGAAAAAAACATACATAATGCAGATCGGTTTTTCTTGTTTTTGGGCATGTGTGCCGTATTAGGCAGTTTATGCCTTGTAAGATTTATAATTATGGGCCTGCGTGCTTTTGTTGGCGTCATGGACCTTGTAATTGTTTGGGTTTAATAGGAAAAAAGAGAGAAAGAAAAAATGTGCTAAGACCATCCTTATTCATGGGTTCTTAATAAAATTCTTAACATTTTTATATATAAAATAATAATTAAATATTAGGAGGCTCTTAATAAGTTAAGAGAATGTATCAAAAATCTCTTATTTAAGAGCCAATTTAACTTTTCTAAGAACTCTTTTCTATTTTTTATTCATATTTTATCTTATATAATATTTTAAGAATTTTTCTAAACTTTTTGAAAACCCATTGATAATGATGCTCTAACACTTCTTGTTCTCCATTATGCATTGCTTGGCTCCTACAAGGCTACAACTACAACAAGCTCTTCCACAGAAACCTAGCAAGTATATATCATTTCTATCACCAATGTCGTAAAACAAGTGACTAATACAGTAGTTACCATATTCCGTCAAAGCCATATTACCAAAACCAGGAAGTGCATATCTAACTATAGAAGAGATAACCTGGTTAGCAACCACCAGCTGCAGTCTGCAGACATCGGACTGGCTTGACCACTAGTCCACTACTTGTAAACTTGGTAACGATCGCTAAAAAAATAACCAAACCAGTTTTGCAATAAATTGCAAAATCTTCACAATATTTGTCTAAAAGATCATACGTACCCACTAAACTCATTTCTCCATAAGGGAAATTAAGACACTTGTTGTCACTTCCTCCAGAATGAAGACATTTTTATACAGAGATGAGGTTAAGGATTGGAAGAAGTAATATTTACTCTCACAGAAATATAGTAACATATGTTTTATGTAGGAAAGCGAAAGCTTGACAATTAGGGTTTAGGTTTTCTGTTTTCTCATTAAAACATTAAAGAATCTAATAAAATGAAACACACTAAAAAAGATTCTTAAACATCTTACATAAGCTCATAGGCAATATATATTTTTAAGAATATTCCAATTTCCAAACAGCGTGAAAACAAATAAACCCCAAACCATTTTGTTACATATAAAGGAAACACATCCCGTATACAATAGATGGATTACAAATATAGATTAAGCCATTGTCCATTGGTACAACATATGCATTCCATAAAATTAGAATCAATGTGATTCGTAATTTTGTGGAACGGTGAAAGAAAGACGTTTAAGAAATTGTCTTATCACCCATCTTCTTTGCAATGTCCCTAAGCACAAACTTCGTAACCTTTCCCGTCGAACTCTTAGGCAACTCATCCATAAACGACACCGTTTTAGGAACCATATACTTGGGCATCTTCTTTCTACAATACTCCATCAATTCCTCCTCCGTAGGTTTCCCACTAAACCCATTTTTCAAACTCACAAACGCACACGGTGTCTCTCCCCAAAACTCATCAGGTCTAGCCACCACCGCCACTTCATTCACCGCCGGAATCGTGTACAACACCGTTTCAACCTCAACACTACTCACATTCTCACCTCCCGTTATAATTATATCTTTCGATCTATCTTTAATCTCTAGATAACCATCGGAATGAATCACACCAACATCTCCGGTGTAAAACCACCCGTTCTTTAAAGCTTTCTCTGTTCCGACCGGATCTTTTAAGTAACCGAGCATGACCGAGCTTCCTCTCATCACAATTTCTCCGACAGTTTCTCCATTTCTCTCAACGCTCAAACCCGATTCAGGATCCACCACGTCGATTTCAGTAAACCCGACGGTTCTCACTCCTTGCCGTGCCTTCAATCTCGCTCGATCGCTTGCCGGTAAATGATTCCATTTTGGCTTCCACGCGCACGAGACGATTACACCGGCGGTTTCCGTTAATCCGTAACCGTGACTGATAACGAAACCAATTGATTCGGCTCGGAGGAGGACGGTAGCTGGAGGCGGAGAACCGGCGGTTAAGATGTTGACGGGATGGTTAAGAGGCTGAGATTCCTGAGTCGCGGATAACATGTTGAGCACCACCGGAGCTCCACACATGTGTGTGACGCCGTGATCACGGATCAGACGGTAGATTAACGGCGCGTCAAATTTACGCAAACAGACGTTAGTTCCTCCGACGGCGGCGATTCCCCATGGATTGGTCCAACCGTTAGAGTGAAATATCGGTAGAGTCCATAAGTAAACCGGATTTTTCGGTACGGCCCAATCAATTAGTGAATCAACTGACATTACGAAAATTCCTCTGTGGCAGTGTACCACTCCTTTAGGAGCTGAAGTCGTACCGGAAGTGTAATTAAGCACAACCGGATCCCATTCGCTTTCGGGTCGGATCCATTTAAAACCCGGATCACCTCTTTCGATAAGATCATCGTAAGTGTAACTGAATTTTGAAAGATCAGCCACGTCAGCAACTCCTCCTTCCTCTTCTTTATCGGCGATGACGACGAGAATCGGCGGATCAGTCGTCATCATCGAGACCGCTTCAACGGCGAGATCAACGGAGAAGACGTCGACGAAAAGAAGCTTAGATTCACAGTGACGGAGAAGAACAGAGACGGTGCGTGCGTCGAGGCGTGTGTTGATGTTGTTGAGGATTGCGCCGGACATGGGAACAGCAAACTGGAGCTCGTACATAGCCGGAGTATTGGGAGAGAGAACAGAGACTACGTCAGACCTGCCGATTCCGATTGAAGACAGAGAAGACGCCACGCGGAGACAACGGAGGTTTGTTTCACGCCACGTGTAAACGGTGTTGCTGCCATAAACGATGGAGGTACAGTCACCGTAAACGGTGGCGGCTCTCTCTAAAAAACCTATCGGCGTCAACGGCGGCGAGTTTGCGGCGCATGGCTTCATTTCCTCCATCTCTTCCTCCTAGTGGTAATCAAAGACTCTACTGTACTGTACTGTTCTTACTGTTTATTATATAATGACATTTTATTTCCAAGTGAACAATCCACGTGATGAAAAATTTGTAAAACAATATTTTGGGTTTAGAAATTGAGAACAAATCTAAACCATTAGCTGGAAATTAATTATCTTCAGCTTCCACCACATTATAATCATAGACATTTGTTACCTACCCTACACAACCACTAGCGTACTAAGTCTTAAACCAATGTTCGAAACTACTAAATATAATTAGATGTTGATTTATAATGTATTGTTATTCGACACCACAACTTTCTTTGTTTGCTGATCGTCACTCAAAGTCACATTAATTGTAATCTTACTATTACGCCAATATAGATTGTTAAACAAACAAACAAAAAAGTTTATAGAGAATAACCTTAAAATATCGCTTAATCTCGTTGCAATATTGTTTGGTGGATCTAAATGTCGTATGTGGTAATTTCAATGTTAAAAACAAATATAATTGGCATATTATCTTTTATGTTGGTATGGTATTTTTCTACACTTTTATAACATGAAATGATTTTTCTTTAGATAATATTGTTAAACTTTGTAAAAGAAATAATGGTTGTAATATTGAAAATGATGTTAATATTTATGTACTATTCTCTTGTTAAACATTCATTTTAATTAGGCTATTCTTAATTAAGTATAGTATGTGATGTTGTTATTAACATTTTTACGATACCAAGATATATTAATTTGTCATTTTTTCCGATATAAATTTGATCATTTGTATAGAATATTTTAAATCTATATATTGAACTTAAATTTTAATGGAAATATTTCTTGGTTTAGTACGTACAGTATATATTATTTAGAGAATTTTTCTGATATCCATCTTTTAGTGACTAACTAATTTACTTCAAAGGTTTTGAATGAATTTTAAAATAAT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