Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gar_miR80
Species Gossypium arboreum
Class miRNA
Genome position Chr13:138950277-138950398 [-]
Reference genome Gossypium_arboreum_v1.0
Source SRR1029586
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 99 - AUGAUAGACUAUGUAUGCAUGACU - 122
Stem-loop(if miRNA) --     A A        -   U  -CUCA     A UG     --   ---AAAAG   GAGU  G
  AUGAU G CUAUGUAU GCA GA     UAUAC U  AUGUA  AGU        CUU    UC A
  ||||| | |||||||| ||| ||     ||||| |  |||||  |||        |||    || A
  UAUUA C GAUGUAUA CGU CU     AUAUG G  UACGU  UCA        GGA    AG A
CU     - -        A   -  UCAAC     - GU     AG   AAAAAUAA   --AU  A
Stem-loop sequence AUGAUAGACUAUGUAUGCAUGACUCAUAUACAUUGAUGUAAGUAAAAGCUUGAGUUCGAAAAGAUAAGGAAUAAAAAACUGAUGCAUUGGGUAUACAACUUCUGCAAUAUGUAGCAUUAUUC