Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_egu_miR777
Species Elaeis guineensis
Class miRNA
Genome position Chr12:27130293-27130428 [-]
Reference genome EG5
Source SRR3042548
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - AGAGAAGACUAGGCAACAGUAGAA - 24
Stem-loop(if miRNA) --   -      --    AA    C  AUC   C           UCGCG A     AA  AAA   C  AC
  CUG UGUUGC  AGUC  UCUC UC   GUU GAUCGUCGGGA     C CCUGC  GA   AUC UC  U
  ||| ||||||  ||||  |||| ||   ||| |||||||||||     | |||||  ||   ||| ||  G
  GAU ACAACG  UCAG  AGAG AG   UAA CUGGCAGCCUU     G GGGCG  CU   UAG AG  A
AA   G      GA    -A    -  -AC   A           --CUA -     GC  CCG   A  CU
Stem-loop sequence CUGUGUUGCAGUCAAUCUCCUCAUCGUUCGAUCGUCGGGAUCGCGCACCUGCAAGAAAAAUCCUCACUGAUCGAAGAUGCCUCCGGCGGGGAUCUUCCGACGGUCAAAUCAGAGAGAAGACUAGGCAACAGUAGAA