Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_egu_miR624
Species Elaeis guineensis
Class miRNA
Genome position Chr1:64554570-64554692 [-]
Reference genome EG5
Source SRR3042545
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - AGUCUGUAUGUAGAUCAAGAUGGG - 24
Stem-loop(if miRNA) --   AG         A   -   -   -U      UGGU    G   AUC   A      AUA
  UAU  UGAUUUACA GCA ACU CAC  GUGCUU    GCUG ACC   UGG UUUCUA   U
  |||  ||||||||| ||| ||| |||  ||||||    |||| |||   ||| ||||||   A
  GUA  ACUAGAUGU UGU UGA GUG  CAUGAA    UGAC UGG   AUC GGAGGU   G
GG   GA         A   C   A   UU      ---C    A   GUC   G      AGU
Stem-loop sequence UAUAGUGAUUUACAAGCAACUCACUGUGCUUUGGUGCUGGACCAUCUGGAUUUCUAAUAUAGUGAUGGAGGGCUACUGGGUACAGUCAAGUACUUGUGAAGUCUGUAUGUAGAUCAAGAUGGG